MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Salinibacter ruber M8 chromosome

Total Repeats: 144

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014032	TCGTCT	2	12	163	174	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014032	GCGCAA	2	12	3283	3294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014032	CCAAAT	2	12	16071	16082	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014032	CGCGGC	2	12	23607	23618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014032	GTGGAA	2	12	34512	34523	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014032	TTCCAC	2	12	57516	57527	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014032	CGCCCG	2	12	61674	61685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_014032	CGTGCA	2	12	71040	71051	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014032	GTTGAG	2	12	77974	77985	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014032	GCCTGT	2	12	141204	141215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014032	CCAATA	2	12	141269	141280	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014032	CATTGC	2	12	192326	192337	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014032	GGCCGA	2	12	198388	198399	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014032	GAAGCT	2	12	199672	199683	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014032	TTTCCG	2	12	223625	223636	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014032	CTGACG	2	12	247688	247699	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014032	AAAAAT	2	12	261301	261312	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014032	TTCGGC	2	12	295423	295434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014032	ACGGAG	2	12	318595	318606	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014032	CAAGGA	2	12	336076	336087	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014032	CTCGAC	2	12	350894	350905	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014032	TATAGT	2	12	354313	354324	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014032	CGGTCA	2	12	357941	357952	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014032	CGGCGC	2	12	360027	360038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014032	GCCGGG	2	12	360501	360512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014032	CGCTGG	2	12	376464	376475	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014032	CCGATC	2	12	376516	376527	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014032	TCGCTC	2	12	378521	378532	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014032	GTGCCC	2	12	385702	385713	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014032	GCCCCC	2	12	395596	395607	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
31	NC_014032	CCGGGC	2	12	412665	412676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014032	AGGCGC	2	12	417481	417492	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014032	TGCCCC	2	12	417630	417641	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_014032	CCTACC	2	12	475940	475951	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_014032	GCCCTC	2	12	476059	476070	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_014032	CCGTGC	2	12	516922	516933	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014032	CGTGTG	2	12	630670	630681	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014032	GCCCGG	2	12	633804	633815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014032	AGGGGG	2	12	639451	639462	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014032	CCAGCG	2	12	656500	656511	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014032	GTGGCC	2	12	660525	660536	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014032	TGCTGT	2	12	708874	708885	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014032	AGGGAA	2	12	718319	718330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014032	GGGCGG	2	12	736169	736180	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014032	GCGTGT	2	12	751593	751604	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014032	CCGCAC	2	12	773731	773742	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_014032	CCCACT	2	12	774300	774311	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_014032	TCTTGG	2	12	861453	861464	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014032	CCTGTC	2	12	906386	906397	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014032	CACTTA	2	12	921245	921256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014032	CTTTCC	2	12	927091	927102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_014032	GTGGGC	2	12	935816	935827	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014032	CACTTA	2	12	954949	954960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014032	GGTATT	2	12	1000183	1000194	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014032	CGTGCA	2	12	1003218	1003229	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014032	CACAGG	2	12	1006220	1006231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014032	GATTCC	2	12	1009201	1009212	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014032	CCGGCA	2	12	1051881	1051892	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014032	GACATC	2	12	1052216	1052227	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014032	GTCCGG	2	12	1077722	1077733	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014032	GTTCGG	2	12	1079422	1079433	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014032	GGGCAC	2	12	1158279	1158290	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014032	CAGGAT	2	12	1171418	1171429	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014032	CTTCGT	2	12	1174441	1174452	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014032	GGGAAG	2	12	1215640	1215651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014032	GAAATG	2	12	1226740	1226751	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014032	ACCGGG	2	12	1261107	1261118	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014032	GGATGG	2	12	1288678	1288689	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014032	GTCGGG	2	12	1290904	1290915	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014032	ACCGGC	2	12	1321045	1321056	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014032	TCGATT	2	12	1329501	1329512	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014032	AGACCG	2	12	1331691	1331702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014032	CGCACG	2	12	1426186	1426197	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014032	CCGTTC	2	12	1451052	1451063	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014032	AAAGGA	2	12	1453752	1453763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014032	GGGCCG	2	12	1459010	1459021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014032	ACGCCG	2	12	1463906	1463917	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014032	TCCGCT	2	12	1469405	1469416	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_014032	GCCCCC	2	12	1486303	1486314	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
80	NC_014032	GTCCGT	2	12	1486350	1486361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014032	GACGCG	2	12	1488030	1488041	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014032	GGGGAG	2	12	1502198	1502209	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014032	GGGGTT	2	12	1508892	1508903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014032	GCGGCC	2	12	1547668	1547679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014032	GAGCCT	2	12	1581370	1581381	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014032	CGACAA	2	12	1634534	1634545	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014032	CGAACG	2	12	1670840	1670851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014032	TGGCAA	2	12	1675333	1675344	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014032	GAAATG	2	12	1675347	1675358	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014032	GAAACT	2	12	1683446	1683457	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014032	CTTTCG	2	12	1701291	1701302	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014032	GAGAAT	2	12	1750320	1750331	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014032	AGCAGA	2	12	1750501	1750512	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_014032	GGGGAC	2	12	1803894	1803905	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_014032	CACGAG	2	12	1823241	1823252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014032	AGTACG	2	12	1833530	1833541	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014032	AGCGGC	2	12	1842927	1842938	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014032	CGCGTC	2	12	1849597	1849608	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014032	CCCCAC	2	12	1978851	1978862	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
100	NC_014032	GGCCTC	2	12	1985991	1986002	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
101	NC_014032	CCTGCG	2	12	2036767	2036778	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014032	CCGGGG	2	12	2045989	2046000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014032	ACTGCG	2	12	2064628	2064639	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014032	CACGGG	2	12	2068362	2068373	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014032	GTCGCG	2	12	2129357	2129368	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014032	CCCACT	2	12	2155842	2155853	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_014032	CGGCAG	2	12	2191741	2191752	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014032	CGCCAC	2	12	2217063	2217074	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_014032	CGGCAC	2	12	2219745	2219756	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014032	TCTCGC	2	12	2266383	2266394	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
111	NC_014032	CGGCGT	2	12	2271899	2271910	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014032	GGAGGC	2	12	2419291	2419302	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_014032	CTTTCC	2	12	2534414	2534425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014032	CCAGAT	2	12	2581322	2581333	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014032	GACCGT	2	12	2609863	2609874	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014032	GCAGGG	2	12	2651444	2651455	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_014032	CGGGCG	2	12	2718653	2718664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014032	TCCGGA	2	12	2760641	2760652	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014032	TCGGTT	2	12	2811778	2811789	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_014032	CGTGCT	2	12	2812191	2812202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014032	GCCCCA	2	12	2821588	2821599	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_014032	CCCACA	2	12	2852100	2852111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_014032	TCCGTC	2	12	2875167	2875178	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
124	NC_014032	CCGCCA	2	12	2907781	2907792	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_014032	CCTCAG	2	12	2942503	2942514	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
126	NC_014032	CGGGCG	2	12	2953109	2953120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014032	CCTCCC	2	12	3047228	3047239	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
128	NC_014032	CCCCCA	2	12	3056516	3056527	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
129	NC_014032	TCGGCC	2	12	3064053	3064064	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014032	CCCAAA	2	12	3100804	3100815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_014032	CCTGTG	2	12	3118093	3118104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014032	GGGGGC	2	12	3129413	3129424	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_014032	GCCACG	2	12	3220762	3220773	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014032	CCCCCG	2	12	3221489	3221500	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
135	NC_014032	CGCGAT	2	12	3298318	3298329	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014032	TCCCGT	2	12	3301124	3301135	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
137	NC_014032	GAGGGC	2	12	3386125	3386136	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_014032	TTCGAC	2	12	3398600	3398611	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014032	CGAGAA	2	12	3431734	3431745	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_014032	CTCCCC	2	12	3461901	3461912	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
141	NC_014032	CGCCCG	2	12	3533518	3533529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_014032	GCCTCC	2	12	3572926	3572937	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_014032	CCCGCC	2	12	3594371	3594382	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
144	NC_014032	GGAGGG	2	12	3604720	3604731	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.