MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Sphingobium japonicum UT26S plasmid pCHQ1

Total Repeats: 231

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014007	GCG	2	6	1240	1245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014007	CTT	2	6	5175	5180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014007	AAG	2	6	5215	5220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014007	ACT	2	6	6462	6467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014007	TGG	2	6	6536	6541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014007	GCG	2	6	6548	6553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014007	CGC	2	6	6609	6614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_014007	GGC	2	6	9722	9727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014007	CTG	2	6	11212	11217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014007	CTC	2	6	11315	11320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_014007	GCC	2	6	11324	11329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_014007	AGA	2	6	11717	11722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014007	GGC	2	6	11760	11765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014007	ACC	2	6	12512	12517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_014007	GCC	2	6	13423	13428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_014007	ACC	2	6	13512	13517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_014007	GCA	2	6	13523	13528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014007	GCC	2	6	13529	13534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_014007	GCC	2	6	13568	13573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_014007	TCC	2	6	15141	15146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_014007	GGA	2	6	15162	15167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014007	CAA	2	6	15176	15181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014007	TTA	2	6	15226	15231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014007	AGC	2	6	15240	15245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014007	GCG	2	6	15266	15271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014007	GGC	2	6	19106	19111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014007	TGG	2	6	20991	20996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014007	CCG	2	6	21050	21055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_014007	TCC	2	6	30619	30624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_014007	GGC	2	6	31274	31279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014007	CCT	2	6	31328	31333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_014007	GGT	2	6	31380	31385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014007	ATG	2	6	31954	31959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014007	CGC	2	6	31983	31988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_014007	AAC	2	6	32017	32022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014007	TCT	2	6	34129	34134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014007	GAG	2	6	34181	34186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014007	GGC	2	6	34220	34225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014007	GCT	2	6	34256	34261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014007	GTG	2	6	35995	36000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014007	TCT	2	6	37468	37473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014007	CAC	2	6	37536	37541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_014007	GGC	2	6	37571	37576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014007	AGG	2	6	37595	37600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014007	CGT	2	6	37622	37627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014007	GTC	2	6	37689	37694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014007	GGA	2	6	37779	37784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014007	ATT	2	6	37788	37793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014007	CAG	2	6	37832	37837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014007	GAT	2	6	37929	37934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014007	CCT	2	6	40833	40838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_014007	GCT	2	6	42898	42903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014007	CGG	2	6	42915	42920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014007	AAG	2	6	43169	43174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014007	CAT	2	6	45038	45043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014007	GTG	2	6	45183	45188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014007	GCC	2	6	46224	46229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_014007	GTT	2	6	46235	46240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014007	CCG	2	6	46260	46265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_014007	TCC	2	6	47559	47564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_014007	CGA	2	6	47565	47570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014007	TCC	2	6	48667	48672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_014007	CTC	2	6	48686	48691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_014007	CTG	2	6	53020	53025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014007	GAG	2	6	53128	53133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014007	ATG	2	6	53153	53158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014007	CCT	2	6	55316	55321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_014007	GGC	2	6	55337	55342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014007	TGA	2	6	56261	56266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014007	CGG	2	6	56358	56363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014007	GAT	2	6	56375	56380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014007	TCA	2	6	56488	56493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014007	CAG	2	6	56555	56560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014007	GAG	2	6	57692	57697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014007	GAC	2	6	57720	57725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014007	TTC	2	6	57733	57738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014007	AGC	2	6	57768	57773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014007	GGC	2	6	58186	58191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014007	GCC	2	6	58543	58548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_014007	GGT	2	6	59499	59504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014007	CGC	2	6	59518	59523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_014007	CGC	2	6	59540	59545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_014007	ATG	2	6	59553	59558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014007	GCT	2	6	59598	59603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014007	GCG	2	6	59651	59656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014007	CTC	2	6	60726	60731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_014007	CTC	2	6	60740	60745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_014007	CGA	2	6	60852	60857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014007	TCT	2	6	60878	60883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014007	AAG	2	6	62477	62482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014007	CGC	2	6	62967	62972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_014007	ATT	2	6	62988	62993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014007	GGC	2	6	63397	63402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014007	CGT	2	6	63422	63427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014007	CAA	2	6	63441	63446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014007	GAT	2	6	63507	63512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014007	GTC	2	6	63821	63826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014007	CGG	2	6	63946	63951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014007	GTG	2	6	64009	64014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014007	GGC	2	6	64045	64050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014007	AGC	2	6	64056	64061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014007	GCG	2	6	64123	64128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014007	GTC	2	6	64174	64179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014007	CGT	2	6	64224	64229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014007	GCG	2	6	65480	65485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014007	ATG	2	6	65516	65521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014007	TGA	2	6	66352	66357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014007	CCA	2	6	66413	66418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_014007	GCT	2	6	66584	66589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014007	GCC	2	6	68534	68539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_014007	GGC	2	6	68551	68556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014007	CTC	2	6	75669	75674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_014007	CTG	2	6	75719	75724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014007	GCG	2	6	77813	77818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014007	AGG	2	6	77995	78000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014007	GGC	2	6	79105	79110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014007	CGG	2	6	79163	79168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014007	CCA	2	6	79196	79201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_014007	GCG	2	6	79226	79231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014007	CGG	2	6	79587	79592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014007	GCC	2	6	79611	79616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_014007	AGG	2	6	79683	79688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014007	AGA	2	6	79689	79694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014007	GCG	2	6	88169	88174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014007	TCA	2	6	91464	91469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014007	ACC	2	6	94481	94486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_014007	TCG	2	6	94529	94534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014007	CTC	2	6	95282	95287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_014007	GCC	2	6	101019	101024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_014007	AGC	2	6	101086	101091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014007	ATC	2	6	101108	101113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014007	GTG	2	6	102170	102175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014007	AGC	2	6	102394	102399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014007	TCG	2	6	102688	102693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014007	CGG	2	6	103642	103647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014007	GCG	2	6	106602	106607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014007	GCC	2	6	106637	106642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_014007	ATT	2	6	107826	107831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014007	GCC	2	6	108740	108745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_014007	CGC	2	6	109718	109723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.