MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 4703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013959	CGC	2	6	2213177	2213182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3502	NC_013959	GA	3	6	2213200	2213205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_013959	AGC	2	6	2213396	2213401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_013959	CGG	2	6	2213413	2213418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_013959	A	7	7	2213449	2213455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_013959	TTC	2	6	2213551	2213556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_013959	AGG	2	6	2213591	2213596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_013959	GAG	2	6	2214078	2214083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_013959	G	6	6	2214086	2214091	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_013959	TG	3	6	2214095	2214100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_013959	TACA	2	8	2214103	2214110	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3512	NC_013959	TCC	2	6	2214501	2214506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3513	NC_013959	TTA	2	6	2214601	2214606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_013959	AAGG	2	8	2214692	2214699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_013959	GCT	2	6	2215092	2215097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_013959	GCGT	2	8	2215139	2215146	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3517	NC_013959	CCCTCT	2	12	2215157	2215168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3518	NC_013959	AAT	2	6	2215190	2215195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_013959	TGCTT	2	10	2216202	2216211	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3520	NC_013959	TTTAA	2	10	2216792	2216801	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_013959	GCAA	2	8	2216856	2216863	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3522	NC_013959	A	6	6	2216909	2216914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_013959	CGCAC	2	10	2217019	2217028	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3524	NC_013959	CAG	2	6	2217046	2217051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_013959	ATT	2	6	2218096	2218101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_013959	TGT	2	6	2220229	2220234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_013959	GAA	2	6	2220253	2220258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_013959	TTC	2	6	2220285	2220290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_013959	ACGC	2	8	2222208	2222215	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3530	NC_013959	AG	3	6	2222744	2222749	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_013959	TGAA	2	8	2222822	2222829	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_013959	ACA	2	6	2223266	2223271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_013959	G	8	8	2223346	2223353	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_013959	TGG	2	6	2223355	2223360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_013959	AAG	2	6	2223372	2223377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_013959	GTC	2	6	2223388	2223393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_013959	GA	3	6	2224154	2224159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_013959	AGCC	2	8	2224179	2224186	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3539	NC_013959	GTC	2	6	2225688	2225693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_013959	GC	3	6	2225791	2225796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3541	NC_013959	GAT	2	6	2226616	2226621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_013959	AC	3	6	2226645	2226650	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3543	NC_013959	CAG	2	6	2226654	2226659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_013959	GGC	2	6	2226681	2226686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_013959	CTG	2	6	2226691	2226696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_013959	CGG	2	6	2226710	2226715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_013959	ATT	2	6	2226719	2226724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_013959	CTTG	2	8	2226748	2226755	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3549	NC_013959	GAA	2	6	2226764	2226769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_013959	GAT	2	6	2226774	2226779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_013959	CAG	2	6	2226789	2226794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_013959	TC	3	6	2226946	2226951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3553	NC_013959	AGCG	2	8	2226963	2226970	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3554	NC_013959	AGG	2	6	2226976	2226981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_013959	TGCCC	2	10	2228374	2228383	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3556	NC_013959	T	6	6	2228419	2228424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_013959	AGGC	2	8	2229796	2229803	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3558	NC_013959	A	6	6	2231079	2231084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_013959	ACT	2	6	2233737	2233742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_013959	TAC	2	6	2233930	2233935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_013959	CAT	2	6	2233938	2233943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_013959	T	6	6	2234844	2234849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_013959	AT	3	6	2234882	2234887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_013959	CTA	2	6	2234894	2234899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_013959	ACC	2	6	2236340	2236345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3566	NC_013959	ATA	2	6	2236412	2236417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_013959	GCT	2	6	2236438	2236443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_013959	TAAC	2	8	2236474	2236481	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3569	NC_013959	T	7	7	2236526	2236532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_013959	GGC	2	6	2236542	2236547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_013959	A	6	6	2237243	2237248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_013959	T	6	6	2237286	2237291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_013959	GGC	2	6	2238263	2238268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_013959	T	6	6	2238270	2238275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_013959	GAA	2	6	2240544	2240549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_013959	TCT	2	6	2241930	2241935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_013959	CTC	2	6	2241936	2241941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3578	NC_013959	ACC	2	6	2243417	2243422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3579	NC_013959	CATC	2	8	2243493	2243500	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3580	NC_013959	CGAT	2	8	2243519	2243526	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3581	NC_013959	GATT	2	8	2243558	2243565	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_013959	CTC	2	6	2245041	2245046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3583	NC_013959	CCG	2	6	2246532	2246537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3584	NC_013959	GC	3	6	2246550	2246555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3585	NC_013959	CGAA	2	8	2246568	2246575	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3586	NC_013959	C	6	6	2246644	2246649	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3587	NC_013959	TCG	2	6	2246662	2246667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_013959	CT	3	6	2249113	2249118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3589	NC_013959	CT	3	6	2250571	2250576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3590	NC_013959	ATC	2	6	2251873	2251878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_013959	CGC	3	9	2251919	2251927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3592	NC_013959	GGGCA	2	10	2253250	2253259	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3593	NC_013959	CGC	2	6	2253285	2253290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3594	NC_013959	CAC	2	6	2253302	2253307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3595	NC_013959	ACT	2	6	2253322	2253327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_013959	AGCGA	2	10	2253385	2253394	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3597	NC_013959	G	6	6	2253395	2253400	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_013959	GGC	2	6	2257776	2257781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_013959	GCC	2	6	2257794	2257799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3600	NC_013959	GTCA	2	8	2257834	2257841	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3601	NC_013959	CGC	2	6	2263043	2263048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3602	NC_013959	GTA	2	6	2265937	2265942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_013959	GAT	2	6	2265969	2265974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_013959	TCA	2	6	2266025	2266030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_013959	GC	3	6	2266054	2266059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3606	NC_013959	CCG	2	6	2269711	2269716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3607	NC_013959	AT	3	6	2269731	2269736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_013959	CAT	2	6	2269781	2269786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_013959	GAG	2	6	2269798	2269803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_013959	ACTT	2	8	2271286	2271293	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3611	NC_013959	GTAC	2	8	2271301	2271308	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3612	NC_013959	CTT	2	6	2271740	2271745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_013959	T	7	7	2271782	2271788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_013959	CGC	2	6	2271809	2271814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3615	NC_013959	GCC	2	6	2272669	2272674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3616	NC_013959	AT	3	6	2273492	2273497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_013959	TAC	2	6	2273507	2273512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_013959	T	6	6	2273554	2273559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_013959	AAGC	2	8	2273573	2273580	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3620	NC_013959	GCC	2	6	2276594	2276599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3621	NC_013959	TCT	2	6	2278873	2278878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_013959	GTA	2	6	2278883	2278888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_013959	CA	3	6	2278903	2278908	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3624	NC_013959	CTC	2	6	2278916	2278921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3625	NC_013959	CCGG	2	8	2278930	2278937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3626	NC_013959	CGCC	2	8	2278960	2278967	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3627	NC_013959	TCC	2	6	2285914	2285919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3628	NC_013959	TCC	2	6	2287140	2287145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3629	NC_013959	AGT	2	6	2287242	2287247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_013959	CTT	2	6	2287754	2287759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3631	NC_013959	GCG	2	6	2287775	2287780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_013959	GCC	2	6	2287785	2287790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3633	NC_013959	CAT	2	6	2287839	2287844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3634	NC_013959	CTT	2	6	2287869	2287874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3635	NC_013959	AATC	2	8	2289396	2289403	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3636	NC_013959	AGCG	2	8	2289510	2289517	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3637	NC_013959	CCG	2	6	2289535	2289540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3646	NC_013959	CCG	2	6	2299352	2299357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3647	NC_013959	GC	3	6	2299393	2299398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3648	NC_013959	TCGA	2	8	2299740	2299747	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3674	NC_013959	ACCAT	2	10	2308206	2308215	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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3754	NC_013959	CAAAA	2	10	2344334	2344343	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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3759	NC_013959	CCCA	2	8	2349580	2349587	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3760	NC_013959	TCGA	2	8	2349704	2349711	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3762	NC_013959	GA	4	8	2349748	2349755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3888	NC_013959	CCCG	2	8	2406042	2406049	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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