MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 4703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_013959	GCG	2	6	1217644	1217649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2002	NC_013959	CCG	2	6	1220645	1220650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2003	NC_013959	GAG	2	6	1220734	1220739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_013959	GAT	2	6	1220776	1220781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_013959	GA	3	6	1221758	1221763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_013959	TTTC	2	8	1221765	1221772	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2007	NC_013959	TGTTAT	2	12	1222577	1222588	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2008	NC_013959	AAC	2	6	1222590	1222595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2009	NC_013959	GCT	2	6	1222628	1222633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2010	NC_013959	A	6	6	1222634	1222639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_013959	GCGA	2	8	1223819	1223826	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2012	NC_013959	GCA	2	6	1223832	1223837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2013	NC_013959	A	6	6	1223837	1223842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_013959	T	6	6	1223860	1223865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_013959	GCA	2	6	1223873	1223878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2016	NC_013959	TGC	2	6	1223881	1223886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2017	NC_013959	ATC	2	6	1224643	1224648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2018	NC_013959	CAT	2	6	1224672	1224677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2019	NC_013959	GGGC	2	8	1225449	1225456	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2020	NC_013959	ATG	2	6	1225529	1225534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_013959	ATT	2	6	1225573	1225578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2022	NC_013959	T	6	6	1225595	1225600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2023	NC_013959	T	7	7	1225656	1225662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_013959	ACG	2	6	1227223	1227228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2025	NC_013959	G	6	6	1228505	1228510	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2026	NC_013959	GGC	2	6	1230596	1230601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2027	NC_013959	AGA	2	6	1230623	1230628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2028	NC_013959	CGG	2	6	1231856	1231861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2029	NC_013959	TCC	2	6	1231954	1231959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2030	NC_013959	ATGG	2	8	1231960	1231967	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_013959	TGA	2	6	1233072	1233077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2032	NC_013959	GCG	2	6	1233114	1233119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2033	NC_013959	CAT	2	6	1234116	1234121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2034	NC_013959	A	6	6	1235699	1235704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2035	NC_013959	TAC	2	6	1235713	1235718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2036	NC_013959	CAG	2	6	1235724	1235729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2037	NC_013959	GAA	2	6	1235990	1235995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2038	NC_013959	CTGAG	2	10	1236908	1236917	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2039	NC_013959	TCA	2	6	1236953	1236958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2040	NC_013959	T	6	6	1236980	1236985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2041	NC_013959	ATT	2	6	1238388	1238393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2042	NC_013959	C	6	6	1238420	1238425	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2043	NC_013959	TAC	2	6	1238431	1238436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2044	NC_013959	ACGG	2	8	1238806	1238813	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2045	NC_013959	TCC	2	6	1238824	1238829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2046	NC_013959	AAATGA	2	12	1240965	1240976	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2047	NC_013959	CGG	2	6	1242255	1242260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2048	NC_013959	CATTC	2	10	1244114	1244123	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2049	NC_013959	CA	3	6	1244173	1244178	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2050	NC_013959	GGT	2	6	1244180	1244185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2051	NC_013959	GCA	2	6	1244210	1244215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2052	NC_013959	TTTTTG	2	12	1244253	1244264	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2053	NC_013959	GTT	2	6	1244297	1244302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_013959	GAG	2	6	1244312	1244317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2055	NC_013959	GAA	2	6	1246957	1246962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2056	NC_013959	CCT	2	6	1247154	1247159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2057	NC_013959	ATAG	2	8	1247687	1247694	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2058	NC_013959	GGT	2	6	1247744	1247749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_013959	GCA	2	6	1248092	1248097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2060	NC_013959	CGG	2	6	1248104	1248109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2061	NC_013959	CCG	2	6	1248118	1248123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2062	NC_013959	GATT	2	8	1248137	1248144	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2063	NC_013959	GC	3	6	1252140	1252145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2064	NC_013959	TCA	2	6	1253757	1253762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2065	NC_013959	GC	3	6	1253794	1253799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2066	NC_013959	T	6	6	1253800	1253805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2067	NC_013959	CTT	2	6	1253807	1253812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2068	NC_013959	TTG	2	6	1253817	1253822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2069	NC_013959	CT	3	6	1253862	1253867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2070	NC_013959	GCA	2	6	1253965	1253970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2071	NC_013959	GGAA	2	8	1254898	1254905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2072	NC_013959	CAGCCA	2	12	1254907	1254918	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2073	NC_013959	CCT	2	6	1254948	1254953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2074	NC_013959	CAGG	2	8	1254979	1254986	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2075	NC_013959	ATG	2	6	1256618	1256623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2078	NC_013959	T	6	6	1256770	1256775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2079	NC_013959	GGA	2	6	1256777	1256782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2080	NC_013959	TTG	2	6	1259887	1259892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2082	NC_013959	TCCG	2	8	1263721	1263728	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2083	NC_013959	GCG	2	6	1264866	1264871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2084	NC_013959	T	7	7	1275273	1275279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2085	NC_013959	GAG	2	6	1275357	1275362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2086	NC_013959	GTTC	2	8	1279901	1279908	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2087	NC_013959	TTA	2	6	1279911	1279916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2088	NC_013959	TGG	2	6	1279958	1279963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2089	NC_013959	CCG	2	6	1279986	1279991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2090	NC_013959	CTGCT	2	10	1280015	1280024	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2091	NC_013959	TTC	2	6	1280025	1280030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2092	NC_013959	GAC	2	6	1280070	1280075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2093	NC_013959	AGC	2	6	1280077	1280082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2094	NC_013959	TCGCTG	2	12	1287043	1287054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2095	NC_013959	GGAT	2	8	1287055	1287062	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2096	NC_013959	CAG	2	6	1287128	1287133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2097	NC_013959	CAG	2	6	1290722	1290727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2098	NC_013959	GA	3	6	1292127	1292132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2099	NC_013959	CAA	2	6	1294928	1294933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2100	NC_013959	TAT	2	6	1294952	1294957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2101	NC_013959	CTG	2	6	1295018	1295023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2102	NC_013959	AGG	2	6	1295036	1295041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2103	NC_013959	T	6	6	1295045	1295050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2104	NC_013959	A	6	6	1295060	1295065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2105	NC_013959	GGA	2	6	1297844	1297849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2106	NC_013959	GGCA	2	8	1297859	1297866	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2107	NC_013959	AG	3	6	1301249	1301254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2108	NC_013959	TG	3	6	1301276	1301281	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2109	NC_013959	GTT	2	6	1302748	1302753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2110	NC_013959	AAG	2	6	1307211	1307216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2111	NC_013959	TGT	2	6	1307290	1307295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2112	NC_013959	GT	3	6	1307294	1307299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2113	NC_013959	TTA	2	6	1307331	1307336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2114	NC_013959	GT	3	6	1307342	1307347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2115	NC_013959	ATC	2	6	1310764	1310769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2116	NC_013959	TGA	2	6	1311261	1311266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2117	NC_013959	ACA	2	6	1313963	1313968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2118	NC_013959	GTG	2	6	1314077	1314082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2119	NC_013959	GCTGA	2	10	1314084	1314093	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2120	NC_013959	GTTT	2	8	1314127	1314134	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2121	NC_013959	GGT	2	6	1314146	1314151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2122	NC_013959	ATC	2	6	1316491	1316496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2123	NC_013959	GC	3	6	1316497	1316502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2124	NC_013959	TGT	2	6	1319066	1319071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2125	NC_013959	A	6	6	1319073	1319078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2126	NC_013959	AATA	2	8	1319112	1319119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2127	NC_013959	CTG	2	6	1326033	1326038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2128	NC_013959	TCC	2	6	1326100	1326105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2129	NC_013959	GA	3	6	1327506	1327511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2130	NC_013959	CG	3	6	1327522	1327527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2131	NC_013959	ATCT	2	8	1329332	1329339	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2132	NC_013959	TCT	2	6	1329364	1329369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2133	NC_013959	ATC	2	6	1329481	1329486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2134	NC_013959	GAA	2	6	1329516	1329521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2135	NC_013959	AG	3	6	1329529	1329534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2138	NC_013959	GAATCT	2	12	1329566	1329577	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2139	NC_013959	AGA	2	6	1329631	1329636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2144	NC_013959	GTC	2	6	1330125	1330130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2146	NC_013959	CGGG	2	8	1330215	1330222	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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2165	NC_013959	TGG	2	6	1338210	1338215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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