MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 16562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_014012	AGA	2	6	2523677	2523682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8502	NC_014012	GCG	2	6	2524947	2524952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8503	NC_014012	CAA	2	6	2524970	2524975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8504	NC_014012	GCC	2	6	2524976	2524981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8505	NC_014012	AGT	2	6	2525008	2525013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8506	NC_014012	ACT	2	6	2525034	2525039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8507	NC_014012	GTA	2	6	2525057	2525062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_014012	AGAAA	2	10	2525171	2525180	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_014012	TTC	2	6	2525425	2525430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8510	NC_014012	TAT	2	6	2525557	2525562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8511	NC_014012	CTT	2	6	2525660	2525665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8512	NC_014012	ATA	2	6	2525671	2525676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_014012	ATT	2	6	2525694	2525699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8514	NC_014012	A	6	6	2526920	2526925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8515	NC_014012	TTC	2	6	2527045	2527050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8516	NC_014012	AGC	2	6	2527103	2527108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8517	NC_014012	ATT	2	6	2527266	2527271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_014012	CT	3	6	2528536	2528541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8519	NC_014012	ATT	2	6	2528569	2528574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8520	NC_014012	CTTT	2	8	2528586	2528593	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8521	NC_014012	CAG	2	6	2528608	2528613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8522	NC_014012	TC	3	6	2528698	2528703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8523	NC_014012	AAAG	2	8	2528725	2528732	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8524	NC_014012	CTT	2	6	2530396	2530401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8525	NC_014012	CATT	2	8	2530433	2530440	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8526	NC_014012	A	6	6	2530542	2530547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8527	NC_014012	TATC	2	8	2530548	2530555	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8528	NC_014012	ATTAAA	2	12	2530611	2530622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8529	NC_014012	TAGA	2	8	2533393	2533400	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8530	NC_014012	CCA	2	6	2533849	2533854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8531	NC_014012	CAG	2	6	2533948	2533953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8532	NC_014012	TTA	2	6	2534002	2534007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8533	NC_014012	AGA	2	6	2534100	2534105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8534	NC_014012	CTTA	2	8	2534110	2534117	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8535	NC_014012	TTAA	2	8	2534187	2534194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_014012	CCA	2	6	2534199	2534204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8537	NC_014012	A	6	6	2534846	2534851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_014012	TTTG	2	8	2534884	2534891	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8539	NC_014012	ATT	2	6	2536552	2536557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8540	NC_014012	ACAT	2	8	2536640	2536647	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8541	NC_014012	CAC	2	6	2536698	2536703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8542	NC_014012	TCAC	2	8	2536736	2536743	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8543	NC_014012	T	6	6	2536806	2536811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8544	NC_014012	ACG	2	6	2536828	2536833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8545	NC_014012	TTA	2	6	2536874	2536879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_014012	T	6	6	2537250	2537255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_014012	AT	3	6	2537296	2537301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_014012	GGC	2	6	2537338	2537343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8549	NC_014012	ATA	2	6	2537367	2537372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8550	NC_014012	CTC	2	6	2537379	2537384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8551	NC_014012	CCA	2	6	2539572	2539577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8552	NC_014012	T	7	7	2539609	2539615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_014012	A	8	8	2539639	2539646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_014012	T	7	7	2539668	2539674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_014012	AT	3	6	2539676	2539681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_014012	GTCT	2	8	2539682	2539689	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8557	NC_014012	TCA	2	6	2540412	2540417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8558	NC_014012	AGC	2	6	2540545	2540550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8559	NC_014012	AGC	2	6	2541613	2541618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8560	NC_014012	TAGTCT	6	36	2541684	2541719	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8561	NC_014012	TAG	2	6	2541720	2541725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8562	NC_014012	T	6	6	2543315	2543320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8563	NC_014012	GGA	2	6	2543380	2543385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8564	NC_014012	AT	3	6	2543484	2543489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_014012	TA	3	6	2543853	2543858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8566	NC_014012	TAAT	2	8	2543863	2543870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8567	NC_014012	TGA	2	6	2543910	2543915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_014012	ATT	2	6	2545341	2545346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8569	NC_014012	GTGA	2	8	2546336	2546343	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8570	NC_014012	CGG	2	6	2546382	2546387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8571	NC_014012	ACT	2	6	2547316	2547321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8572	NC_014012	TCT	2	6	2547376	2547381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8573	NC_014012	TAA	2	6	2547460	2547465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8574	NC_014012	TCA	2	6	2547667	2547672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8575	NC_014012	CAT	2	6	2547707	2547712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8576	NC_014012	TTA	2	6	2547713	2547718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8577	NC_014012	T	6	6	2547732	2547737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8578	NC_014012	TAA	2	6	2547818	2547823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8579	NC_014012	CAA	2	6	2547834	2547839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8580	NC_014012	AAC	2	6	2548240	2548245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8581	NC_014012	CGA	2	6	2548287	2548292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8582	NC_014012	AAGC	2	8	2548300	2548307	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8583	NC_014012	CCT	2	6	2548354	2548359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8584	NC_014012	GA	3	6	2550991	2550996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8585	NC_014012	CT	3	6	2554150	2554155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8586	NC_014012	AAAG	2	8	2554157	2554164	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8587	NC_014012	TTTTAG	2	12	2554166	2554177	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8588	NC_014012	T	6	6	2554207	2554212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8589	NC_014012	A	8	8	2554243	2554250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8590	NC_014012	GT	3	6	2554349	2554354	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8591	NC_014012	A	6	6	2554388	2554393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8592	NC_014012	ACT	2	6	2554412	2554417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8593	NC_014012	ATC	2	6	2554448	2554453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8594	NC_014012	TC	3	6	2556923	2556928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8595	NC_014012	AG	3	6	2557002	2557007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8596	NC_014012	CAA	2	6	2557943	2557948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8597	NC_014012	TCG	2	6	2557949	2557954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8598	NC_014012	ATC	2	6	2557965	2557970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8599	NC_014012	T	6	6	2558296	2558301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8600	NC_014012	ATA	2	6	2558379	2558384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8601	NC_014012	CCA	2	6	2559188	2559193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8602	NC_014012	CAT	2	6	2559207	2559212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8603	NC_014012	CCT	2	6	2559217	2559222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8604	NC_014012	AAT	2	6	2559239	2559244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8605	NC_014012	C	7	7	2561086	2561092	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8606	NC_014012	CAA	2	6	2561108	2561113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8607	NC_014012	CAT	2	6	2561114	2561119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8608	NC_014012	CAT	2	6	2561132	2561137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8609	NC_014012	ATT	2	6	2562195	2562200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8610	NC_014012	TCC	2	6	2563106	2563111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8611	NC_014012	TC	3	6	2567753	2567758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8612	NC_014012	CAT	2	6	2567775	2567780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8613	NC_014012	AATA	2	8	2567793	2567800	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8614	NC_014012	TTAT	2	8	2569733	2569740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8615	NC_014012	ACTA	2	8	2569750	2569757	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8616	NC_014012	T	6	6	2569766	2569771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8617	NC_014012	ATCG	2	8	2569777	2569784	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8618	NC_014012	ATTC	2	8	2569786	2569793	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8619	NC_014012	A	6	6	2570853	2570858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8620	NC_014012	ATA	2	6	2572224	2572229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8621	NC_014012	CTG	2	6	2573323	2573328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8622	NC_014012	A	6	6	2574765	2574770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8623	NC_014012	TTAA	2	8	2574788	2574795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8624	NC_014012	GTC	2	6	2574819	2574824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8625	NC_014012	GCA	2	6	2574828	2574833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8626	NC_014012	GCA	2	6	2574845	2574850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8627	NC_014012	CAAT	2	8	2574899	2574906	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8628	NC_014012	GAT	2	6	2575236	2575241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8629	NC_014012	ATGTA	2	10	2575320	2575329	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8630	NC_014012	ATTA	2	8	2576431	2576438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8631	NC_014012	A	6	6	2577056	2577061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8632	NC_014012	TAAT	2	8	2577114	2577121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8633	NC_014012	TCC	2	6	2577126	2577131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8634	NC_014012	ATGC	2	8	2577142	2577149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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8636	NC_014012	AT	3	6	2579108	2579113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8762	NC_014012	T	7	7	2635272	2635278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8763	NC_014012	A	6	6	2637221	2637226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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