MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salinibacter ruber M8 chromosome

Total Repeats: 9820

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014032	AG	3	6	888649	888654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_014032	GCG	3	9	889507	889515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_014032	GCT	2	6	889656	889661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_014032	TGTA	2	8	890020	890027	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_014032	GT	3	6	890036	890041	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_014032	GCG	2	6	890089	890094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_014032	GGT	2	6	890137	890142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_014032	TCT	2	6	890155	890160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_014032	GGC	2	6	890177	890182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_014032	TAT	2	6	890188	890193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_014032	CGA	2	6	890200	890205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_014032	GAG	2	6	890274	890279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_014032	CA	3	6	890763	890768	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3014	NC_014032	TCG	2	6	890783	890788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_014032	GGA	2	6	890799	890804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_014032	CGC	2	6	890806	890811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_014032	GCT	2	6	890838	890843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_014032	GCG	2	6	890918	890923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_014032	ATG	2	6	890955	890960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_014032	CAAA	2	8	891299	891306	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3021	NC_014032	CCT	3	9	891325	891333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3022	NC_014032	GGA	2	6	891962	891967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_014032	G	7	7	892442	892448	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_014032	GTT	2	6	892488	892493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_014032	GTT	2	6	892510	892515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_014032	CAGC	2	8	892898	892905	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3027	NC_014032	TTTTC	2	10	892926	892935	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3028	NC_014032	CAG	2	6	892968	892973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_014032	TTG	2	6	893239	893244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_014032	G	6	6	893259	893264	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_014032	TTG	2	6	893269	893274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_014032	CGGCC	2	10	893284	893293	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3033	NC_014032	GGA	3	9	893856	893864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_014032	GTC	2	6	893929	893934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_014032	GAG	2	6	893947	893952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_014032	GA	3	6	894229	894234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_014032	TTGT	2	8	894362	894369	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_014032	G	6	6	894393	894398	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_014032	CCG	2	6	894409	894414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_014032	CGG	2	6	894416	894421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_014032	CTGG	2	8	894434	894441	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3042	NC_014032	GTC	2	6	894504	894509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_014032	CT	3	6	894510	894515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3044	NC_014032	CGA	2	6	894529	894534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_014032	GAC	2	6	894704	894709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_014032	C	6	6	894906	894911	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3047	NC_014032	GAT	2	6	895004	895009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_014032	GGC	2	6	895012	895017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_014032	GCT	2	6	895059	895064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_014032	TTC	2	6	895098	895103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_014032	CGCC	2	8	896612	896619	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3052	NC_014032	GGC	2	6	896657	896662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_014032	GCGG	2	8	896663	896670	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3054	NC_014032	GA	3	6	896739	896744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_014032	ATG	2	6	897802	897807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_014032	TCT	2	6	897850	897855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_014032	TTC	2	6	897908	897913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_014032	CTT	2	6	898121	898126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_014032	CCT	2	6	898142	898147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3060	NC_014032	CGT	2	6	898203	898208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_014032	GTG	2	6	898505	898510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_014032	GCCGG	2	10	898511	898520	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3063	NC_014032	GGTA	2	8	898581	898588	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_014032	TG	3	6	898699	898704	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_014032	CGT	2	6	898737	898742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_014032	ACC	2	6	898805	898810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3067	NC_014032	GTC	2	6	898865	898870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_014032	AGCG	2	8	898880	898887	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3069	NC_014032	CGC	2	6	898900	898905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3070	NC_014032	TAGC	2	8	898914	898921	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3071	NC_014032	TGC	2	6	899039	899044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_014032	CG	3	6	899045	899050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_014032	AAG	2	6	899101	899106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_014032	TCC	2	6	899114	899119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3075	NC_014032	AAC	2	6	899186	899191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_014032	CTTG	2	8	900373	900380	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3077	NC_014032	TTG	2	6	901696	901701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_014032	CT	3	6	901746	901751	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3079	NC_014032	ATG	2	6	901758	901763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_014032	TCCA	2	8	901782	901789	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3081	NC_014032	GCCA	2	8	902087	902094	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3082	NC_014032	CGA	2	6	902117	902122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_014032	GTC	2	6	903289	903294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_014032	CGA	2	6	903808	903813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_014032	CACC	2	8	903818	903825	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3086	NC_014032	CGA	2	6	904559	904564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_014032	GGA	2	6	904637	904642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_014032	AG	3	6	905232	905237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_014032	CAG	2	6	905265	905270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_014032	GGA	2	6	905336	905341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_014032	CCTGTC	2	12	906386	906397	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3092	NC_014032	GCT	2	6	906427	906432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_014032	GAA	2	6	906442	906447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_014032	TC	3	6	906488	906493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3095	NC_014032	GTGGC	2	10	906502	906511	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3096	NC_014032	CAG	2	6	906559	906564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_014032	GGT	2	6	906956	906961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_014032	GTTCG	2	10	906991	907000	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3099	NC_014032	CGA	2	6	907021	907026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_014032	CTTT	2	8	907051	907058	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3101	NC_014032	CGA	2	6	907088	907093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_014032	GAG	2	6	907264	907269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_014032	AGC	2	6	909259	909264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_014032	GA	3	6	909283	909288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_014032	GTT	2	6	909305	909310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_014032	T	6	6	909326	909331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_014032	TAC	2	6	909338	909343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_014032	GCTGA	2	10	909383	909392	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3109	NC_014032	CGAA	2	8	909439	909446	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3110	NC_014032	GCCC	2	8	909466	909473	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3111	NC_014032	GGGGC	2	10	909632	909641	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3112	NC_014032	C	6	6	909959	909964	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3113	NC_014032	GGA	2	6	910066	910071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_014032	AGG	2	6	910106	910111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_014032	C	6	6	910154	910159	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3116	NC_014032	CGG	2	6	911946	911951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_014032	TGC	2	6	911954	911959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_014032	CCGA	2	8	912808	912815	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3119	NC_014032	AGT	2	6	912824	912829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_014032	GCG	2	6	912861	912866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_014032	GC	3	6	912899	912904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3122	NC_014032	G	7	7	912929	912935	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_014032	TGA	2	6	912936	912941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_014032	CCT	2	6	913007	913012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3125	NC_014032	TTTC	2	8	913030	913037	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3126	NC_014032	CT	3	6	913118	913123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3127	NC_014032	TGT	2	6	913831	913836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_014032	TGG	2	6	913962	913967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_014032	AG	3	6	914038	914043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_014032	CGTT	2	8	914126	914133	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3131	NC_014032	CACG	2	8	914149	914156	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3132	NC_014032	GC	4	8	914178	914185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3133	NC_014032	AG	3	6	914928	914933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_014032	GGT	2	6	914954	914959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_014032	CTA	2	6	914970	914975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3136	NC_014032	GGA	2	6	914980	914985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_014032	GCA	2	6	915018	915023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3252	NC_014032	CCGTA	2	10	939537	939546	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3255	NC_014032	TTG	3	9	939712	939720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3257	NC_014032	CGG	2	6	939749	939754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3261	NC_014032	CTCC	2	8	941021	941028	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3262	NC_014032	GC	3	6	941097	941102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3263	NC_014032	TGA	2	6	941110	941115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3266	NC_014032	TTC	2	6	942642	942647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3269	NC_014032	GCCGG	2	10	943875	943884	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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3408	NC_014032	GGC	2	6	980881	980886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3409	NC_014032	CGT	2	6	980899	980904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3410	NC_014032	CGG	2	6	980928	980933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3411	NC_014032	GTG	2	6	980969	980974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3412	NC_014032	GAC	2	6	981080	981085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3415	NC_014032	ACG	2	6	981263	981268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3417	NC_014032	GCC	2	6	981288	981293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3421	NC_014032	CCG	2	6	981363	981368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3422	NC_014032	GATCA	2	10	981371	981380	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3423	NC_014032	AGA	2	6	981442	981447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3427	NC_014032	GAC	2	6	981545	981550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3430	NC_014032	GAG	2	6	983542	983547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3431	NC_014032	CGA	2	6	983548	983553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3432	NC_014032	ACG	2	6	983566	983571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3433	NC_014032	ACG	2	6	983582	983587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3434	NC_014032	AG	4	8	984833	984840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3435	NC_014032	CGT	2	6	986033	986038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3436	NC_014032	GAG	2	6	986056	986061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3437	NC_014032	C	7	7	991614	991620	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3438	NC_014032	CGG	2	6	992336	992341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3439	NC_014032	CCG	2	6	992375	992380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3440	NC_014032	G	6	6	992390	992395	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3441	NC_014032	AG	3	6	993344	993349	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3442	NC_014032	CG	3	6	993354	993359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3443	NC_014032	CCT	2	6	993382	993387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3444	NC_014032	TC	3	6	994413	994418	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3445	NC_014032	GCCC	2	8	994495	994502	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3446	NC_014032	GAG	2	6	996979	996984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3447	NC_014032	GTC	2	6	997049	997054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3449	NC_014032	GGA	2	6	997973	997978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3450	NC_014032	GAC	2	6	997985	997990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3451	NC_014032	GCA	2	6	999224	999229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3452	NC_014032	G	6	6	999232	999237	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3453	NC_014032	GGC	2	6	999361	999366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3454	NC_014032	G	7	7	999372	999378	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3457	NC_014032	GGC	2	6	1000234	1000239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3500	NC_014032	TCG	2	6	1011594	1011599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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