MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salinibacter ruber M8 plasmid pSR84

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014157	CGGG	2	8	1703	1710	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014157	GGGC	2	8	1882	1889	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014157	GATT	2	8	2539	2546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014157	TGAC	2	8	4920	4927	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014157	GCGA	2	8	5228	5235	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014157	TCCA	2	8	7587	7594	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014157	GCCA	2	8	7892	7899	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014157	TGCT	2	8	8350	8357	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014157	TTTC	2	8	12119	12126	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014157	GCAC	2	8	15963	15970	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014157	CCGG	2	8	16073	16080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014157	GGCA	2	8	16289	16296	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014157	GTCA	2	8	16676	16683	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014157	GGCA	2	8	16794	16801	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014157	GCGA	2	8	16986	16993	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014157	TCCT	2	8	17036	17043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014157	CCCG	2	8	17060	17067	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_014157	CGGT	2	8	17389	17396	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014157	GAAT	2	8	17692	17699	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014157	GACT	2	8	17922	17929	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014157	GACT	2	8	17936	17943	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014157	GCCT	2	8	18174	18181	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014157	TTTG	2	8	18267	18274	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014157	GTTG	2	8	22245	22252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014157	TGCC	2	8	22545	22552	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014157	TTTC	2	8	22572	22579	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014157	CTGC	2	8	22874	22881	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014157	TCAC	2	8	22973	22980	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014157	GATA	2	8	27210	27217	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014157	AGAA	2	8	27295	27302	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014157	GAGC	2	8	27903	27910	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014157	ATAC	2	8	32896	32903	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014157	GGCC	2	8	34383	34390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014157	CCAG	2	8	34604	34611	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014157	TGCC	2	8	34836	34843	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014157	TTCC	2	8	34858	34865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014157	CCCG	2	8	34940	34947	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_014157	CGGG	2	8	42072	42079	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014157	GGCG	2	8	43284	43291	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014157	GTTG	2	8	45437	45444	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014157	ATCT	2	8	46844	46851	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014157	GATG	2	8	48374	48381	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014157	GAGG	2	8	51852	51859	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014157	TGGG	2	8	52728	52735	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014157	GCCC	2	8	53049	53056	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_014157	TGGG	2	8	67013	67020	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014157	TCTT	2	8	68591	68598	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014157	GGAC	2	8	69113	69120	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014157	GCGT	2	8	69184	69191	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014157	CAAA	2	8	69471	69478	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014157	GGCA	2	8	70211	70218	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014157	TCAG	2	8	70954	70961	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014157	CCCG	2	8	71457	71464	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_014157	CTTT	2	8	73124	73131	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014157	GTAG	2	8	75048	75055	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014157	CTCC	2	8	75108	75115	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
57	NC_014157	CCTG	2	8	75523	75530	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014157	GGCT	2	8	75835	75842	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014157	CACT	2	8	76841	76848	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014157	TCGC	2	8	76976	76983	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014157	CCTT	2	8	78613	78620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014157	GTTG	2	8	80678	80685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014157	GAGG	2	8	81699	81706	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014157	GGCA	2	8	82091	82098	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014157	CAGA	2	8	82539	82546	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014157	CGGA	2	8	82734	82741	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014157	GACC	2	8	82795	82802	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014157	AGGC	2	8	82870	82877	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014157	CTGG	2	8	83855	83862	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014157	TGGA	2	8	84161	84168	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.