MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sphingobium japonicum UT26S chromosome 2

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014013	ACCCG	2	10	1557	1566	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_014013	CGGTC	2	10	9192	9201	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_014013	CCGAT	2	10	21516	21525	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_014013	AATAA	2	10	41544	41553	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014013	TGGGA	2	10	54597	54606	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014013	CGGAC	2	10	63154	63163	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_014013	TGGGC	2	10	65861	65870	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014013	TCCCC	2	10	66780	66789	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
9	NC_014013	AGGGG	2	10	66793	66802	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014013	CCCCT	2	10	66864	66873	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
11	NC_014013	AGGGG	2	10	66876	66885	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014013	CTTGG	2	10	82563	82572	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014013	CGATG	2	10	86868	86877	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014013	CGCGG	2	10	93843	93852	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15	NC_014013	GGGGC	2	10	102458	102467	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014013	GCGCC	2	10	115134	115143	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
17	NC_014013	TCGTG	2	10	120266	120275	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014013	ATTGG	2	10	122888	122897	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014013	AAGAT	2	10	124096	124105	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014013	GGGGC	2	10	134175	134184	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014013	CGTCC	2	10	136056	136065	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_014013	CCGGC	2	10	142046	142055	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23	NC_014013	TTCGG	2	10	152667	152676	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014013	GGCCG	2	10	156288	156297	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_014013	GCAGC	2	10	156987	156996	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_014013	TTATT	2	10	168563	168572	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014013	GGCGC	2	10	171573	171582	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28	NC_014013	ATCAA	2	10	172653	172662	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014013	GACCG	2	10	176676	176685	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_014013	GCCCC	2	10	176791	176800	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
31	NC_014013	GGCAG	2	10	210878	210887	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014013	CAGGC	2	10	215981	215990	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_014013	TGAAG	2	10	218670	218679	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014013	GAAGG	2	10	239057	239066	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014013	CAAAA	2	10	287570	287579	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014013	TCGTG	2	10	309568	309577	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_014013	AAGCC	2	10	310258	310267	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_014013	ATTGG	2	10	312356	312365	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014013	AAGAT	2	10	313564	313573	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014013	AAGGC	2	10	316382	316391	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014013	CGATC	2	10	316534	316543	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_014013	GCCGC	2	10	324458	324467	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
43	NC_014013	TCCCA	2	10	340266	340275	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
44	NC_014013	CCCGT	2	10	343377	343386	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_014013	GCAAG	2	10	384712	384721	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014013	GCCGC	2	10	398740	398749	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
47	NC_014013	TGGCG	2	10	414561	414570	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014013	GCCCT	2	10	415979	415988	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
49	NC_014013	CGCGC	3	15	436018	436032	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
50	NC_014013	GCGCC	2	10	441874	441883	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
51	NC_014013	CATAA	2	10	461389	461398	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014013	GCCGG	2	10	461427	461436	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
53	NC_014013	TTATG	2	10	470407	470416	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014013	CCGGA	2	10	473355	473364	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_014013	GGCCG	2	10	476362	476371	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
56	NC_014013	GCCGC	2	10	488560	488569	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
57	NC_014013	TCCCC	2	10	492941	492950	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
58	NC_014013	GCGGG	2	10	511538	511547	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014013	GCGCG	2	10	511637	511646	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
60	NC_014013	CAATT	2	10	522862	522871	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014013	ATCGG	2	10	523065	523074	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014013	CCGCC	2	10	538205	538214	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
63	NC_014013	GCGGG	2	10	543820	543829	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
64	NC_014013	CCAAT	2	10	543952	543961	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_014013	GCTAT	2	10	544344	544353	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014013	AGCTC	2	10	553459	553468	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_014013	CGGAC	2	10	561554	561563	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_014013	CGTCC	2	10	562225	562234	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
69	NC_014013	GCCGG	2	10	566358	566367	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
70	NC_014013	GTCGG	2	10	567744	567753	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014013	GGCCG	2	10	568796	568805	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
72	NC_014013	CGGCC	2	10	569811	569820	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
73	NC_014013	TCTCC	2	10	573395	573404	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
74	NC_014013	CGCGC	2	10	573568	573577	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
75	NC_014013	TCCGC	2	10	593623	593632	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
76	NC_014013	CTGCG	2	10	599769	599778	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_014013	GCGCG	2	10	600725	600734	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
78	NC_014013	TCGCC	2	10	621057	621066	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
79	NC_014013	CTGAA	2	10	621067	621076	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_014013	CGGAT	2	10	621211	621220	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014013	CCCGG	2	10	647679	647688	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
82	NC_014013	GGCCA	2	10	657944	657953	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_014013	GCCCC	2	10	658000	658009	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
84	NC_014013	CGCTC	2	10	672763	672772	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.