MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salinibacter ruber M8 plasmid pSR61

Total Repeats: 245

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014030	AGC	2	6	346	351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014030	GCG	2	6	360	365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014030	CAG	2	6	1939	1944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014030	CTG	2	6	2963	2968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014030	CTG	2	6	2994	2999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014030	GAA	2	6	3063	3068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014030	CTC	2	6	3798	3803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_014030	TGC	2	6	4104	4109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014030	GAA	2	6	4223	4228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014030	AAG	2	6	5698	5703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014030	AAC	2	6	6411	6416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014030	CTG	2	6	6606	6611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014030	TCT	2	6	6640	6645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014030	CTC	2	6	8812	8817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_014030	ATG	2	6	9045	9050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014030	CTC	2	6	9065	9070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_014030	TCT	2	6	9090	9095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014030	GAA	2	6	9127	9132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014030	ATC	2	6	9422	9427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014030	CTC	2	6	9436	9441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_014030	ACT	2	6	9538	9543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014030	CGG	2	6	9651	9656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014030	GAC	2	6	9834	9839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014030	GAT	2	6	9880	9885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014030	TCC	2	6	9966	9971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_014030	CCT	2	6	10085	10090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_014030	TCT	2	6	10146	10151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014030	CCT	2	6	10179	10184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_014030	GCT	2	6	10216	10221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014030	TGG	2	6	10268	10273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014030	CCA	2	6	10295	10300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_014030	GCC	2	6	10304	10309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_014030	AGC	2	6	10349	10354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014030	CAC	2	6	10378	10383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_014030	CAC	2	6	10602	10607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_014030	TGC	2	6	10614	10619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014030	CAG	2	6	10635	10640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014030	CGC	2	6	10658	10663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_014030	GCC	2	6	10665	10670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_014030	CAG	2	6	10711	10716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014030	GAG	2	6	10754	10759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014030	TAC	2	6	10784	10789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014030	GAC	2	6	10802	10807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014030	GTC	2	6	10886	10891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014030	GGA	2	6	11004	11009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014030	GGA	2	6	11022	11027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014030	ACG	2	6	11136	11141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014030	CCG	2	6	11183	11188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_014030	TCG	2	6	11205	11210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014030	TTG	2	6	11448	11453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014030	TCT	2	6	11472	11477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014030	GAC	2	6	11591	11596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014030	ACT	2	6	11608	11613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014030	GGC	2	6	11630	11635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014030	CCG	2	6	11656	11661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_014030	CGG	2	6	11666	11671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014030	CTT	2	6	11672	11677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014030	TGG	2	6	11686	11691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014030	TCA	2	6	11719	11724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014030	CTG	2	6	11805	11810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014030	CCT	2	6	14648	14653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_014030	GAG	2	6	14684	14689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014030	CTG	2	6	14694	14699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014030	CTG	2	6	14709	14714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014030	CTG	2	6	14724	14729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014030	GGC	2	6	14746	14751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014030	AGC	2	6	15674	15679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014030	ATG	2	6	15778	15783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014030	CCT	2	6	15785	15790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_014030	CCG	2	6	16173	16178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_014030	CGC	2	6	16206	16211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_014030	TCT	2	6	16212	16217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014030	GCC	2	6	16225	16230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_014030	GGA	2	6	16900	16905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014030	CAG	2	6	17123	17128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014030	GCC	2	6	17265	17270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_014030	TGT	2	6	18355	18360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014030	AGC	2	6	18373	18378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014030	GTG	2	6	18380	18385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014030	GGA	2	6	18401	18406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014030	CGG	2	6	18506	18511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014030	CAC	2	6	18552	18557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_014030	AGC	2	6	18573	18578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014030	CAG	2	6	18670	18675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014030	GGA	2	6	18813	18818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014030	GCG	2	6	18886	18891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014030	CAT	2	6	18896	18901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014030	GGA	2	6	18905	18910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014030	TCT	2	6	19921	19926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014030	TCT	2	6	19933	19938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014030	TCA	2	6	19962	19967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014030	CCT	2	6	20018	20023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_014030	CTG	2	6	20080	20085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014030	TTC	2	6	20087	20092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014030	CAA	2	6	20540	20545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014030	GGC	2	6	21734	21739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014030	CGT	2	6	21746	21751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014030	TCT	2	6	21754	21759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014030	CGC	2	6	21881	21886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_014030	GCC	2	6	21952	21957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_014030	CGC	2	6	21970	21975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_014030	CGA	2	6	22071	22076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014030	CAG	3	9	22141	22149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014030	CGC	2	6	22193	22198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_014030	GAC	2	6	22251	22256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014030	TTC	2	6	22322	22327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014030	TGA	2	6	22342	22347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014030	GGT	2	6	22388	22393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014030	GTC	2	6	22471	22476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014030	GAC	2	6	22604	22609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014030	ACG	2	6	22629	22634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014030	CGA	2	6	22639	22644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014030	GGA	2	6	22654	22659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014030	CGC	2	6	22671	22676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_014030	CGA	2	6	22730	22735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014030	TTC	2	6	22856	22861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014030	CTC	2	6	23010	23015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_014030	CTC	2	6	23311	23316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_014030	GAT	2	6	23362	23367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014030	CTG	2	6	23379	23384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014030	GTC	2	6	23399	23404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014030	GTC	2	6	23454	23459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014030	CGC	2	6	23512	23517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_014030	ACG	2	6	23526	23531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014030	TAC	2	6	23554	23559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014030	ACC	2	6	23631	23636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_014030	TCG	2	6	23655	23660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014030	GGA	2	6	23685	23690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014030	TGA	2	6	23693	23698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014030	GCC	2	6	23818	23823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_014030	TCC	2	6	25760	25765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_014030	GCA	2	6	25812	25817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014030	GGC	2	6	25829	25834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014030	GCT	2	6	25861	25866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014030	GCA	2	6	25885	25890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014030	GTT	2	6	26001	26006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014030	AGC	2	6	26037	26042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014030	CCA	2	6	26591	26596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_014030	CCA	2	6	26606	26611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_014030	CAG	2	6	26680	26685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_014030	GAA	2	6	26998	27003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014030	TAT	2	6	27072	27077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014030	CAA	2	6	27081	27086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_014030	CCG	2	6	27300	27305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_014030	TCT	2	6	27341	27346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_014030	GCC	2	6	28130	28135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_014030	CGG	2	6	28151	28156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_014030	GAC	2	6	28222	28227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_014030	GAT	2	6	28255	28260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014030	TTG	2	6	28350	28355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014030	TCC	2	6	28429	28434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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153	NC_014030	ACC	2	6	28544	28549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_014030	CGA	2	6	28780	28785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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156	NC_014030	TCA	2	6	28808	28813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_014030	CGA	2	6	28828	28833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_014030	CAA	2	6	28980	28985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_014030	CCA	2	6	29029	29034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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165	NC_014030	ACC	2	6	37030	37035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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172	NC_014030	GAC	2	6	37488	37493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_014030	TCT	2	6	37508	37513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_014030	GGA	2	6	37569	37574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
175	NC_014030	CTA	2	6	37578	37583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_014030	CGC	2	6	37662	37667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.