MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylothermus hellenicus DSM 12710 chromosome

Total Repeats: 5444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014205	T	6	6	431490	431495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_014205	GTG	2	6	431496	431501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_014205	TTCT	2	8	432650	432657	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1504	NC_014205	TA	3	6	432669	432674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_014205	TTG	2	6	432680	432685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_014205	TAT	2	6	432692	432697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_014205	TTCT	2	8	432716	432723	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1508	NC_014205	TGT	2	6	432725	432730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_014205	CAAACC	2	12	432739	432750	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_014205	TTCT	2	8	432783	432790	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1511	NC_014205	TGT	2	6	432792	432797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_014205	T	6	6	432830	432835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_014205	GAA	2	6	432840	432845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_014205	TA	3	6	432847	432852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_014205	ATTG	2	8	432927	432934	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_014205	TA	3	6	432960	432965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_014205	TAT	2	6	432993	432998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_014205	TAT	3	9	433007	433015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_014205	TGG	2	6	433017	433022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_014205	AGAA	2	8	433058	433065	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_014205	ACT	2	6	434253	434258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_014205	TTTTA	2	10	434285	434294	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_014205	ATT	2	6	434338	434343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_014205	CAT	2	6	435077	435082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_014205	ACC	2	6	435131	435136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1526	NC_014205	AAAT	2	8	435147	435154	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_014205	AGA	2	6	435159	435164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_014205	ATT	2	6	435203	435208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_014205	AT	3	6	435215	435220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_014205	TAA	2	6	435310	435315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_014205	ACCT	2	8	435339	435346	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_014205	GAG	2	6	435354	435359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_014205	ATA	2	6	435370	435375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_014205	CT	3	6	435404	435409	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1535	NC_014205	ATTT	2	8	435430	435437	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_014205	T	6	6	435460	435465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_014205	GAA	2	6	435540	435545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_014205	GAG	2	6	435575	435580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_014205	AAT	2	6	435582	435587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_014205	A	7	7	435604	435610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_014205	TAGG	2	8	435616	435623	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_014205	TTG	2	6	435632	435637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_014205	GTA	2	6	435645	435650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_014205	GCT	2	6	435724	435729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_014205	AAGT	2	8	435751	435758	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_014205	TTTA	2	8	435763	435770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_014205	TCT	2	6	435797	435802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_014205	AAC	2	6	435809	435814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_014205	GAT	2	6	435831	435836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_014205	GA	3	6	435837	435842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_014205	AGG	2	6	435843	435848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_014205	AATT	2	8	435859	435866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_014205	ATG	3	9	435907	435915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_014205	TAA	2	6	435937	435942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_014205	AAAGCA	2	12	435975	435986	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1556	NC_014205	ACA	2	6	435990	435995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_014205	GTT	3	9	436013	436021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_014205	ATA	2	6	436027	436032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_014205	TCA	2	6	436038	436043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_014205	AAG	2	6	436518	436523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_014205	TA	4	8	436882	436889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_014205	AAC	2	6	438732	438737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_014205	ATT	2	6	438759	438764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_014205	AT	3	6	438768	438773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_014205	GCCT	2	8	438870	438877	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1566	NC_014205	GGA	2	6	438988	438993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_014205	T	6	6	439009	439014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_014205	TCCA	2	8	440315	440322	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1569	NC_014205	CTA	2	6	441589	441594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_014205	AT	3	6	441662	441667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_014205	TCC	2	6	443480	443485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1572	NC_014205	CATAT	2	10	444411	444420	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1573	NC_014205	AAT	2	6	444421	444426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_014205	ATAA	3	12	444437	444448	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_014205	TAAAT	2	10	444482	444491	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_014205	TA	3	6	444503	444508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_014205	AAT	2	6	444510	444515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_014205	ATT	2	6	444540	444545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_014205	T	6	6	444544	444549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_014205	AGT	2	6	444551	444556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_014205	GAA	2	6	449341	449346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_014205	AT	3	6	449363	449368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_014205	TCT	2	6	449487	449492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_014205	AT	3	6	449494	449499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_014205	ACA	2	6	449545	449550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_014205	TCA	2	6	449599	449604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_014205	AATT	2	8	449675	449682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_014205	GA	3	6	449733	449738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_014205	AAG	2	6	450021	450026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_014205	AT	3	6	450062	450067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_014205	TTTG	2	8	450081	450088	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_014205	TGT	2	6	450091	450096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_014205	CT	3	6	453572	453577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1594	NC_014205	TCC	2	6	453581	453586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1595	NC_014205	TCA	2	6	453598	453603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_014205	ATC	2	6	453604	453609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_014205	TC	3	6	453626	453631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1598	NC_014205	TCT	2	6	453644	453649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_014205	TCT	2	6	453660	453665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_014205	AAG	2	6	453666	453671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_014205	TCT	2	6	453672	453677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_014205	TA	3	6	453696	453701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_014205	AAG	2	6	453711	453716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_014205	TTG	2	6	453745	453750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_014205	TTA	2	6	453776	453781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_014205	TAT	2	6	454228	454233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_014205	AGCTT	2	10	456463	456472	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1608	NC_014205	AT	3	6	456498	456503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_014205	AAAT	2	8	456504	456511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_014205	CTT	2	6	456519	456524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_014205	CAC	2	6	456534	456539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1612	NC_014205	TA	3	6	456557	456562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_014205	TTG	2	6	456616	456621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_014205	TTA	2	6	456625	456630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_014205	CT	3	6	456645	456650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1616	NC_014205	GGA	2	6	456670	456675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_014205	TCA	2	6	456765	456770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_014205	AT	3	6	456816	456821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_014205	AGA	2	6	457053	457058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_014205	ATG	2	6	457062	457067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_014205	AT	3	6	457120	457125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_014205	ATC	2	6	457131	457136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_014205	TAAT	2	8	457139	457146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_014205	TCT	2	6	457224	457229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_014205	CTA	2	6	457236	457241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_014205	TAT	2	6	457267	457272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_014205	TTA	2	6	457275	457280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_014205	ATT	2	6	457286	457291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_014205	TATAA	2	10	457301	457310	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_014205	CCT	2	6	457315	457320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1631	NC_014205	TA	3	6	457393	457398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_014205	CTT	2	6	457623	457628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_014205	ATT	2	6	458862	458867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_014205	AAC	2	6	458926	458931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_014205	TAT	2	6	458981	458986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_014205	ATT	2	6	459018	459023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2000	NC_014205	GAA	2	6	540677	540682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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