MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salinibacter ruber M8 plasmid pSR84

Total Repeats: 248

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014157	CCG	2	6	1188	1193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_014157	GGA	2	6	1201	1206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014157	CGG	2	6	1296	1301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014157	AGG	2	6	1371	1376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014157	GCG	2	6	1646	1651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014157	CGC	2	6	1728	1733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_014157	TTC	2	6	1772	1777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014157	AAG	2	6	1860	1865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014157	TGG	2	6	1993	1998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014157	GCA	2	6	2023	2028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014157	GCA	2	6	2039	2044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014157	TCT	2	6	2063	2068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014157	GCA	2	6	2073	2078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014157	TCT	2	6	2080	2085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014157	GCA	2	6	2090	2095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014157	CGA	2	6	2171	2176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014157	GGT	2	6	2212	2217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014157	CGG	2	6	2311	2316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014157	GCT	2	6	2396	2401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014157	CTG	2	6	2584	2589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014157	TTG	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014157	TGG	2	6	4386	4391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014157	TCC	2	6	4580	4585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_014157	ATC	2	6	4782	4787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014157	AGA	2	6	4954	4959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014157	CGC	2	6	5104	5109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_014157	CGA	2	6	5143	5148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014157	TCT	2	6	5172	5177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014157	CAG	2	6	5182	5187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014157	GCT	2	6	5268	5273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014157	ACG	2	6	5331	5336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014157	AGA	2	6	5337	5342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014157	GCT	2	6	6182	6187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014157	TTG	2	6	7235	7240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014157	ATG	2	6	7563	7568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014157	CGA	2	6	7922	7927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014157	TAG	2	6	8415	8420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014157	TGG	2	6	8566	8571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014157	AGC	2	6	8642	8647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014157	TCA	2	6	8765	8770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014157	CTT	2	6	9526	9531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014157	TCC	3	9	10045	10053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_014157	GCT	2	6	11680	11685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014157	TCT	2	6	11931	11936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014157	TTC	2	6	11991	11996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014157	TCG	2	6	12169	12174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014157	TTG	2	6	12252	12257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014157	GTT	2	6	12271	12276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014157	GCT	2	6	12372	12377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014157	CTC	2	6	13565	13570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_014157	CGG	2	6	13685	13690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014157	GCA	2	6	13724	13729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014157	CCG	2	6	15139	15144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_014157	GCT	2	6	15224	15229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014157	TTC	2	6	15233	15238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014157	CTG	2	6	15256	15261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014157	GAA	2	6	16014	16019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014157	TCT	2	6	16067	16072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014157	GTC	2	6	16147	16152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014157	CAA	2	6	16169	16174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014157	TCT	2	6	16196	16201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014157	AGC	2	6	16592	16597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014157	CGG	2	6	16700	16705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014157	GCG	2	6	16706	16711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014157	CAC	2	6	16927	16932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_014157	GCC	2	6	16939	16944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_014157	TCG	2	6	16977	16982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014157	TGG	2	6	17013	17018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014157	CCT	2	6	17023	17028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_014157	GGC	2	6	17044	17049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014157	ACA	2	6	17175	17180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014157	CTC	2	6	17342	17347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_014157	ATC	2	6	17408	17413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014157	GCC	2	6	17480	17485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_014157	TCG	2	6	17525	17530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014157	GTG	2	6	17534	17539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014157	CCA	2	6	17548	17553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_014157	GGT	2	6	17677	17682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014157	CTT	2	6	18057	18062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014157	TCC	2	6	18098	18103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_014157	TGG	2	6	18432	18437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014157	CAC	2	6	22018	22023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_014157	AGG	2	6	22121	22126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014157	TGC	2	6	22179	22184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014157	TGC	2	6	22196	22201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014157	TGC	2	6	22213	22218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014157	TGC	2	6	22230	22235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014157	AAG	2	6	22294	22299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014157	CTG	2	6	22461	22466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014157	GCC	2	6	22468	22473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_014157	CTG	2	6	22488	22493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014157	CTG	2	6	22503	22508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014157	CTG	2	6	22518	22523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014157	CTG	2	6	22533	22538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014157	CTC	2	6	22631	22636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_014157	CCT	2	6	22644	22649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_014157	CTT	2	6	23103	23108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014157	AGG	2	6	26998	27003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014157	CTG	2	6	27166	27171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014157	AGT	2	6	27218	27223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014157	GCA	2	6	27877	27882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014157	GCA	2	6	27897	27902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014157	CAG	2	6	32810	32815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014157	CCT	2	6	32958	32963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_014157	CCT	2	6	32973	32978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_014157	TCA	2	6	33822	33827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014157	CTC	2	6	33915	33920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_014157	CGC	2	6	34070	34075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_014157	CGG	2	6	34377	34382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014157	CGG	2	6	34398	34403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014157	CTC	2	6	34468	34473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_014157	TCC	2	6	34486	34491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_014157	GGC	2	6	34499	34504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014157	TGG	2	6	34508	34513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014157	TTC	2	6	34680	34685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014157	AGC	2	6	34868	34873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014157	CAC	2	6	34897	34902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_014157	CCG	2	6	34930	34935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_014157	TCT	2	6	38684	38689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014157	GAA	2	6	39552	39557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014157	GTG	2	6	40834	40839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014157	GAG	2	6	40842	40847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014157	CGG	2	6	45468	45473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014157	CGG	2	6	46826	46831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014157	TTC	2	6	46832	46837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014157	CGA	2	6	46897	46902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014157	GCC	2	6	52777	52782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_014157	CGT	2	6	52852	52857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014157	CGA	2	6	52931	52936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014157	TCG	2	6	53008	53013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014157	TCG	2	6	53080	53085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014157	ACG	2	6	55540	55545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014157	TCC	2	6	55547	55552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_014157	GCT	2	6	57209	57214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014157	CGG	2	6	57216	57221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014157	GAC	2	6	57261	57266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014157	CGG	2	6	61862	61867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014157	GGT	2	6	63247	63252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014157	AGG	2	6	63297	63302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014157	CTT	2	6	63450	63455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.