MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Segniliparus rotundus DSM 44985 chromosome

Total Repeats: 7138

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014168	CGG	2	6	455913	455918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_014168	TGC	2	6	457553	457558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_014168	GTT	2	6	457562	457567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_014168	GC	3	6	457594	457599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_014168	GGT	2	6	457626	457631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_014168	GCG	2	6	459464	459469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_014168	CGA	2	6	459483	459488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_014168	GCC	3	9	459493	459501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_014168	TGC	2	6	459577	459582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_014168	GAT	2	6	459623	459628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_014168	GCT	2	6	461297	461302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_014168	CGC	2	6	461303	461308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_014168	CTG	2	6	461323	461328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_014168	TAA	2	6	461393	461398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_014168	GAG	2	6	461415	461420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_014168	GCA	2	6	461427	461432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_014168	CG	4	8	462661	462668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_014168	GAAA	2	8	462683	462690	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_014168	GCG	2	6	464939	464944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_014168	GC	4	8	466221	466228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_014168	GC	3	6	466248	466253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_014168	GAT	2	6	467187	467192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_014168	GC	3	6	469948	469953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_014168	CGG	2	6	470637	470642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_014168	AGT	2	6	470659	470664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_014168	CGCT	2	8	470728	470735	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_014168	CGG	2	6	470739	470744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_014168	CTC	2	6	470811	470816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_014168	TGCG	2	8	470866	470873	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_014168	GC	3	6	470955	470960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_014168	TCG	2	6	471758	471763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_014168	AAAC	2	8	471783	471790	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_014168	GAC	2	6	471849	471854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_014168	CGG	2	6	471905	471910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_014168	GCT	2	6	472096	472101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_014168	GTTG	2	8	472116	472123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_014168	TTG	2	6	472174	472179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_014168	CTC	2	6	472183	472188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_014168	TCG	3	9	472212	472220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_014168	AAC	2	6	472529	472534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_014168	TG	3	6	472568	472573	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_014168	GTC	2	6	472574	472579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_014168	CTC	2	6	472626	472631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_014168	CCT	2	6	475770	475775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_014168	TGG	2	6	475962	475967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_014168	A	8	8	475980	475987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_014168	CCGA	2	8	476039	476046	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_014168	CGG	2	6	476056	476061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_014168	ACA	2	6	476070	476075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_014168	GCG	2	6	476127	476132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_014168	CAC	2	6	476141	476146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_014168	GTC	2	6	476155	476160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_014168	GC	3	6	476174	476179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_014168	GC	3	6	476211	476216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_014168	CTT	2	6	476280	476285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_014168	CGGC	2	8	476310	476317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_014168	AAC	2	6	476325	476330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_014168	CCG	2	6	476331	476336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_014168	AAG	2	6	476348	476353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_014168	GCA	2	6	476396	476401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_014168	CGC	2	6	476445	476450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_014168	GC	3	6	476541	476546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_014168	CGA	2	6	476637	476642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_014168	CAGG	2	8	476645	476652	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1065	NC_014168	TCT	2	6	476670	476675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_014168	GAA	2	6	476681	476686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_014168	GCG	2	6	476741	476746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_014168	ACA	2	6	477457	477462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_014168	CG	3	6	477624	477629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_014168	TTC	2	6	477682	477687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_014168	CG	3	6	477729	477734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_014168	GAC	2	6	477805	477810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1074	NC_014168	ATC	2	6	477871	477876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1077	NC_014168	CT	3	6	477927	477932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_014168	GAG	2	6	478143	478148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1082	NC_014168	CGC	2	6	478359	478364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_014168	CGC	2	6	478396	478401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_014168	GTC	2	6	478402	478407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1086	NC_014168	GCCC	2	8	478531	478538	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1087	NC_014168	GCT	2	6	478555	478560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1090	NC_014168	CTC	2	6	478617	478622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_014168	CGC	3	9	478725	478733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_014168	GAA	2	6	478747	478752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_014168	CCCT	2	8	478756	478763	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1094	NC_014168	CTC	2	6	478793	478798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_014168	GAT	2	6	478809	478814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1098	NC_014168	CGG	2	6	478951	478956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_014168	AGGC	2	8	479594	479601	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1100	NC_014168	TTTG	2	8	481687	481694	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_014168	CCA	2	6	481756	481761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_014168	GCC	2	6	481772	481777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_014168	TTG	2	6	481785	481790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_014168	CTG	2	6	481874	481879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_014168	CGTTCA	2	12	481923	481934	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1107	NC_014168	CCG	3	9	482021	482029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1109	NC_014168	GAG	2	6	482048	482053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_014168	GT	3	6	482083	482088	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_014168	GT	3	6	482107	482112	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_014168	ACC	2	6	482158	482163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_014168	CAC	2	6	482228	482233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_014168	TCC	2	6	482260	482265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_014168	GTG	3	9	482328	482336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_014168	CG	3	6	482350	482355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_014168	GC	3	6	482502	482507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_014168	TCC	2	6	482512	482517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_014168	TCG	2	6	482521	482526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_014168	ACC	2	6	482607	482612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_014168	GGT	2	6	482653	482658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_014168	GCT	2	6	482678	482683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_014168	TC	4	8	482754	482761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_014168	GCC	2	6	482762	482767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_014168	CGC	2	6	482776	482781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_014168	GCG	2	6	483092	483097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_014168	CGT	2	6	483118	483123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_014168	ATG	2	6	483151	483156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_014168	TTG	2	6	483163	483168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_014168	GAT	2	6	483189	483194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_014168	GGC	2	6	483303	483308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_014168	GCG	2	6	483356	483361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_014168	TGC	2	6	483365	483370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_014168	GAG	2	6	483433	483438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_014168	CGA	2	6	483443	483448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_014168	CCG	2	6	483473	483478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1137	NC_014168	GCT	2	6	483628	483633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_014168	CTGG	2	8	483648	483655	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1139	NC_014168	TCC	2	6	483706	483711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1140	NC_014168	CGAA	2	8	483753	483760	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1141	NC_014168	GC	3	6	483761	483766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1142	NC_014168	TC	3	6	483840	483845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1143	NC_014168	TCG	2	6	483851	483856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1144	NC_014168	TCG	2	6	484841	484846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1146	NC_014168	TG	3	6	484859	484864	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1147	NC_014168	CA	3	6	487784	487789	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1148	NC_014168	GCC	2	6	487839	487844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1149	NC_014168	GCG	2	6	487847	487852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1150	NC_014168	GCG	2	6	487862	487867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1151	NC_014168	GC	4	8	487876	487883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1152	NC_014168	GGC	2	6	487908	487913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1153	NC_014168	CTC	2	6	487917	487922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1154	NC_014168	TCCCC	2	10	487932	487941	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1155	NC_014168	C	6	6	487938	487943	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1156	NC_014168	GCC	2	6	487965	487970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1157	NC_014168	TTTCT	2	10	487971	487980	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1158	NC_014168	GGC	2	6	489474	489479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1159	NC_014168	ATT	2	6	489488	489493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1164	NC_014168	GAG	2	6	489644	489649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1165	NC_014168	CGG	2	6	490298	490303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1166	NC_014168	GTC	2	6	491895	491900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1168	NC_014168	CGG	2	6	492033	492038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1175	NC_014168	CTTC	2	8	498740	498747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1179	NC_014168	GAG	2	6	500211	500216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1196	NC_014168	TGG	2	6	505950	505955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1198	NC_014168	AT	3	6	505988	505993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1215	NC_014168	CTG	2	6	512924	512929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1248	NC_014168	TCAT	2	8	525779	525786	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1249	NC_014168	AT	4	8	525785	525792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1250	NC_014168	TA	3	6	525808	525813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1253	NC_014168	GCT	2	6	525904	525909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1261	NC_014168	GTT	2	6	527121	527126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1262	NC_014168	GTA	2	6	527180	527185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1408	NC_014168	GC	3	6	584866	584871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1409	NC_014168	TCG	2	6	584892	584897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1411	NC_014168	CG	3	6	591165	591170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1412	NC_014168	CG	3	6	601262	601267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1443	NC_014168	CTGG	2	8	612037	612044	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1449	NC_014168	TGG	2	6	615938	615943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1450	NC_014168	CGG	2	6	615952	615957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1452	NC_014168	GCCC	2	8	616588	616595	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1453	NC_014168	GCGGGC	2	12	616601	616612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1468	NC_014168	CAT	2	6	622620	622625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1471	NC_014168	TAC	2	6	625788	625793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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