MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 6723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014220	AGG	2	6	2123063	2123068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_014220	AGCTT	2	10	2123088	2123097	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6003	NC_014220	A	6	6	2123106	2123111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_014220	TAA	2	6	2124181	2124186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_014220	AGG	2	6	2124284	2124289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_014220	C	6	6	2125085	2125090	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6007	NC_014220	AGTC	2	8	2125957	2125964	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6008	NC_014220	GCC	2	6	2127190	2127195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6009	NC_014220	TCG	2	6	2127233	2127238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_014220	AAG	2	6	2127253	2127258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_014220	CG	3	6	2127312	2127317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6012	NC_014220	TTTC	2	8	2127342	2127349	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6013	NC_014220	TA	3	6	2127427	2127432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_014220	GC	3	6	2127453	2127458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6015	NC_014220	CG	3	6	2127534	2127539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6016	NC_014220	GTAC	2	8	2127545	2127552	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6017	NC_014220	TAAA	2	8	2127678	2127685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_014220	A	6	6	2127683	2127688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_014220	CCT	2	6	2128202	2128207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6020	NC_014220	TA	3	6	2128247	2128252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_014220	GGA	2	6	2128323	2128328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_014220	CTT	2	6	2128389	2128394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_014220	TGCA	2	8	2128421	2128428	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6024	NC_014220	AAC	2	6	2128563	2128568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_014220	CCT	2	6	2129432	2129437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6026	NC_014220	CCT	2	6	2130863	2130868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6027	NC_014220	CTG	2	6	2130869	2130874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_014220	CTT	2	6	2130918	2130923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_014220	GAA	2	6	2130960	2130965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_014220	AAAG	2	8	2130971	2130978	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_014220	CTA	2	6	2131006	2131011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_014220	GT	3	6	2131039	2131044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_014220	TC	3	6	2131069	2131074	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6034	NC_014220	TGG	2	6	2131108	2131113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_014220	TG	3	6	2131212	2131217	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_014220	CAG	2	6	2131350	2131355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_014220	TCGC	2	8	2131754	2131761	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6038	NC_014220	GTA	2	6	2131816	2131821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_014220	CAG	2	6	2131891	2131896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_014220	CTTT	2	8	2131991	2131998	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6041	NC_014220	AC	3	6	2132000	2132005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6042	NC_014220	CCA	2	6	2132007	2132012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6043	NC_014220	AAG	2	6	2132087	2132092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_014220	CAG	2	6	2132138	2132143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_014220	GCT	2	6	2132313	2132318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_014220	ACGT	2	8	2132363	2132370	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6047	NC_014220	A	6	6	2132371	2132376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_014220	CTT	2	6	2132433	2132438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_014220	GAT	2	6	2132451	2132456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_014220	CGC	2	6	2132540	2132545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6051	NC_014220	CA	3	6	2132605	2132610	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6052	NC_014220	TCA	2	6	2132627	2132632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_014220	ATT	2	6	2132660	2132665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_014220	GAAT	2	8	2132671	2132678	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_014220	A	7	7	2132715	2132721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_014220	A	6	6	2132767	2132772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_014220	CTT	2	6	2136188	2136193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_014220	CCT	2	6	2138522	2138527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6059	NC_014220	GT	3	6	2138535	2138540	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_014220	CCG	2	6	2138619	2138624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6061	NC_014220	TAA	2	6	2138637	2138642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_014220	GAC	2	6	2138677	2138682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_014220	TTA	2	6	2138692	2138697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_014220	A	7	7	2138745	2138751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_014220	TCCC	2	8	2141065	2141072	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6066	NC_014220	TAT	2	6	2141115	2141120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_014220	CAA	2	6	2141142	2141147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_014220	CTT	2	6	2141161	2141166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_014220	CAA	2	6	2142925	2142930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_014220	CA	3	6	2142999	2143004	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6071	NC_014220	AACA	2	8	2143170	2143177	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6072	NC_014220	TG	3	6	2143200	2143205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_014220	CCCT	2	8	2144791	2144798	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6074	NC_014220	TC	4	8	2144820	2144827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6075	NC_014220	TAT	2	6	2144922	2144927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_014220	TCT	2	6	2145058	2145063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_014220	CAG	2	6	2145159	2145164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_014220	ATA	3	9	2145189	2145197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_014220	TCGC	2	8	2145238	2145245	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6080	NC_014220	AGG	2	6	2145368	2145373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_014220	ATAG	2	8	2145432	2145439	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_014220	TG	3	6	2147482	2147487	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_014220	T	6	6	2148789	2148794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_014220	TG	3	6	2148803	2148808	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_014220	A	6	6	2149364	2149369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_014220	TCA	2	6	2149403	2149408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_014220	TGC	2	6	2149415	2149420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_014220	CCTC	2	8	2149732	2149739	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6089	NC_014220	ATT	2	6	2149802	2149807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_014220	ATC	2	6	2149813	2149818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_014220	GAT	2	6	2149819	2149824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_014220	GGTT	2	8	2149828	2149835	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_014220	TGAT	2	8	2149866	2149873	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_014220	GA	3	6	2149887	2149892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_014220	TGC	3	9	2149893	2149901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_014220	ATC	2	6	2149993	2149998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_014220	GAGG	2	8	2150003	2150010	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_014220	CCA	2	6	2150311	2150316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6099	NC_014220	CA	3	6	2150362	2150367	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6100	NC_014220	CAT	2	6	2150393	2150398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_014220	CAT	2	6	2150408	2150413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_014220	ATT	2	6	2150449	2150454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_014220	AGA	2	6	2150479	2150484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_014220	GGT	2	6	2150485	2150490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_014220	AGAT	2	8	2150517	2150524	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_014220	TC	3	6	2150557	2150562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6107	NC_014220	GCT	2	6	2150645	2150650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_014220	AGC	2	6	2150713	2150718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_014220	GCC	2	6	2150741	2150746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6110	NC_014220	TACG	2	8	2150770	2150777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6111	NC_014220	ATGG	2	8	2150806	2150813	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_014220	GTCTT	2	10	2150823	2150832	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6113	NC_014220	CCT	2	6	2150890	2150895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6114	NC_014220	CGC	3	9	2150896	2150904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6115	NC_014220	CT	3	6	2150982	2150987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6116	NC_014220	ATTAA	2	10	2151053	2151062	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_014220	GTA	2	6	2151065	2151070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_014220	T	6	6	2151124	2151129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_014220	TGC	2	6	2151160	2151165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_014220	T	6	6	2151173	2151178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_014220	TA	3	6	2151182	2151187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_014220	GAA	2	6	2151215	2151220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_014220	ATC	2	6	2151254	2151259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_014220	CCA	2	6	2151276	2151281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6125	NC_014220	GCT	2	6	2151344	2151349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_014220	GGCC	2	8	2151418	2151425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6127	NC_014220	CCA	2	6	2151444	2151449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6128	NC_014220	TGGC	2	8	2151506	2151513	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6129	NC_014220	TAG	2	6	2151579	2151584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_014220	TCC	2	6	2151591	2151596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6131	NC_014220	CT	3	6	2151655	2151660	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6132	NC_014220	AGA	2	6	2151681	2151686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_014220	TC	3	6	2151687	2151692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6134	NC_014220	AAACC	2	10	2151865	2151874	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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6262	NC_014220	TC	3	6	2208401	2208406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6263	NC_014220	GAAA	2	8	2208418	2208425	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6266	NC_014220	ATG	2	6	2208502	2208507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6267	NC_014220	ATT	2	6	2208515	2208520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6268	NC_014220	GTCTG	2	10	2208602	2208611	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6269	NC_014220	ACC	2	6	2209642	2209647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6270	NC_014220	TGC	2	6	2209660	2209665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6271	NC_014220	CTA	2	6	2209727	2209732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6272	NC_014220	CT	3	6	2209812	2209817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6273	NC_014220	CAA	2	6	2209910	2209915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6274	NC_014220	ATA	2	6	2209925	2209930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6275	NC_014220	A	6	6	2209933	2209938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6276	NC_014220	CA	3	6	2209942	2209947	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6279	NC_014220	TAC	2	6	2212071	2212076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6280	NC_014220	TAC	2	6	2212084	2212089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6281	NC_014220	TTAGT	2	10	2212091	2212100	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6282	NC_014220	TTG	2	6	2212113	2212118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6283	NC_014220	T	7	7	2212139	2212145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6286	NC_014220	CTG	3	9	2213501	2213509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6301	NC_014220	TAA	2	6	2219962	2219967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6309	NC_014220	ATG	2	6	2222261	2222266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6311	NC_014220	CCCT	2	8	2223653	2223660	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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6321	NC_014220	AT	3	6	2225024	2225029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6322	NC_014220	AAG	2	6	2225046	2225051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6399	NC_014220	AGA	2	6	2269360	2269365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6400	NC_014220	TCG	2	6	2272830	2272835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6402	NC_014220	GCT	2	6	2272907	2272912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6432	NC_014220	CTG	2	6	2277800	2277805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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