MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Segniliparus rotundus DSM 44985 chromosome

Total Repeats: 7138

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014168	CGC	2	6	2263174	2263179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5002	NC_014168	CGA	2	6	2263202	2263207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_014168	CGC	3	9	2263213	2263221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5004	NC_014168	GC	4	8	2264509	2264516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5005	NC_014168	CCG	2	6	2264544	2264549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5006	NC_014168	GGAC	2	8	2265633	2265640	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5007	NC_014168	CG	5	10	2265714	2265723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5008	NC_014168	CCGG	2	8	2265827	2265834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5009	NC_014168	ATCG	2	8	2265843	2265850	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5010	NC_014168	CTG	2	6	2265857	2265862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_014168	GCC	2	6	2265870	2265875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_014168	CCG	2	6	2265922	2265927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5013	NC_014168	ACC	2	6	2265948	2265953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5014	NC_014168	CACG	2	8	2265964	2265971	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5015	NC_014168	TCG	2	6	2265984	2265989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_014168	C	6	6	2266003	2266008	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5017	NC_014168	CCGA	2	8	2266013	2266020	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5018	NC_014168	GGT	2	6	2266045	2266050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_014168	AACC	2	8	2266082	2266089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5020	NC_014168	GGA	2	6	2266091	2266096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_014168	GC	3	6	2266100	2266105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_014168	CGG	2	6	2266113	2266118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_014168	CGC	2	6	2266124	2266129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_014168	GGCGTA	2	12	2266141	2266152	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5025	NC_014168	CCG	2	6	2266169	2266174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5026	NC_014168	CTC	2	6	2266303	2266308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5027	NC_014168	ACG	2	6	2266313	2266318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_014168	CCCG	2	8	2266379	2266386	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5029	NC_014168	CCA	2	6	2266388	2266393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5030	NC_014168	GGC	2	6	2266438	2266443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_014168	GC	3	6	2266462	2266467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5032	NC_014168	GC	3	6	2266476	2266481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5033	NC_014168	GCG	2	6	2266484	2266489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_014168	CGG	2	6	2267293	2267298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_014168	CCG	2	6	2268179	2268184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5036	NC_014168	GC	3	6	2268222	2268227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5037	NC_014168	GCG	2	6	2268234	2268239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_014168	CGA	2	6	2268250	2268255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_014168	GCC	2	6	2268268	2268273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5040	NC_014168	GCG	2	6	2268277	2268282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_014168	GCG	2	6	2269485	2269490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_014168	CGC	2	6	2269526	2269531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5043	NC_014168	TCG	2	6	2269536	2269541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_014168	CGG	2	6	2269613	2269618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_014168	CAG	2	6	2269648	2269653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_014168	GGC	2	6	2270566	2270571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_014168	GCGG	2	8	2270578	2270585	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5048	NC_014168	CGC	2	6	2272433	2272438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5049	NC_014168	ACC	2	6	2272455	2272460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5050	NC_014168	ACG	2	6	2272491	2272496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_014168	GAA	2	6	2272513	2272518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_014168	GCA	2	6	2272529	2272534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_014168	GCG	2	6	2275783	2275788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_014168	GGAAA	2	10	2275827	2275836	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_014168	TCA	2	6	2275872	2275877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_014168	GTA	2	6	2275880	2275885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_014168	AAAG	2	8	2275937	2275944	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_014168	GAG	2	6	2275948	2275953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_014168	GCC	3	9	2276536	2276544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5060	NC_014168	AGG	2	6	2276562	2276567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_014168	CCG	2	6	2279944	2279949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5062	NC_014168	CGG	2	6	2279950	2279955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_014168	CG	3	6	2280507	2280512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5064	NC_014168	GCGCGG	2	12	2280514	2280525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_014168	CG	3	6	2281431	2281436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5066	NC_014168	CG	3	6	2281445	2281450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5067	NC_014168	GCC	2	6	2284765	2284770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5068	NC_014168	GCC	2	6	2284847	2284852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5069	NC_014168	GC	3	6	2287292	2287297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5070	NC_014168	CACTG	2	10	2290485	2290494	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5071	NC_014168	CACTG	2	10	2290517	2290526	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5072	NC_014168	TGCTGG	2	12	2291702	2291713	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5073	NC_014168	CG	3	6	2291714	2291719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5074	NC_014168	CG	3	6	2291731	2291736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5075	NC_014168	GA	3	6	2291747	2291752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_014168	AGGG	2	8	2291756	2291763	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_014168	CCCT	2	8	2291785	2291792	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5078	NC_014168	AC	3	6	2292286	2292291	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5079	NC_014168	CCAA	2	8	2292320	2292327	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5080	NC_014168	CGCGG	2	10	2295545	2295554	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5081	NC_014168	TC	3	6	2295628	2295633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5082	NC_014168	TCCG	2	8	2295654	2295661	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5083	NC_014168	GCTC	2	8	2295668	2295675	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5084	NC_014168	CGGG	2	8	2295695	2295702	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5085	NC_014168	TTC	2	6	2298748	2298753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_014168	CGG	2	6	2298803	2298808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_014168	T	6	6	2301182	2301187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_014168	CGGG	2	8	2301205	2301212	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5089	NC_014168	CTGG	2	8	2301223	2301230	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5090	NC_014168	GC	4	8	2301231	2301238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5091	NC_014168	CG	3	6	2301273	2301278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5092	NC_014168	GAA	2	6	2304169	2304174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_014168	GAT	2	6	2304882	2304887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_014168	GCC	2	6	2304933	2304938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5095	NC_014168	T	6	6	2305007	2305012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_014168	TG	3	6	2305619	2305624	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_014168	CGC	3	9	2305684	2305692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5098	NC_014168	CAC	2	6	2306267	2306272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5099	NC_014168	AC	3	6	2309756	2309761	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5100	NC_014168	GCC	2	6	2309781	2309786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5101	NC_014168	AAC	2	6	2309796	2309801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_014168	AGCC	2	8	2310277	2310284	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5103	NC_014168	CAC	2	6	2312107	2312112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5104	NC_014168	ACC	2	6	2312150	2312155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5105	NC_014168	CG	4	8	2312168	2312175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5106	NC_014168	GCCGG	2	10	2312178	2312187	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5107	NC_014168	GTC	2	6	2312220	2312225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_014168	GCC	2	6	2312272	2312277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5109	NC_014168	GCGCG	2	10	2312278	2312287	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5110	NC_014168	CTC	2	6	2312632	2312637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5111	NC_014168	CTGA	2	8	2312638	2312645	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5112	NC_014168	CTGA	2	8	2312652	2312659	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5113	NC_014168	GC	3	6	2313587	2313592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5114	NC_014168	TCC	2	6	2314181	2314186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5115	NC_014168	CCAC	2	8	2314243	2314250	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5116	NC_014168	GAC	2	6	2314256	2314261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_014168	GCG	2	6	2314321	2314326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_014168	CGC	3	9	2314332	2314340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5119	NC_014168	GGC	2	6	2315268	2315273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_014168	GCGG	2	8	2315283	2315290	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5121	NC_014168	GAG	2	6	2315300	2315305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_014168	CCTC	2	8	2316238	2316245	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5123	NC_014168	ACG	2	6	2316246	2316251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_014168	ACC	2	6	2316278	2316283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5125	NC_014168	TGC	2	6	2316284	2316289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_014168	GAC	2	6	2316325	2316330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_014168	CGA	2	6	2316346	2316351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_014168	CTG	2	6	2316368	2316373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_014168	CGG	2	6	2316411	2316416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_014168	GC	3	6	2316473	2316478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5131	NC_014168	A	6	6	2318278	2318283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_014168	CGC	2	6	2319563	2319568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5133	NC_014168	CGC	3	9	2322000	2322008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5134	NC_014168	GC	3	6	2322017	2322022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5135	NC_014168	CGC	2	6	2322035	2322040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5165	NC_014168	GTCAA	2	10	2338244	2338253	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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5230	NC_014168	CG	3	6	2371759	2371764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5231	NC_014168	GCGG	2	8	2371765	2371772	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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5235	NC_014168	GGCG	2	8	2372002	2372009	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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5242	NC_014168	CCG	2	6	2374448	2374453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5244	NC_014168	C	6	6	2374488	2374493	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5245	NC_014168	AC	3	6	2374607	2374612	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5246	NC_014168	AG	3	6	2374753	2374758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5247	NC_014168	T	6	6	2374771	2374776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5248	NC_014168	A	6	6	2376539	2376544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_014168	CAG	2	6	2377782	2377787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5250	NC_014168	CT	3	6	2377821	2377826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5251	NC_014168	TGGC	2	8	2377828	2377835	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5252	NC_014168	CA	3	6	2377865	2377870	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5253	NC_014168	ACC	2	6	2377922	2377927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5254	NC_014168	GAT	2	6	2377977	2377982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5256	NC_014168	GCG	2	6	2378058	2378063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5257	NC_014168	AGG	2	6	2378336	2378341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_014168	CGA	2	6	2379380	2379385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5259	NC_014168	TCA	2	6	2379453	2379458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5260	NC_014168	GGAA	2	8	2379466	2379473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5261	NC_014168	ACA	2	6	2379474	2379479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5262	NC_014168	CCG	2	6	2382718	2382723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5263	NC_014168	CAA	2	6	2382736	2382741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5264	NC_014168	TGGA	2	8	2382765	2382772	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5265	NC_014168	GC	3	6	2382818	2382823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5266	NC_014168	CCT	2	6	2382877	2382882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5267	NC_014168	CCA	2	6	2382888	2382893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5268	NC_014168	CCGG	2	8	2382942	2382949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5269	NC_014168	CG	3	6	2383389	2383394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5270	NC_014168	GCCC	2	8	2383398	2383405	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5271	NC_014168	GCCC	2	8	2383417	2383424	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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5282	NC_014168	CGTG	2	8	2386515	2386522	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5397	NC_014168	GAT	2	6	2408788	2408793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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