MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 4703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013959	TA	3	6	2469218	2469223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_013959	GTC	2	6	2469232	2469237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_013959	TGT	2	6	2469277	2469282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_013959	A	7	7	2469383	2469389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_013959	TTGT	2	8	2469411	2469418	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_013959	TGG	2	6	2469419	2469424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_013959	TG	3	6	2470771	2470776	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_013959	TGG	2	6	2470778	2470783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_013959	TG	3	6	2472826	2472831	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_013959	GGT	2	6	2472878	2472883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_013959	GCC	2	6	2472884	2472889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_013959	AGCTT	2	10	2472933	2472942	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4013	NC_013959	AGCG	2	8	2474792	2474799	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4014	NC_013959	GCA	2	6	2474876	2474881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_013959	CGC	2	6	2475365	2475370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4016	NC_013959	GCG	2	6	2475385	2475390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_013959	A	6	6	2475639	2475644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_013959	AAC	2	6	2475665	2475670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_013959	CCGG	2	8	2475709	2475716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4020	NC_013959	ACA	2	6	2476240	2476245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_013959	CT	3	6	2476249	2476254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4022	NC_013959	ATT	2	6	2476292	2476297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_013959	GCGG	2	8	2476312	2476319	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4024	NC_013959	TGTC	2	8	2477533	2477540	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4025	NC_013959	TAG	2	6	2479069	2479074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_013959	AAAAC	2	10	2480242	2480251	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4027	NC_013959	CCT	2	6	2480649	2480654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_013959	TTGT	2	8	2480658	2480665	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_013959	A	6	6	2482895	2482900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_013959	GCC	2	6	2482926	2482931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4031	NC_013959	GGC	2	6	2482936	2482941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_013959	CTAAAA	2	12	2483816	2483827	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4033	NC_013959	GC	3	6	2483849	2483854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4034	NC_013959	ACC	2	6	2483867	2483872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4035	NC_013959	AGG	2	6	2488795	2488800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_013959	ATC	2	6	2490813	2490818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_013959	CGCT	2	8	2491749	2491756	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4038	NC_013959	TC	3	6	2492564	2492569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4039	NC_013959	GC	3	6	2492578	2492583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4040	NC_013959	TGT	2	6	2492628	2492633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_013959	TTA	2	6	2492644	2492649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_013959	CCG	2	6	2493055	2493060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4043	NC_013959	AAG	2	6	2493074	2493079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_013959	CG	3	6	2493101	2493106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4045	NC_013959	GAC	2	6	2496649	2496654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_013959	ATT	2	6	2496686	2496691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_013959	TGT	2	6	2496744	2496749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_013959	TGC	2	6	2496846	2496851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_013959	CGC	2	6	2497713	2497718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4050	NC_013959	GAT	2	6	2497745	2497750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_013959	CT	3	6	2497779	2497784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4052	NC_013959	TCG	2	6	2498645	2498650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_013959	AAC	2	6	2498700	2498705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_013959	TCT	2	6	2499180	2499185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_013959	TCAGT	2	10	2499186	2499195	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4056	NC_013959	GTT	2	6	2500532	2500537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_013959	TGACA	2	10	2500573	2500582	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4058	NC_013959	ACA	2	6	2500590	2500595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_013959	GCG	2	6	2500633	2500638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_013959	A	6	6	2500706	2500711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_013959	TAC	2	6	2500741	2500746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_013959	CCG	2	6	2501963	2501968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4063	NC_013959	AT	3	6	2501997	2502002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_013959	T	6	6	2502017	2502022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_013959	CTT	2	6	2502078	2502083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_013959	CTTT	2	8	2502088	2502095	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4067	NC_013959	GGTT	2	8	2503219	2503226	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_013959	GCCG	2	8	2503241	2503248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4069	NC_013959	AAAT	2	8	2503257	2503264	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_013959	A	6	6	2503300	2503305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_013959	TAA	2	6	2503322	2503327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_013959	A	6	6	2503326	2503331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_013959	TAA	2	6	2503372	2503377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_013959	CAA	2	6	2503383	2503388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_013959	CGG	2	6	2503408	2503413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_013959	GAT	2	6	2503448	2503453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_013959	AC	3	6	2503517	2503522	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4078	NC_013959	CAAAAA	2	12	2503540	2503551	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4079	NC_013959	A	8	8	2503547	2503554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_013959	C	6	6	2503562	2503567	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4081	NC_013959	GGT	3	9	2503640	2503648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_013959	GCT	2	6	2503675	2503680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_013959	TTGA	2	8	2503788	2503795	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_013959	TGT	2	6	2506227	2506232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_013959	TC	3	6	2516577	2516582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4086	NC_013959	CCA	2	6	2516648	2516653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4087	NC_013959	ATT	2	6	2516741	2516746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_013959	ATT	2	6	2516756	2516761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_013959	AAT	2	6	2516762	2516767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_013959	GCA	2	6	2516777	2516782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_013959	TG	3	6	2518564	2518569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_013959	CGC	2	6	2518584	2518589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4093	NC_013959	AAG	2	6	2518624	2518629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_013959	TGT	2	6	2520989	2520994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_013959	CCG	2	6	2521015	2521020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4096	NC_013959	GCT	2	6	2521078	2521083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_013959	ATTG	2	8	2521103	2521110	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_013959	CAT	2	6	2521826	2521831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_013959	GAA	2	6	2523767	2523772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_013959	TC	3	6	2524483	2524488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4101	NC_013959	TTC	2	6	2528116	2528121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_013959	CG	3	6	2528150	2528155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4103	NC_013959	AGT	2	6	2528532	2528537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_013959	ACA	2	6	2528552	2528557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_013959	AATG	2	8	2528617	2528624	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_013959	T	7	7	2528638	2528644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_013959	GAA	2	6	2528733	2528738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_013959	CA	3	6	2530892	2530897	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4109	NC_013959	CAAA	2	8	2530909	2530916	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4110	NC_013959	GCC	2	6	2530920	2530925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4111	NC_013959	CGG	2	6	2530935	2530940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_013959	TCCC	2	8	2533012	2533019	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4113	NC_013959	A	6	6	2533039	2533044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_013959	TCA	2	6	2533066	2533071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_013959	TG	3	6	2533129	2533134	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_013959	GTC	2	6	2533167	2533172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_013959	CGC	2	6	2533188	2533193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4118	NC_013959	TAC	2	6	2533235	2533240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_013959	CCA	2	6	2535943	2535948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4120	NC_013959	GCA	2	6	2535958	2535963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_013959	CACC	2	8	2535993	2536000	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4122	NC_013959	CT	3	6	2536013	2536018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4123	NC_013959	AGA	2	6	2536024	2536029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_013959	TGA	2	6	2536902	2536907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_013959	CAGG	2	8	2536928	2536935	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4126	NC_013959	GAA	2	6	2536942	2536947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_013959	ATA	2	6	2538362	2538367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_013959	GCAC	2	8	2540960	2540967	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4129	NC_013959	AC	3	6	2542363	2542368	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4130	NC_013959	CG	3	6	2543002	2543007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4131	NC_013959	ATGC	2	8	2548238	2548245	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4132	NC_013959	CGT	2	6	2548280	2548285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_013959	TA	3	6	2548788	2548793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_013959	C	7	7	2548807	2548813	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4135	NC_013959	ACCT	2	8	2548830	2548837	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4136	NC_013959	GATC	2	8	2552908	2552915	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4137	NC_013959	GCA	2	6	2552923	2552928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4139	NC_013959	ATG	2	6	2555419	2555424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4141	NC_013959	A	6	6	2555444	2555449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4143	NC_013959	CGG	2	6	2556401	2556406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4144	NC_013959	CGC	2	6	2557330	2557335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4145	NC_013959	CCAT	2	8	2557338	2557345	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4146	NC_013959	TCG	2	6	2557386	2557391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4147	NC_013959	CGAA	2	8	2557393	2557400	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4148	NC_013959	TAA	2	6	2557425	2557430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4149	NC_013959	TG	3	6	2557569	2557574	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4150	NC_013959	CG	3	6	2557610	2557615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4151	NC_013959	T	8	8	2557655	2557662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4154	NC_013959	GTT	2	6	2563637	2563642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4155	NC_013959	TTG	2	6	2563645	2563650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4156	NC_013959	TTG	2	6	2563654	2563659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4157	NC_013959	TCT	2	6	2563696	2563701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4158	NC_013959	GATG	2	8	2563705	2563712	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4159	NC_013959	GGC	2	6	2564051	2564056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4160	NC_013959	CCG	2	6	2564060	2564065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4161	NC_013959	CTC	2	6	2565975	2565980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4168	NC_013959	GC	3	6	2568711	2568716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4177	NC_013959	GTG	2	6	2575748	2575753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4202	NC_013959	GTAC	2	8	2609315	2609322	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4203	NC_013959	GTG	2	6	2609329	2609334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4220	NC_013959	TG	3	6	2630712	2630717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4221	NC_013959	CAAG	2	8	2631736	2631743	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4232	NC_013959	AT	3	6	2659468	2659473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4233	NC_013959	GAA	2	6	2659518	2659523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4250	NC_013959	GCCT	2	8	2670814	2670821	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4251	NC_013959	GCAAT	2	10	2670832	2670841	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4252	NC_013959	A	6	6	2670921	2670926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_013959	T	7	7	2670967	2670973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4259	NC_013959	T	6	6	2671290	2671295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_013959	TCAG	2	8	2671314	2671321	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4262	NC_013959	GAC	2	6	2671452	2671457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4266	NC_013959	GAT	2	6	2671738	2671743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4381	NC_013959	AGCC	2	8	2762176	2762183	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4382	NC_013959	CCA	2	6	2762229	2762234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4383	NC_013959	CGG	2	6	2762292	2762297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4389	NC_013959	A	9	9	2767292	2767300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4390	NC_013959	T	6	6	2767319	2767324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4391	NC_013959	GATT	2	8	2769005	2769012	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4392	NC_013959	G	6	6	2769036	2769041	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4393	NC_013959	TGGGG	2	10	2769047	2769056	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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