MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Staphylothermus hellenicus DSM 12710 chromosome

Total Repeats: 5444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_014205	CGC	2	6	1443390	1443395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5003	NC_014205	C	6	6	1443398	1443403	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5004	NC_014205	TGG	2	6	1443433	1443438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_014205	G	6	6	1443466	1443471	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_014205	ACC	2	6	1443498	1443503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5007	NC_014205	C	6	6	1443508	1443513	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5008	NC_014205	CCA	2	6	1443515	1443520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_014205	AACCA	2	10	1443531	1443540	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5010	NC_014205	GCT	2	6	1443592	1443597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_014205	CTC	2	6	1443606	1443611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_014205	GCG	2	6	1443669	1443674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_014205	AGC	2	6	1443675	1443680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_014205	GGC	2	6	1443729	1443734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_014205	ACTAT	2	10	1444877	1444886	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5016	NC_014205	AT	4	8	1444921	1444928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_014205	GGT	2	6	1444947	1444952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_014205	TGG	2	6	1446924	1446929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_014205	CCGG	2	8	1446931	1446938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5020	NC_014205	CT	3	6	1446961	1446966	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5021	NC_014205	TAG	2	6	1446990	1446995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_014205	GCG	2	6	1447009	1447014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_014205	CCT	2	6	1447048	1447053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_014205	AAT	2	6	1447054	1447059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_014205	TA	3	6	1447080	1447085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_014205	TAA	2	6	1447129	1447134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_014205	TAA	2	6	1447201	1447206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_014205	TAG	2	6	1447214	1447219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_014205	AT	3	6	1447273	1447278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_014205	AT	3	6	1451051	1451056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_014205	AT	3	6	1451059	1451064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_014205	AAAG	2	8	1451125	1451132	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_014205	AAT	2	6	1452199	1452204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_014205	TAA	2	6	1452209	1452214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_014205	AGG	2	6	1452221	1452226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_014205	TAG	2	6	1453785	1453790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5038	NC_014205	TTG	2	6	1455846	1455851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_014205	TAT	2	6	1455945	1455950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_014205	T	6	6	1456763	1456768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_014205	ATC	2	6	1456779	1456784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_014205	TAT	2	6	1456785	1456790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_014205	AT	3	6	1456796	1456801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_014205	TCCT	2	8	1456818	1456825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5045	NC_014205	ATT	2	6	1456858	1456863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_014205	AAGT	2	8	1456864	1456871	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5048	NC_014205	TAT	2	6	1458862	1458867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_014205	TAA	2	6	1458906	1458911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_014205	TCAT	2	8	1458916	1458923	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5051	NC_014205	ATTTT	2	10	1459602	1459611	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_014205	TTC	2	6	1459638	1459643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_014205	CTAAT	2	10	1459656	1459665	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5054	NC_014205	TA	3	6	1459679	1459684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_014205	AAT	2	6	1459690	1459695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5061	NC_014205	TAAT	2	8	1464480	1464487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_014205	TTA	2	6	1464495	1464500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_014205	ATG	2	6	1464516	1464521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5068	NC_014205	ATT	2	6	1465331	1465336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_014205	ATT	2	6	1465361	1465366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_014205	ATA	2	6	1466691	1466696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5075	NC_014205	TAGAA	2	10	1466864	1466873	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5082	NC_014205	TGA	2	6	1466975	1466980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5088	NC_014205	AT	3	6	1468897	1468902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_014205	AAT	2	6	1468933	1468938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_014205	GGT	2	6	1469011	1469016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5092	NC_014205	TTTTA	2	10	1469048	1469057	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_014205	AAT	2	6	1469064	1469069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_014205	AATA	2	8	1469115	1469122	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_014205	ATA	2	6	1469127	1469132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5097	NC_014205	TAA	2	6	1470228	1470233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_014205	AT	3	6	1470237	1470242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_014205	TA	3	6	1470252	1470257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_014205	TCAT	2	8	1470291	1470298	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5102	NC_014205	ATC	2	6	1474652	1474657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_014205	TA	3	6	1474686	1474691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_014205	TTAT	2	8	1474696	1474703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_014205	TA	3	6	1474708	1474713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_014205	TA	3	6	1474738	1474743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_014205	TA	4	8	1474746	1474753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_014205	AT	3	6	1474761	1474766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_014205	TTC	2	6	1475853	1475858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5111	NC_014205	ATTT	2	8	1475885	1475892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_014205	ATT	2	6	1475897	1475902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_014205	ATAA	2	8	1476009	1476016	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_014205	ATAA	2	8	1476080	1476087	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_014205	GAA	2	6	1476097	1476102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_014205	ATA	2	6	1476103	1476108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_014205	ATA	2	6	1476112	1476117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_014205	A	6	6	1476117	1476122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_014205	GGT	2	6	1476148	1476153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_014205	AT	3	6	1480657	1480662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_014205	TAA	2	6	1481210	1481215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_014205	ACT	2	6	1481232	1481237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_014205	TATCTT	2	12	1482533	1482544	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5124	NC_014205	CTA	2	6	1482547	1482552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_014205	AT	3	6	1485798	1485803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_014205	AT	3	6	1485814	1485819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_014205	TTG	2	6	1485844	1485849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_014205	ACC	2	6	1486254	1486259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5129	NC_014205	GGT	2	6	1486285	1486290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_014205	TAA	2	6	1486647	1486652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_014205	TA	3	6	1489406	1489411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5133	NC_014205	AT	3	6	1489491	1489496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5397	NC_014205	ATT	2	6	1561427	1561432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5398	NC_014205	ATT	2	6	1562093	1562098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5399	NC_014205	ACC	2	6	1562325	1562330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5400	NC_014205	TAAA	2	8	1565871	1565878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5401	NC_014205	A	7	7	1565897	1565903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5402	NC_014205	TAT	2	6	1565908	1565913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5403	NC_014205	TATC	2	8	1565948	1565955	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5404	NC_014205	GAG	2	6	1566007	1566012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5405	NC_014205	AGG	2	6	1566043	1566048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5406	NC_014205	ATC	2	6	1566059	1566064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5407	NC_014205	TCA	2	6	1566094	1566099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5408	NC_014205	TATG	2	8	1566107	1566114	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5409	NC_014205	TAA	2	6	1566119	1566124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5410	NC_014205	TA	4	8	1566126	1566133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5411	NC_014205	AAG	2	6	1566134	1566139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5412	NC_014205	CG	3	6	1566165	1566170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5413	NC_014205	ATT	2	6	1566235	1566240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5414	NC_014205	AT	3	6	1566289	1566294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5415	NC_014205	GTT	2	6	1566730	1566735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5417	NC_014205	GAA	2	6	1568283	1568288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5419	NC_014205	TAT	2	6	1568928	1568933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5420	NC_014205	AT	3	6	1569030	1569035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5421	NC_014205	GGA	2	6	1569044	1569049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5422	NC_014205	ATG	2	6	1569624	1569629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5423	NC_014205	TCTCA	2	10	1570080	1570089	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5424	NC_014205	ATT	2	6	1570140	1570145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5425	NC_014205	TAA	2	6	1570930	1570935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5426	NC_014205	GAT	2	6	1574862	1574867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5427	NC_014205	AT	4	8	1578673	1578680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5428	NC_014205	AT	3	6	1578727	1578732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5429	NC_014205	TA	3	6	1578782	1578787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5430	NC_014205	TTAA	2	8	1578802	1578809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5431	NC_014205	TGG	2	6	1578854	1578859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5432	NC_014205	CCGG	2	8	1578861	1578868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5433	NC_014205	T	6	6	1578952	1578957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5434	NC_014205	ATTG	2	8	1579003	1579010	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5437	NC_014205	TCT	2	6	1579124	1579129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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