MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 16562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014012	ATA	2	6	956269	956274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_014012	TTAG	2	8	956303	956310	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_014012	AAATTC	2	12	956367	956378	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3504	NC_014012	AAATT	2	10	956379	956388	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_014012	TTG	2	6	956409	956414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_014012	CGT	2	6	956416	956421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_014012	TTG	2	6	956424	956429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_014012	AGG	2	6	957049	957054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_014012	A	6	6	957109	957114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_014012	ATT	2	6	958756	958761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_014012	ATG	2	6	958790	958795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_014012	TGT	2	6	958802	958807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_014012	T	6	6	958807	958812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_014012	GTT	2	6	958845	958850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_014012	TTA	2	6	959124	959129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_014012	GTAA	2	8	961770	961777	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_014012	A	7	7	961806	961812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_014012	TTA	3	9	961831	961839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_014012	ATTG	2	8	961891	961898	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_014012	TCC	2	6	961904	961909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3521	NC_014012	CTT	2	6	961931	961936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_014012	AGGG	2	8	965372	965379	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_014012	GTTA	2	8	965398	965405	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_014012	AATG	2	8	966013	966020	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_014012	ATG	2	6	966093	966098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_014012	TTAA	2	8	966120	966127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_014012	TTC	2	6	966150	966155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_014012	ATG	2	6	966300	966305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_014012	CTAA	2	8	969703	969710	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3530	NC_014012	TTAA	2	8	969716	969723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_014012	GGA	2	6	969759	969764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_014012	G	6	6	969769	969774	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_014012	GGT	2	6	969897	969902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_014012	GT	3	6	969912	969917	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_014012	TCT	2	6	970119	970124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_014012	AAAGA	2	10	970126	970135	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_014012	TTA	2	6	970238	970243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_014012	ATT	2	6	970315	970320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_014012	CTA	2	6	970322	970327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_014012	ATT	2	6	970385	970390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_014012	GAC	2	6	970447	970452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_014012	ATT	2	6	970865	970870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_014012	G	6	6	970880	970885	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_014012	TAT	2	6	972149	972154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_014012	TA	3	6	972164	972169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_014012	CTAA	2	8	972227	972234	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3547	NC_014012	TAT	2	6	973786	973791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_014012	TTA	2	6	973792	973797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_014012	T	7	7	973862	973868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_014012	T	6	6	973874	973879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_014012	TCAT	2	8	976204	976211	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3552	NC_014012	GCCT	2	8	976248	976255	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3553	NC_014012	CTG	2	6	976275	976280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_014012	TG	3	6	976338	976343	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_014012	GGA	2	6	976521	976526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_014012	TTAC	2	8	976679	976686	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3557	NC_014012	TC	3	6	977569	977574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3558	NC_014012	T	6	6	979676	979681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_014012	TCA	2	6	979708	979713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_014012	CTTT	2	8	982723	982730	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3561	NC_014012	AT	3	6	982734	982739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_014012	ACAG	2	8	982750	982757	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3563	NC_014012	ATG	2	6	984356	984361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_014012	TAT	2	6	986212	986217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_014012	ATT	2	6	986235	986240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_014012	CAG	2	6	986301	986306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_014012	CAG	2	6	986372	986377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_014012	GCA	2	6	986401	986406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_014012	GAT	2	6	988574	988579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_014012	GT	3	6	988592	988597	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_014012	CAG	2	6	988622	988627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_014012	CAAT	2	8	988753	988760	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3573	NC_014012	GTT	2	6	988778	988783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_014012	A	6	6	988805	988810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_014012	T	8	8	990245	990252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_014012	TAT	2	6	990413	990418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_014012	TGT	2	6	990447	990452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_014012	TGA	2	6	990486	990491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_014012	TAT	2	6	990603	990608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_014012	TTTG	2	8	990734	990741	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_014012	ATT	2	6	990750	990755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_014012	TAAAAA	2	12	990757	990768	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_014012	ATC	2	6	993389	993394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_014012	GA	3	6	993403	993408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_014012	AG	3	6	993519	993524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_014012	TAATC	2	10	995234	995243	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3587	NC_014012	T	6	6	995260	995265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_014012	ATA	2	6	995283	995288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_014012	TAT	2	6	995298	995303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_014012	AGCA	2	8	995384	995391	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3591	NC_014012	GGC	2	6	995906	995911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_014012	AT	3	6	995939	995944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_014012	TAA	2	6	996006	996011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_014012	ATA	2	6	996017	996022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_014012	TTA	2	6	996042	996047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_014012	GAT	2	6	996065	996070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_014012	GTA	2	6	996087	996092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_014012	TAA	2	6	996138	996143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_014012	TAACA	2	10	996203	996212	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3600	NC_014012	TTAT	2	8	996223	996230	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_014012	AAC	2	6	1003377	1003382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_014012	A	6	6	1004689	1004694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_014012	TCT	2	6	1004763	1004768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_014012	TAAA	2	8	1004785	1004792	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_014012	TCT	2	6	1006537	1006542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_014012	TTG	2	6	1006550	1006555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_014012	TAT	2	6	1006617	1006622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_014012	CAG	2	6	1006636	1006641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_014012	TCAA	2	8	1006642	1006649	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3610	NC_014012	T	6	6	1006917	1006922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_014012	TCCT	2	8	1007016	1007023	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3612	NC_014012	ATC	2	6	1007041	1007046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_014012	TAT	2	6	1007067	1007072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_014012	CGTTTG	2	12	1007079	1007090	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3615	NC_014012	T	6	6	1007094	1007099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_014012	TATC	2	8	1007133	1007140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3617	NC_014012	TTA	2	6	1007151	1007156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_014012	TG	3	6	1007159	1007164	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_014012	ACTC	2	8	1007222	1007229	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3620	NC_014012	GCT	2	6	1010051	1010056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_014012	GAA	2	6	1010193	1010198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_014012	ATC	2	6	1010221	1010226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_014012	TTA	2	6	1012785	1012790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_014012	GAAT	2	8	1012791	1012798	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_014012	ATT	2	6	1012799	1012804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_014012	ATT	2	6	1012814	1012819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_014012	GTC	2	6	1012865	1012870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_014012	A	6	6	1012873	1012878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_014012	TATT	2	8	1012902	1012909	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_014012	AAT	2	6	1013436	1013441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_014012	TTGT	2	8	1014752	1014759	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_014012	TTG	2	6	1014814	1014819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3633	NC_014012	TC	3	6	1014828	1014833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3634	NC_014012	GA	3	6	1014854	1014859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3635	NC_014012	A	7	7	1019044	1019050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3636	NC_014012	GCA	2	6	1019173	1019178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3755	NC_014012	AGTC	2	8	1045144	1045151	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3763	NC_014012	A	7	7	1049568	1049574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3764	NC_014012	TTGCA	2	10	1049580	1049589	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3767	NC_014012	ATCAT	2	10	1050611	1050620	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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3901	NC_014012	GGT	2	6	1097809	1097814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3902	NC_014012	GTA	2	6	1097821	1097826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3903	NC_014012	GTT	2	6	1097837	1097842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3904	NC_014012	TTG	2	6	1097843	1097848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3905	NC_014012	TTG	3	9	1097850	1097858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3906	NC_014012	GGT	2	6	1097863	1097868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3907	NC_014012	TGG	2	6	1097872	1097877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3908	NC_014012	ATA	2	6	1101677	1101682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3909	NC_014012	CT	3	6	1108505	1108510	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3910	NC_014012	T	7	7	1108558	1108564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3911	NC_014012	TAT	2	6	1108578	1108583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3912	NC_014012	TAC	2	6	1108625	1108630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3913	NC_014012	GA	3	6	1108703	1108708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3914	NC_014012	GTT	2	6	1108741	1108746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3915	NC_014012	T	6	6	1109001	1109006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3916	NC_014012	AT	3	6	1109117	1109122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3917	NC_014012	GAG	2	6	1109160	1109165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3919	NC_014012	T	6	6	1109863	1109868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3920	NC_014012	TGA	2	6	1109884	1109889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3926	NC_014012	AAT	2	6	1115589	1115594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3927	NC_014012	AAAC	2	8	1115605	1115612	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3928	NC_014012	AATT	2	8	1115620	1115627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3929	NC_014012	GCTG	2	8	1115657	1115664	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3930	NC_014012	T	6	6	1115665	1115670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3931	NC_014012	AGCA	2	8	1115711	1115718	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3932	NC_014012	TAAG	2	8	1115726	1115733	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3933	NC_014012	TTTG	2	8	1115765	1115772	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3934	NC_014012	TTC	2	6	1115896	1115901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3935	NC_014012	CTTT	2	8	1116015	1116022	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3936	NC_014012	TTCTCC	2	12	1116044	1116055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3937	NC_014012	GTA	2	6	1116221	1116226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3938	NC_014012	AT	3	6	1116282	1116287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3939	NC_014012	CTATCA	2	12	1116298	1116309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3940	NC_014012	TGG	2	6	1116444	1116449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3941	NC_014012	T	6	6	1116485	1116490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3942	NC_014012	TGA	2	6	1116535	1116540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3943	NC_014012	AT	3	6	1116563	1116568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3944	NC_014012	TTTG	2	8	1118940	1118947	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3945	NC_014012	CAC	2	6	1118965	1118970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3947	NC_014012	TA	3	6	1119117	1119122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3948	NC_014012	ATT	2	6	1120641	1120646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3949	NC_014012	TTTA	2	8	1120659	1120666	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3950	NC_014012	GTAA	2	8	1120789	1120796	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3951	NC_014012	CTT	2	6	1120862	1120867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3954	NC_014012	GAA	2	6	1123008	1123013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3955	NC_014012	ACA	2	6	1123022	1123027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3959	NC_014012	TAGC	2	8	1123291	1123298	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3962	NC_014012	AGTA	2	8	1123465	1123472	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3963	NC_014012	TTTG	2	8	1123509	1123516	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3970	NC_014012	CTAT	2	8	1126114	1126121	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3979	NC_014012	G	6	6	1131741	1131746	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3980	NC_014012	A	6	6	1131750	1131755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3981	NC_014012	A	6	6	1131762	1131767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3982	NC_014012	ATGAA	2	10	1131910	1131919	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3983	NC_014012	A	6	6	1131921	1131926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3984	NC_014012	CCT	2	6	1131941	1131946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3985	NC_014012	TA	3	6	1132190	1132195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3987	NC_014012	CTG	2	6	1132312	1132317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3994	NC_014012	T	7	7	1132808	1132814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4000	NC_014012	ATC	2	6	1133478	1133483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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