MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 16562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014012	TTA	2	6	1770149	1770154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_014012	TGG	2	6	1770176	1770181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_014012	CCT	2	6	1770209	1770214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6004	NC_014012	TTA	2	6	1770288	1770293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_014012	TGG	2	6	1770314	1770319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_014012	CCT	2	6	1770347	1770352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_014012	TTA	2	6	1770426	1770431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_014012	TGG	2	6	1770452	1770457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_014012	CCT	2	6	1770485	1770490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6010	NC_014012	TAC	2	6	1770540	1770545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_014012	TGG	2	6	1770573	1770578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_014012	CCT	2	6	1770606	1770611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_014012	TG	3	6	1770653	1770658	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_014012	TAT	2	6	1770665	1770670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_014012	G	6	6	1770672	1770677	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_014012	T	6	6	1770697	1770702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_014012	TTA	2	6	1770765	1770770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_014012	CTT	2	6	1770804	1770809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_014012	GGGA	2	8	1770818	1770825	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_014012	GCT	2	6	1770876	1770881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_014012	ATG	2	6	1770900	1770905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_014012	TCGAG	2	10	1770919	1770928	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6023	NC_014012	TA	3	6	1770941	1770946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_014012	TA	3	6	1770970	1770975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_014012	ATA	2	6	1771015	1771020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_014012	AAT	2	6	1771040	1771045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_014012	GTAA	2	8	1771050	1771057	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_014012	CTT	2	6	1771062	1771067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_014012	CATT	2	8	1771108	1771115	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6030	NC_014012	TA	3	6	1771142	1771147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_014012	TAG	2	6	1772644	1772649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_014012	CCA	2	6	1772752	1772757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6033	NC_014012	CTT	2	6	1772771	1772776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_014012	GAGT	2	8	1772819	1772826	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_014012	AGGTA	2	10	1772827	1772836	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_014012	TTTG	2	8	1772876	1772883	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_014012	AATG	2	8	1772896	1772903	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_014012	TTGT	2	8	1772951	1772958	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_014012	CT	3	6	1772973	1772978	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6040	NC_014012	GAAT	2	8	1773056	1773063	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_014012	CGG	2	6	1773109	1773114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_014012	ATTT	2	8	1773148	1773155	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_014012	CT	3	6	1773194	1773199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6044	NC_014012	CGG	2	6	1773338	1773343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_014012	ATTT	2	8	1773377	1773384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_014012	CT	3	6	1773423	1773428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6047	NC_014012	CGG	2	6	1773589	1773594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_014012	GAAT	2	8	1773664	1773671	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_014012	CGG	2	6	1773717	1773722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_014012	ATTT	2	8	1773756	1773763	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_014012	CT	3	6	1773801	1773806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6052	NC_014012	CGG	2	6	1773945	1773950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_014012	ATTT	2	8	1773984	1773991	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_014012	CT	3	6	1774030	1774035	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6055	NC_014012	CGG	2	6	1774197	1774202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_014012	GAAT	2	8	1774272	1774279	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_014012	CGG	2	6	1774325	1774330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_014012	T	7	7	1774373	1774379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_014012	TTG	2	6	1774383	1774388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_014012	CGG	2	6	1774543	1774548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_014012	ATTT	2	8	1774582	1774589	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_014012	CT	3	6	1774628	1774633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6063	NC_014012	CGG	2	6	1774771	1774776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_014012	ATTT	2	8	1774810	1774817	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_014012	CT	3	6	1774856	1774861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6066	NC_014012	CGG	2	6	1774999	1775004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_014012	CCA	2	6	1775147	1775152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6068	NC_014012	ACC	2	6	1775196	1775201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6069	NC_014012	GGT	2	6	1775206	1775211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_014012	T	7	7	1775211	1775217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_014012	CTT	2	6	1775252	1775257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_014012	AGC	2	6	1775307	1775312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_014012	ATC	2	6	1775420	1775425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_014012	AT	3	6	1775506	1775511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_014012	GCC	2	6	1775512	1775517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6076	NC_014012	A	7	7	1775557	1775563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_014012	ATG	2	6	1775573	1775578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_014012	TCT	2	6	1775586	1775591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_014012	ATT	2	6	1777457	1777462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_014012	T	6	6	1777514	1777519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_014012	TCT	2	6	1779709	1779714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_014012	CTG	2	6	1779784	1779789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_014012	GCTA	2	8	1781159	1781166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6084	NC_014012	TA	3	6	1781174	1781179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_014012	T	7	7	1781206	1781212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_014012	ATAA	2	8	1781237	1781244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_014012	TGT	2	6	1781756	1781761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_014012	GGGAT	2	10	1781810	1781819	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_014012	TGT	2	6	1781883	1781888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_014012	TAA	2	6	1781987	1781992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_014012	TGT	2	6	1782031	1782036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_014012	TGC	2	6	1782052	1782057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_014012	ATA	2	6	1782134	1782139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_014012	CT	3	6	1782169	1782174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6095	NC_014012	TCA	2	6	1782181	1782186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_014012	ATA	2	6	1782258	1782263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_014012	CT	3	6	1782293	1782298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6098	NC_014012	TCA	2	6	1782305	1782310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_014012	ATA	2	6	1782383	1782388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_014012	TGT	2	6	1782464	1782469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_014012	TTG	2	6	1782474	1782479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_014012	CCT	2	6	1782583	1782588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6103	NC_014012	ATT	2	6	1782773	1782778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_014012	GAG	2	6	1782825	1782830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_014012	G	6	6	1782914	1782919	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_014012	ATTT	2	8	1782974	1782981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_014012	TTA	3	9	1783902	1783910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_014012	TGC	2	6	1783911	1783916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_014012	GTC	2	6	1783931	1783936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_014012	GAAG	2	8	1783989	1783996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_014012	TAAGGT	2	12	1784007	1784018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_014012	ATA	3	9	1784061	1784069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_014012	GAAAG	2	10	1788559	1788568	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_014012	A	6	6	1788589	1788594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_014012	A	6	6	1788596	1788601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_014012	TA	3	6	1788609	1788614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_014012	TTG	2	6	1788619	1788624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_014012	GAA	2	6	1788651	1788656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_014012	GTAA	2	8	1788674	1788681	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_014012	TAA	2	6	1788697	1788702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_014012	AAT	2	6	1788716	1788721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_014012	TCT	3	9	1788777	1788785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_014012	CAG	2	6	1788811	1788816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_014012	CAG	2	6	1788877	1788882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_014012	ATC	2	6	1788905	1788910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_014012	TGA	2	6	1788921	1788926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_014012	AGT	2	6	1788936	1788941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_014012	TTC	2	6	1793679	1793684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_014012	TA	3	6	1793694	1793699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_014012	TGC	2	6	1800192	1800197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6132	NC_014012	TG	3	6	1800234	1800239	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6266	NC_014012	T	7	7	1847684	1847690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6267	NC_014012	ACCT	2	8	1847700	1847707	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6268	NC_014012	TTG	2	6	1847760	1847765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6269	NC_014012	T	6	6	1847778	1847783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6272	NC_014012	T	7	7	1848123	1848129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6273	NC_014012	T	6	6	1848135	1848140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6274	NC_014012	GATT	2	8	1848715	1848722	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6275	NC_014012	CTATT	2	10	1848756	1848765	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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6282	NC_014012	CCTTC	2	10	1849007	1849016	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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6284	NC_014012	CT	3	6	1849031	1849036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6300	NC_014012	GAAT	2	8	1857826	1857833	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6301	NC_014012	ATT	2	6	1857855	1857860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6302	NC_014012	TG	3	6	1857880	1857885	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6336	NC_014012	TTC	2	6	1883621	1883626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6350	NC_014012	CATC	2	8	1891964	1891971	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6367	NC_014012	AAAGG	2	10	1895838	1895847	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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6383	NC_014012	TAA	2	6	1897549	1897554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6384	NC_014012	CCAC	2	8	1897564	1897571	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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6388	NC_014012	TTA	2	6	1904339	1904344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6389	NC_014012	T	6	6	1904364	1904369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6390	NC_014012	TAAA	2	8	1904398	1904405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6391	NC_014012	ATA	2	6	1904406	1904411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6392	NC_014012	ATT	2	6	1904932	1904937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6393	NC_014012	A	7	7	1904960	1904966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6394	NC_014012	TAAG	2	8	1905011	1905018	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6395	NC_014012	ATC	2	6	1905086	1905091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6397	NC_014012	ATA	2	6	1905126	1905131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6398	NC_014012	ATG	2	6	1905242	1905247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6399	NC_014012	TTC	2	6	1905308	1905313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6400	NC_014012	T	8	8	1905335	1905342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6401	NC_014012	ATTA	2	8	1905480	1905487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6407	NC_014012	TTA	2	6	1908585	1908590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6431	NC_014012	TTG	2	6	1912490	1912495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6493	NC_014012	AAACT	2	10	1926123	1926132	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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