MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylothermus hellenicus DSM 12710 chromosome

Total Repeats: 5444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014205	TA	3	6	813012	813017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_014205	TCA	2	6	813038	813043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_014205	CCT	2	6	813045	813050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_014205	TAAT	2	8	813128	813135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_014205	TAT	2	6	813154	813159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_014205	AT	3	6	813166	813171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_014205	GT	3	6	813206	813211	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_014205	TTG	2	6	813218	813223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_014205	ACT	2	6	813226	813231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_014205	ATT	2	6	813232	813237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_014205	ATT	2	6	813284	813289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_014205	ATT	2	6	813517	813522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_014205	TGA	2	6	813547	813552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_014205	AT	4	8	813604	813611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_014205	TTC	2	6	813617	813622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_014205	ACA	2	6	813693	813698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_014205	TAT	2	6	813757	813762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_014205	TCA	2	6	813848	813853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_014205	TTA	2	6	813889	813894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_014205	CA	3	6	813939	813944	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3021	NC_014205	TAT	2	6	813996	814001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_014205	AAACAA	2	12	814033	814044	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3023	NC_014205	AAT	2	6	814061	814066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_014205	AAT	2	6	814099	814104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_014205	GATT	2	8	814190	814197	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_014205	TAATA	2	10	814242	814251	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_014205	TAA	2	6	814346	814351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_014205	ACT	2	6	814398	814403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_014205	TTAA	2	8	814454	814461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_014205	TA	3	6	814547	814552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_014205	T	6	6	814731	814736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_014205	AC	3	6	814757	814762	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3033	NC_014205	GGA	2	6	814763	814768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_014205	GGT	2	6	814769	814774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_014205	ACT	2	6	815333	815338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_014205	TG	3	6	815373	815378	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_014205	AGG	2	6	815414	815419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_014205	TCA	2	6	815437	815442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_014205	ATT	2	6	815517	815522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_014205	TAG	2	6	815535	815540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_014205	AAT	2	6	815720	815725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_014205	TAT	2	6	815726	815731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_014205	TGCAT	2	10	815763	815772	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3044	NC_014205	CTTTT	2	10	815790	815799	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3045	NC_014205	ATCC	2	8	815833	815840	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3046	NC_014205	ATA	2	6	815896	815901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_014205	TA	4	8	815916	815923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_014205	ATA	2	6	815977	815982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_014205	AAT	2	6	816034	816039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_014205	AAT	2	6	816051	816056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_014205	ATA	2	6	816063	816068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_014205	TGTT	2	8	816082	816089	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_014205	A	6	6	816107	816112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_014205	AAT	2	6	816128	816133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_014205	TTTA	2	8	816613	816620	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_014205	TA	3	6	816626	816631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_014205	AC	3	6	817599	817604	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3058	NC_014205	AAT	2	6	817616	817621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_014205	CCA	2	6	817623	817628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3060	NC_014205	ATAA	2	8	817652	817659	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_014205	TA	3	6	817697	817702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_014205	GTG	2	6	817707	817712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_014205	AG	3	6	819230	819235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_014205	CAAC	2	8	822917	822924	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3065	NC_014205	ACCAC	2	10	822925	822934	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
3066	NC_014205	TAGAT	2	10	822946	822955	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_014205	ATAAA	2	10	822973	822982	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_014205	TCA	2	6	823001	823006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_014205	ATCA	2	8	823052	823059	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3070	NC_014205	A	6	6	823059	823064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_014205	TAT	2	6	823109	823114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_014205	GAA	2	6	823336	823341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_014205	TCTAG	2	10	823357	823366	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3074	NC_014205	GTT	2	6	823429	823434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_014205	AAT	2	6	824103	824108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_014205	AAC	2	6	824190	824195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_014205	ATT	2	6	824244	824249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_014205	TAT	2	6	824262	824267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_014205	TAAAA	2	10	825987	825996	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_014205	T	6	6	826003	826008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_014205	AGG	3	9	826051	826059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_014205	TAAC	2	8	829967	829974	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3083	NC_014205	TAT	2	6	829977	829982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_014205	AG	3	6	830006	830011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_014205	TAA	2	6	830047	830052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_014205	ATACGT	2	12	830066	830077	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3087	NC_014205	AT	3	6	830079	830084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_014205	GAG	2	6	830411	830416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_014205	TCT	2	6	830489	830494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_014205	AGA	2	6	830519	830524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_014205	AGA	2	6	830556	830561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_014205	AT	3	6	830619	830624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_014205	ACGT	2	8	830728	830735	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3094	NC_014205	CAG	2	6	830746	830751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_014205	TAA	2	6	830791	830796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_014205	ACA	2	6	830824	830829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_014205	AT	3	6	830855	830860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_014205	TAA	2	6	830886	830891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_014205	ATT	2	6	830904	830909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_014205	GAT	2	6	832300	832305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_014205	TGA	2	6	832721	832726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_014205	TAT	2	6	832739	832744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_014205	CTAT	2	8	832782	832789	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3104	NC_014205	GAG	2	6	832868	832873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_014205	AAC	2	6	832911	832916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_014205	TGA	2	6	833010	833015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_014205	AAT	2	6	833041	833046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_014205	GT	3	6	833052	833057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_014205	GAA	2	6	833059	833064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_014205	GAA	2	6	833566	833571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_014205	GATA	2	8	837903	837910	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_014205	GAT	2	6	837912	837917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_014205	AAT	3	9	837922	837930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_014205	TCT	2	6	837939	837944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_014205	TCAT	2	8	837994	838001	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3116	NC_014205	CAT	2	6	838019	838024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_014205	ATA	2	6	838034	838039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_014205	TTGA	2	8	838060	838067	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_014205	ATA	2	6	838086	838091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_014205	TAAT	2	8	838110	838117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_014205	ATT	2	6	838118	838123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_014205	CTC	2	6	838531	838536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3123	NC_014205	ATT	2	6	838544	838549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_014205	TAATT	2	10	846149	846158	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_014205	TA	3	6	846217	846222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_014205	GA	3	6	846270	846275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_014205	CA	3	6	848749	848754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3128	NC_014205	CAA	2	6	848785	848790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_014205	ATA	2	6	848806	848811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_014205	ATT	2	6	848820	848825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_014205	TAT	2	6	849618	849623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_014205	AAGTT	2	10	849649	849658	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_014205	ACAT	2	8	849673	849680	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3134	NC_014205	GCTG	2	8	849752	849759	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3135	NC_014205	CAA	2	6	850403	850408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3136	NC_014205	ATA	2	6	852902	852907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_014205	AC	3	6	853018	853023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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