MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Staphylothermus hellenicus DSM 12710 chromosome

Total Repeats: 5444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014205	AAT	2	6	119839	119844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_014205	A	6	6	119850	119855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_014205	TAC	2	6	119863	119868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_014205	AGCT	2	8	128310	128317	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
505	NC_014205	TAT	2	6	128325	128330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_014205	TAA	2	6	128351	128356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_014205	AGA	2	6	128409	128414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_014205	CCCT	2	8	129433	129440	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
509	NC_014205	TCT	2	6	129443	129448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_014205	CTT	2	6	131524	131529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_014205	TAT	2	6	131536	131541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_014205	ATA	2	6	131569	131574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_014205	ATT	2	6	131609	131614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_014205	AGCTA	2	10	131647	131656	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
515	NC_014205	ATGAAA	2	12	135052	135063	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_014205	AAT	2	6	135074	135079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_014205	T	6	6	135190	135195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_014205	TA	3	6	135270	135275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_014205	TTC	2	6	135285	135290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_014205	CTT	2	6	135332	135337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_014205	TTC	2	6	135357	135362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_014205	TAT	2	6	135397	135402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_014205	TA	3	6	135412	135417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_014205	CAT	3	9	140177	140185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_014205	ATT	2	6	140203	140208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_014205	CCA	2	6	141323	141328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_014205	CTC	2	6	141344	141349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_014205	TAAA	2	8	141375	141382	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_014205	AAT	2	6	141433	141438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_014205	TGG	2	6	141502	141507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_014205	C	6	6	141559	141564	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
532	NC_014205	AAC	2	6	141584	141589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_014205	GTT	3	9	141612	141620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_014205	ATAA	2	8	141638	141645	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_014205	TAGA	2	8	141650	141657	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
536	NC_014205	TAG	3	9	141715	141723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_014205	CTTGTT	2	12	141740	141751	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
538	NC_014205	TTCT	2	8	143303	143310	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
539	NC_014205	AG	3	6	143325	143330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
540	NC_014205	AGA	2	6	143336	143341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_014205	TA	3	6	143383	143388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_014205	T	6	6	144755	144760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_014205	ATTT	2	8	144761	144768	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_014205	T	7	7	144766	144772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_014205	GTTTA	2	10	144848	144857	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
546	NC_014205	TATG	2	8	144870	144877	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
547	NC_014205	TAA	2	6	144884	144889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_014205	AAAT	2	8	144890	144897	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_014205	AAT	2	6	144915	144920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_014205	GAA	2	6	144939	144944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_014205	AT	3	6	144993	144998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_014205	AAT	2	6	144999	145004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_014205	TA	3	6	145014	145019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_014205	CAT	2	6	145100	145105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_014205	T	6	6	145107	145112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_014205	TTC	2	6	145164	145169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_014205	GAT	2	6	146045	146050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_014205	TCC	2	6	146073	146078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_014205	CCA	2	6	147849	147854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_014205	ATC	2	6	147897	147902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_014205	AATA	2	8	147917	147924	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_014205	TAT	2	6	147959	147964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_014205	TGG	2	6	147971	147976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_014205	ATA	2	6	150187	150192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_014205	TA	3	6	150211	150216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_014205	CTT	2	6	150221	150226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_014205	TA	3	6	150238	150243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_014205	AT	3	6	155067	155072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_014205	TTA	2	6	155073	155078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_014205	ATT	2	6	155082	155087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_014205	T	6	6	155091	155096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_014205	AATA	2	8	155100	155107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_014205	ATT	2	6	155111	155116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_014205	ATT	2	6	155123	155128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_014205	TTA	2	6	156329	156334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_014205	GCA	2	6	156363	156368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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578	NC_014205	TAAAC	2	10	156919	156928	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
579	NC_014205	TAAT	2	8	156940	156947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_014205	C	6	6	157043	157048	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
581	NC_014205	CAC	2	6	157050	157055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_014205	AAC	2	6	157056	157061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_014205	TTC	2	6	157073	157078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_014205	ATAA	2	8	157239	157246	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_014205	ACT	2	6	157309	157314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_014205	TAA	2	6	157327	157332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_014205	GTT	2	6	157333	157338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_014205	A	6	6	157356	157361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_014205	ATA	2	6	157374	157379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_014205	GCT	2	6	157432	157437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_014205	CTT	2	6	157798	157803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_014205	TAA	2	6	157906	157911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_014205	ATA	3	9	157962	157970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_014205	TAA	2	6	158018	158023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_014205	TAT	2	6	158152	158157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_014205	TC	3	6	158159	158164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
597	NC_014205	CTT	2	6	158177	158182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_014205	TA	3	6	158207	158212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_014205	ATA	2	6	158226	158231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_014205	T	6	6	158418	158423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_014205	TCCT	2	8	158442	158449	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
602	NC_014205	TC	3	6	158484	158489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_014205	AATA	2	8	158509	158516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_014205	AAT	2	6	158520	158525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_014205	ATA	2	6	158604	158609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_014205	TTC	2	6	158968	158973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_014205	TCC	2	6	158981	158986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_014205	TAAAA	2	10	159014	159023	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_014205	TATGTT	2	12	159061	159072	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_014205	AT	3	6	159082	159087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_014205	AAT	2	6	159113	159118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_014205	GGGA	2	8	159119	159126	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
613	NC_014205	TCC	2	6	159925	159930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_014205	ATT	2	6	159931	159936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_014205	ATT	2	6	159952	159957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_014205	TAA	2	6	159971	159976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_014205	ATT	2	6	160948	160953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_014205	GA	3	6	160957	160962	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
619	NC_014205	TA	3	6	161303	161308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_014205	TGTT	2	8	161311	161318	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
621	NC_014205	TTG	2	6	161322	161327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_014205	TGA	3	9	161332	161340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_014205	C	6	6	161434	161439	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
624	NC_014205	G	6	6	161464	161469	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
625	NC_014205	TTG	2	6	161487	161492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_014205	GGA	2	6	161590	161595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
627	NC_014205	TGAGCG	2	12	161608	161619	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
628	NC_014205	AGC	2	6	161623	161628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_014205	TAC	2	6	161697	161702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_014205	GA	3	6	161747	161752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
631	NC_014205	AGC	2	6	161812	161817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_014205	CAA	2	6	161886	161891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_014205	TAG	2	6	161922	161927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_014205	AT	3	6	161941	161946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_014205	GAA	2	6	162050	162055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_014205	GAA	2	6	162070	162075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_014205	AGA	2	6	162082	162087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_014205	A	6	6	162091	162096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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640	NC_014205	AGA	2	6	162127	162132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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971	NC_014205	ATA	2	6	237529	237534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
972	NC_014205	AT	3	6	237545	237550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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