MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 16562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_014012	ATT	2	6	4937803	4937808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16502	NC_014012	AGT	2	6	4941719	4941724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16503	NC_014012	ACAG	2	8	4941742	4941749	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16504	NC_014012	ATT	2	6	4941759	4941764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16505	NC_014012	TTA	2	6	4941806	4941811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16506	NC_014012	AAGA	2	8	4941833	4941840	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16507	NC_014012	ATA	2	6	4941908	4941913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16508	NC_014012	CAAA	2	8	4942040	4942047	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16509	NC_014012	ACC	2	6	4942060	4942065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16510	NC_014012	CCA	2	6	4942087	4942092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16511	NC_014012	CAGA	2	8	4942112	4942119	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16512	NC_014012	A	6	6	4942275	4942280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16513	NC_014012	TGTGA	2	10	4942290	4942299	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16514	NC_014012	AAG	2	6	4942313	4942318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16515	NC_014012	TAAA	2	8	4942366	4942373	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16516	NC_014012	TTAA	2	8	4942376	4942383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16517	NC_014012	TAA	2	6	4942388	4942393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16518	NC_014012	GGC	2	6	4942450	4942455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16519	NC_014012	GC	3	6	4942463	4942468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16520	NC_014012	A	6	6	4942529	4942534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16521	NC_014012	A	7	7	4942550	4942556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16522	NC_014012	ATG	2	6	4942577	4942582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16523	NC_014012	AC	3	6	4942733	4942738	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16524	NC_014012	GTTTC	2	10	4945424	4945433	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16525	NC_014012	AATT	2	8	4945469	4945476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16526	NC_014012	TTC	2	6	4945510	4945515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16527	NC_014012	A	6	6	4945557	4945562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16528	NC_014012	AT	3	6	4945585	4945590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16529	NC_014012	TACAA	2	10	4947862	4947871	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16530	NC_014012	AGA	2	6	4947911	4947916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16531	NC_014012	A	6	6	4947916	4947921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16532	NC_014012	ACA	2	6	4947923	4947928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16533	NC_014012	CAT	2	6	4947933	4947938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16534	NC_014012	TTTG	2	8	4947954	4947961	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16535	NC_014012	A	6	6	4947980	4947985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16536	NC_014012	T	6	6	4948004	4948009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16537	NC_014012	A	6	6	4949427	4949432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16538	NC_014012	AAG	3	9	4949494	4949502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16539	NC_014012	GA	4	8	4949578	4949585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16540	NC_014012	TTAC	2	8	4949623	4949630	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16541	NC_014012	AG	3	6	4949631	4949636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16542	NC_014012	T	6	6	4949710	4949715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16543	NC_014012	TAA	2	6	4950155	4950160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16544	NC_014012	AAG	2	6	4950171	4950176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16545	NC_014012	ACG	3	9	4950194	4950202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16546	NC_014012	TTAC	2	8	4950302	4950309	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16547	NC_014012	AG	3	6	4950310	4950315	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16548	NC_014012	GCA	2	6	4950317	4950322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16549	NC_014012	TCCT	2	8	4950327	4950334	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16550	NC_014012	T	7	7	4950351	4950357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16551	NC_014012	CCAT	2	8	4950358	4950365	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16552	NC_014012	A	6	6	4950394	4950399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16553	NC_014012	TCA	2	6	4950429	4950434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16554	NC_014012	CCT	2	6	4955820	4955825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16555	NC_014012	TAGT	2	8	4956129	4956136	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16556	NC_014012	A	7	7	4956149	4956155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16557	NC_014012	TTC	3	9	4957350	4957358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16558	NC_014012	ATA	2	6	4957549	4957554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16559	NC_014012	TA	3	6	4959287	4959292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16560	NC_014012	AAAG	2	8	4959337	4959344	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16561	NC_014012	TAA	2	6	4959989	4959994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16562	NC_014012	TAT	2	6	4960019	4960024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.