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Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 2699

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014012	TACT	2	8	787	794	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014012	TTAT	2	8	805	812	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014012	GAGT	2	8	6229	6236	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014012	TGAG	2	8	10167	10174	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014012	GTTA	2	8	10363	10370	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014012	ATTA	2	8	10498	10505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014012	GTTA	2	8	10563	10570	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014012	TGTT	2	8	10818	10825	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014012	CCAT	2	8	13245	13252	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014012	CCTA	2	8	13294	13301	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014012	CGAG	2	8	16669	16676	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014012	ATGC	2	8	16867	16874	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014012	GTAG	2	8	19075	19082	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014012	ATGG	2	8	19125	19132	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014012	AAGT	2	8	19302	19309	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014012	CAAA	2	8	19743	19750	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014012	AGTA	2	8	21830	21837	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014012	TTTA	2	8	25181	25188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014012	TTTA	2	8	25835	25842	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014012	ATTT	2	8	29899	29906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014012	CCTA	2	8	29912	29919	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014012	TCAT	2	8	29984	29991	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014012	GATC	2	8	30014	30021	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014012	ATCT	2	8	30112	30119	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014012	ATGG	2	8	32854	32861	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014012	TTAC	2	8	40143	40150	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014012	AGCT	2	8	44380	44387	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014012	AAGT	2	8	44488	44495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014012	GAAG	2	8	45140	45147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014012	ATTG	2	8	48734	48741	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014012	GGAG	2	8	48932	48939	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014012	TCAC	2	8	49827	49834	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014012	TTGG	2	8	51232	51239	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014012	TAAA	2	8	51294	51301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014012	TTCC	2	8	53383	53390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014012	TTAT	2	8	55784	55791	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014012	ATTT	2	8	57171	57178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014012	TTTA	2	8	59520	59527	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014012	TTAA	2	8	60820	60827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014012	ATCA	2	8	60971	60978	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014012	TTAT	2	8	61123	61130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014012	TAAT	2	8	61332	61339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014012	CTAG	2	8	61577	61584	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014012	GGCA	2	8	61625	61632	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014012	ACCA	2	8	62004	62011	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014012	AATA	2	8	63619	63626	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014012	AGTT	2	8	67854	67861	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014012	CAAT	2	8	67903	67910	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014012	AACA	2	8	67990	67997	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014012	CCCG	2	8	69265	69272	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_014012	ATGG	2	8	70871	70878	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014012	AAAT	2	8	70879	70886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014012	ATGG	2	8	70987	70994	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014012	TAAA	2	8	74221	74228	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014012	TAAA	2	8	74235	74242	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014012	TTGA	2	8	75423	75430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014012	TAAG	2	8	77740	77747	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014012	AGGT	2	8	78534	78541	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014012	ATAA	3	12	79823	79834	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014012	GCGA	2	8	80196	80203	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014012	CTGA	2	8	80375	80382	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014012	CGTC	2	8	80900	80907	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014012	AAAG	2	8	81023	81030	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014012	ATTG	2	8	81804	81811	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014012	GAAG	2	8	82589	82596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014012	TTTA	2	8	82944	82951	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014012	CGAA	2	8	83195	83202	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014012	ACGT	2	8	83484	83491	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014012	ATTT	2	8	84927	84934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014012	TCTA	2	8	86272	86279	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_014012	CTAT	2	8	86310	86317	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014012	TGAC	2	8	86409	86416	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_014012	TATT	2	8	86525	86532	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014012	ATAC	2	8	86654	86661	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014012	TAAA	2	8	86929	86936	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014012	TAAG	2	8	87085	87092	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014012	AGGT	2	8	87880	87887	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014012	ACTT	2	8	89111	89118	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014012	ATAA	3	12	89151	89162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014012	GCGA	2	8	89524	89531	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014012	CTGA	2	8	89703	89710	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014012	CGTC	2	8	90228	90235	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014012	AAAG	2	8	90351	90358	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014012	ATTG	2	8	91132	91139	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014012	GAAG	2	8	91917	91924	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014012	TTTA	2	8	92272	92279	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014012	GTAG	2	8	92952	92959	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014012	GTTA	2	8	96227	96234	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014012	ATGC	2	8	97741	97748	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014012	CACT	2	8	97843	97850	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014012	CATG	2	8	99927	99934	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_014012	TCGT	2	8	100075	100082	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014012	ATTT	2	8	100277	100284	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014012	AAGT	2	8	100404	100411	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014012	TAAA	2	8	102013	102020	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014012	ATTT	2	8	102265	102272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014012	AAAT	2	8	102295	102302	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014012	GGCT	2	8	102736	102743	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_014012	GTTA	2	8	111632	111639	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014012	TGAC	2	8	114847	114854	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_014012	ATTG	2	8	116741	116748	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014012	GGAA	2	8	118001	118008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014012	AGCT	2	8	126526	126533	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014012	TCTA	2	8	134266	134273	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_014012	TAAG	2	8	134710	134717	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014012	AGTT	2	8	134806	134813	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014012	ATAA	2	8	135137	135144	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014012	CTAG	2	8	135208	135215	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014012	TAAA	2	8	135245	135252	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014012	TAAA	2	8	135701	135708	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014012	ATCA	2	8	135982	135989	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014012	GTTT	2	8	136766	136773	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014012	CTGA	2	8	139431	139438	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014012	AATA	2	8	142076	142083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014012	GCTT	2	8	142092	142099	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014012	ATTT	2	8	143155	143162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014012	TATT	2	8	143181	143188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014012	ATGA	2	8	143212	143219	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014012	TAAT	2	8	153993	154000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014012	TTTA	2	8	160556	160563	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014012	GGTT	2	8	161421	161428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014012	TGGC	2	8	163915	163922	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014012	ATTG	2	8	166416	166423	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014012	TGTT	2	8	166454	166461	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014012	ATAG	2	8	168156	168163	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014012	TTGC	2	8	168209	168216	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014012	ATTA	2	8	173024	173031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014012	TTTA	2	8	175377	175384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014012	TAAG	2	8	180170	180177	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014012	AAAT	2	8	180925	180932	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014012	AAGC	2	8	182057	182064	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014012	GATT	2	8	183776	183783	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014012	AGTT	2	8	183785	183792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014012	AGCA	2	8	186798	186805	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014012	TTTA	2	8	191842	191849	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014012	CGCC	2	8	192403	192410	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
137	NC_014012	CTTA	2	8	192511	192518	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014012	GATC	2	8	195209	195216	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014012	TTCT	2	8	195277	195284	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014012	CTTT	2	8	197765	197772	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014012	CTTG	2	8	209491	209498	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014012	AGAC	2	8	210428	210435	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014012	CCTG	2	8	214151	214158	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_014012	TAAC	2	8	218237	218244	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014012	ATTT	2	8	218993	219000	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014012	TTTG	2	8	221625	221632	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014012	CTAG	2	8	222727	222734	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_014012	ACTT	2	8	227698	227705	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_014012	TGTT	2	8	233044	233051	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014012	TTTG	2	8	234950	234957	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014012	ATCT	2	8	235343	235350	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_014012	TGGG	2	8	235433	235440	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014012	GTTT	2	8	237932	237939	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014012	TTTA	2	8	238549	238556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014012	TGCT	2	8	247199	247206	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
156	NC_014012	AATA	2	8	248670	248677	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014012	ATAA	2	8	248764	248771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014012	TTGA	2	8	249339	249346	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
159	NC_014012	GTTA	2	8	249464	249471	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
160	NC_014012	TATT	2	8	250814	250821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_014012	ATTA	2	8	251675	251682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014012	GATA	2	8	251692	251699	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_014012	AGTA	2	8	256007	256014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014012	ATGG	2	8	257259	257266	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_014012	GTTG	2	8	263244	263251	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
168	NC_014012	CAAT	2	8	263399	263406	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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170	NC_014012	TTAA	2	8	266847	266854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_014012	CTAG	2	8	267859	267866	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
172	NC_014012	TAGT	2	8	267950	267957	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
173	NC_014012	TGCC	2	8	272303	272310	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
174	NC_014012	ATCC	2	8	273294	273301	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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180	NC_014012	ATAA	2	8	276850	276857	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_014012	CATG	2	8	281531	281538	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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191	NC_014012	CTGA	2	8	290346	290353	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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194	NC_014012	ATTG	2	8	291775	291782	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_014012	TTTA	2	8	292915	292922	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_014012	ACGT	2	8	293222	293229	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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201	NC_014012	CTTG	2	8	294020	294027	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
202	NC_014012	CTGG	2	8	294536	294543	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
203	NC_014012	ATCT	2	8	298934	298941	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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221	NC_014012	GAAT	2	8	336556	336563	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
222	NC_014012	TTTA	2	8	337863	337870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
223	NC_014012	AAAG	2	8	338130	338137	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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232	NC_014012	AATA	2	8	362853	362860	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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242	NC_014012	TTTA	2	8	392090	392097	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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245	NC_014012	ATGA	2	8	395326	395333	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_014012	ATAG	2	8	420360	420367	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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295	NC_014012	AAAT	2	8	490220	490227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_014012	ATGC	2	8	500133	500140	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
297	NC_014012	TATC	2	8	504404	504411	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
298	NC_014012	TCAA	2	8	505815	505822	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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487	NC_014012	TAAA	2	8	779522	779529	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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