MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 16562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014012	GTT	2	6	100446	100451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_014012	A	6	6	100452	100457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_014012	GGT	2	6	100458	100463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_014012	ACC	2	6	100467	100472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_014012	T	6	6	100473	100478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_014012	T	6	6	101137	101142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_014012	AACAT	2	10	101258	101267	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
508	NC_014012	TAAA	2	8	102013	102020	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_014012	T	6	6	102034	102039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_014012	T	8	8	102048	102055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_014012	TGG	2	6	102073	102078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_014012	AG	3	6	102093	102098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
513	NC_014012	A	7	7	102110	102116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_014012	CAA	2	6	102171	102176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_014012	TCA	2	6	102187	102192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_014012	AATCA	2	10	102233	102242	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
517	NC_014012	ATTT	2	8	102265	102272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_014012	A	7	7	102279	102285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_014012	AAAT	2	8	102295	102302	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_014012	TA	3	6	102333	102338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_014012	AAT	2	6	102399	102404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_014012	TGT	2	6	102489	102494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_014012	T	6	6	102494	102499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_014012	TGG	2	6	102521	102526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_014012	ATC	2	6	102560	102565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_014012	T	6	6	102577	102582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_014012	TAA	2	6	102603	102608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_014012	CAG	2	6	102629	102634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_014012	GGCT	2	8	102736	102743	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
530	NC_014012	AC	3	6	105629	105634	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
531	NC_014012	A	6	6	105738	105743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_014012	ATC	2	6	105772	105777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_014012	ATT	2	6	105794	105799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_014012	AAT	2	6	105876	105881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_014012	TGT	2	6	105896	105901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_014012	AT	3	6	105921	105926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_014012	CAA	2	6	106658	106663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_014012	GAG	2	6	106673	106678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_014012	AG	3	6	106677	106682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
540	NC_014012	GTC	2	6	106741	106746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_014012	CTT	2	6	106765	106770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_014012	AGC	2	6	106774	106779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_014012	CTG	2	6	106781	106786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_014012	TTA	2	6	107650	107655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_014012	GGC	2	6	110509	110514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_014012	T	7	7	110547	110553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_014012	A	7	7	110605	110611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_014012	TTG	2	6	110645	110650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_014012	AGG	2	6	110712	110717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_014012	GTTA	2	8	111632	111639	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
551	NC_014012	GCTCA	2	10	113938	113947	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
552	NC_014012	GAA	2	6	113971	113976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_014012	TGAC	2	8	114847	114854	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
554	NC_014012	TGA	2	6	115110	115115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_014012	ATT	2	6	115181	115186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_014012	TTA	2	6	115187	115192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_014012	CTGAG	2	10	115768	115777	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
558	NC_014012	TGAAA	2	10	116667	116676	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
559	NC_014012	ATAAAT	2	12	116704	116715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_014012	ATTG	2	8	116741	116748	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
561	NC_014012	CT	3	6	116850	116855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_014012	TG	3	6	117927	117932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
563	NC_014012	GGAA	2	8	118001	118008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
564	NC_014012	AC	3	6	122866	122871	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
565	NC_014012	TTG	2	6	122872	122877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_014012	ATG	2	6	122962	122967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_014012	TCA	2	6	123004	123009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_014012	AAG	2	6	123082	123087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_014012	AAT	2	6	124186	124191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_014012	T	6	6	125190	125195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_014012	TGAGC	2	10	125203	125212	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
572	NC_014012	ATA	2	6	125223	125228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_014012	ATT	2	6	126278	126283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_014012	ATA	2	6	126359	126364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_014012	TGT	2	6	126466	126471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_014012	AGCT	2	8	126526	126533	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
577	NC_014012	ATC	2	6	128056	128061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_014012	GT	3	6	128073	128078	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
579	NC_014012	AGG	2	6	130160	130165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_014012	AGC	2	6	130214	130219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_014012	AT	3	6	131783	131788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_014012	T	6	6	134248	134253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_014012	TCTA	2	8	134266	134273	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
584	NC_014012	AGC	2	6	134293	134298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_014012	GGA	2	6	134516	134521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_014012	A	9	9	134599	134607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_014012	GT	3	6	134637	134642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
588	NC_014012	TAAG	2	8	134710	134717	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
589	NC_014012	ATA	2	6	134742	134747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_014012	ATCATT	2	12	134748	134759	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
591	NC_014012	TAA	2	6	134790	134795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_014012	AGTT	2	8	134806	134813	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
593	NC_014012	TGT	2	6	134845	134850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_014012	ACT	3	9	134869	134877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_014012	ATA	2	6	134978	134983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_014012	TGC	2	6	135007	135012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_014012	AAG	2	6	135026	135031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_014012	ATG	2	6	135032	135037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_014012	A	7	7	135123	135129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_014012	ATAA	2	8	135137	135144	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_014012	GT	3	6	135161	135166	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
602	NC_014012	CTAG	2	8	135208	135215	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
603	NC_014012	TAAA	2	8	135245	135252	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_014012	ATCATT	2	12	135315	135326	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
605	NC_014012	TAT	2	6	135339	135344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_014012	ATT	2	6	135352	135357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_014012	GTG	2	6	135459	135464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_014012	GAA	2	6	135508	135513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_014012	GCT	2	6	135523	135528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_014012	TTG	2	6	135536	135541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_014012	A	7	7	135578	135584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_014012	A	6	6	135594	135599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_014012	GT	3	6	135616	135621	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
614	NC_014012	TAAA	2	8	135701	135708	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_014012	ATCATT	2	12	135771	135782	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
616	NC_014012	AAT	2	6	135867	135872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_014012	AG	3	6	135911	135916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
618	NC_014012	ATCA	2	8	135982	135989	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
619	NC_014012	TTTAAG	2	12	136661	136672	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_014012	CGT	2	6	136696	136701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_014012	TGACTA	2	12	136724	136735	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
622	NC_014012	TG	3	6	136751	136756	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
623	NC_014012	GTTT	2	8	136766	136773	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
624	NC_014012	GGC	2	6	136785	136790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_014012	TA	3	6	136795	136800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_014012	TAT	2	6	136833	136838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_014012	AGA	2	6	136892	136897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_014012	ATT	2	6	136917	136922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_014012	AC	3	6	139127	139132	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_014012	TTA	2	6	139189	139194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_014012	TAA	2	6	139205	139210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_014012	CTGA	2	8	139431	139438	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
633	NC_014012	GTG	2	6	139484	139489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_014012	AAT	2	6	139572	139577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_014012	ATA	2	6	139589	139594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_014012	G	8	8	139653	139660	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
637	NC_014012	CT	3	6	141570	141575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
638	NC_014012	AATA	2	8	142076	142083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_014012	GCTT	2	8	142092	142099	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
640	NC_014012	CTT	2	6	142149	142154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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642	NC_014012	TATT	2	8	143181	143188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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652	NC_014012	AT	3	6	154035	154040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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759	NC_014012	ATT	2	6	192087	192092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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772	NC_014012	ATG	2	6	192698	192703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
773	NC_014012	TA	3	6	192713	192718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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780	NC_014012	T	6	6	193618	193623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
781	NC_014012	TCA	2	6	195125	195130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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783	NC_014012	TCA	2	6	195269	195274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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785	NC_014012	AGATT	2	10	197679	197688	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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788	NC_014012	ATT	2	6	197794	197799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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790	NC_014012	ATA	2	6	197834	197839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
791	NC_014012	CAT	2	6	197870	197875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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794	NC_014012	ATG	2	6	201457	201462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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802	NC_014012	ATC	2	6	207267	207272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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812	NC_014012	TGT	2	6	214989	214994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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822	NC_014012	AAT	2	6	219001	219006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
823	NC_014012	ATT	2	6	219963	219968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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911	NC_014012	AGTA	2	8	256007	256014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
912	NC_014012	A	7	7	256060	256066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
913	NC_014012	AAG	2	6	256074	256079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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915	NC_014012	GT	3	6	256121	256126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
916	NC_014012	TCA	2	6	256155	256160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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918	NC_014012	TTG	2	6	256218	256223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
919	NC_014012	CTG	2	6	257211	257216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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921	NC_014012	ATGG	2	8	257259	257266	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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924	NC_014012	TTAG	2	8	262652	262659	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
925	NC_014012	TTG	2	6	263177	263182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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927	NC_014012	GTTG	2	8	263244	263251	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
928	NC_014012	CAAT	2	8	263399	263406	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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931	NC_014012	GA	3	6	264762	264767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
932	NC_014012	CCT	2	6	265715	265720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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942	NC_014012	TTG	2	6	267983	267988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
943	NC_014012	AGA	2	6	268057	268062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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947	NC_014012	TTA	2	6	269914	269919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
948	NC_014012	TAT	2	6	269943	269948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
949	NC_014012	AAT	2	6	271012	271017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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951	NC_014012	AGG	2	6	272324	272329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
952	NC_014012	T	7	7	272336	272342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
953	NC_014012	CAT	2	6	272392	272397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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956	NC_014012	TA	3	6	272495	272500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
957	NC_014012	A	7	7	272578	272584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
958	NC_014012	AAT	2	6	273198	273203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
959	NC_014012	CTT	2	6	273207	273212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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962	NC_014012	GCCCTT	2	12	273323	273334	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
963	NC_014012	ATGC	2	8	273371	273378	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
964	NC_014012	AAT	2	6	273412	273417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
965	NC_014012	TTG	2	6	273426	273431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
966	NC_014012	A	6	6	273438	273443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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969	NC_014012	AT	3	6	273514	273519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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989	NC_014012	ATAA	2	8	276850	276857	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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996	NC_014012	T	6	6	281457	281462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1000	NC_014012	ATT	2	6	281595	281600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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