MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 4703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013959	CCT	2	6	631203	631208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_013959	GCC	2	6	632411	632416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_013959	TCA	2	6	632501	632506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_013959	AT	3	6	634195	634200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_013959	GGT	2	6	634202	634207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_013959	ACG	2	6	634246	634251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_013959	CATG	2	8	634932	634939	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1008	NC_013959	ATT	3	9	636143	636151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_013959	GAGG	2	8	636174	636181	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_013959	TAC	2	6	636183	636188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_013959	GCC	2	6	636222	636227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_013959	CA	3	6	640298	640303	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_013959	GA	3	6	640304	640309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_013959	ACT	2	6	640350	640355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_013959	GCCA	2	8	640383	640390	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_013959	CGG	3	9	645671	645679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_013959	GCGG	2	8	645706	645713	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_013959	TTGT	2	8	646380	646387	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_013959	CGC	2	6	646394	646399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_013959	GCT	2	6	646425	646430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_013959	ACT	2	6	647066	647071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_013959	T	8	8	647085	647092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_013959	GAT	2	6	647105	647110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_013959	AGA	2	6	647145	647150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_013959	CGT	2	6	647173	647178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_013959	T	6	6	647178	647183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_013959	A	7	7	647189	647195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_013959	ATAA	2	8	647254	647261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_013959	TCA	2	6	647262	647267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_013959	CAAG	2	8	647916	647923	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_013959	GGAA	2	8	651061	651068	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_013959	AGT	2	6	655573	655578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_013959	A	6	6	655585	655590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_013959	T	7	7	655609	655615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_013959	TCC	2	6	656505	656510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_013959	TGAT	2	8	656514	656521	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_013959	CAG	2	6	656547	656552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_013959	GGC	2	6	656590	656595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_013959	CAT	2	6	656605	656610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_013959	ATGC	2	8	656661	656668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_013959	GC	3	6	660124	660129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_013959	GAT	3	9	660233	660241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_013959	GCC	2	6	662289	662294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_013959	ATT	2	6	664451	664456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_013959	TGC	2	6	664480	664485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_013959	GTC	2	6	664491	664496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_013959	GAATG	2	10	665038	665047	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_013959	TCAAT	2	10	665067	665076	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1049	NC_013959	GGC	2	6	665078	665083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_013959	ATG	2	6	665724	665729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_013959	AATGC	2	10	670035	670044	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1052	NC_013959	CA	3	6	670055	670060	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_013959	CAG	2	6	670981	670986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_013959	CCA	2	6	670996	671001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_013959	TCT	2	6	671025	671030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_013959	TCT	2	6	671106	671111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_013959	GAT	2	6	671468	671473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_013959	TGA	2	6	671476	671481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_013959	TC	3	6	671558	671563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_013959	CG	3	6	673085	673090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_013959	GCATC	2	10	673240	673249	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1062	NC_013959	ATC	2	6	673277	673282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_013959	AATT	2	8	673341	673348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_013959	CAT	2	6	673690	673695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_013959	TCG	2	6	673743	673748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_013959	GT	3	6	675039	675044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_013959	CAG	2	6	675081	675086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_013959	TCATTT	2	12	675107	675118	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1069	NC_013959	TGG	2	6	677426	677431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_013959	T	6	6	677474	677479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_013959	ATT	2	6	681011	681016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_013959	CGC	2	6	681720	681725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_013959	CGC	2	6	681802	681807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_013959	TGT	2	6	692641	692646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_013959	CAT	2	6	692674	692679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_013959	TA	3	6	692710	692715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_013959	TTG	2	6	694278	694283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_013959	GTT	2	6	695706	695711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_013959	CG	3	6	695745	695750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_013959	GCG	3	9	695801	695809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_013959	CAA	2	6	695832	695837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_013959	GCA	2	6	698874	698879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_013959	GCG	2	6	698880	698885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_013959	AGA	2	6	698886	698891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_013959	GGC	2	6	700159	700164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_013959	CT	3	6	700214	700219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_013959	GAA	2	6	700251	700256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_013959	ACAG	2	8	700936	700943	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_013959	AAAG	2	8	702761	702768	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_013959	T	6	6	702786	702791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_013959	CAG	2	6	705539	705544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_013959	CATCC	2	10	709573	709582	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1093	NC_013959	C	6	6	709590	709595	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1094	NC_013959	AGG	2	6	709608	709613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_013959	CTG	2	6	715260	715265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_013959	CTG	2	6	715276	715281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_013959	ACT	2	6	715298	715303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_013959	CTA	2	6	715307	715312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_013959	TCG	2	6	715326	715331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_013959	AC	3	6	718807	718812	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_013959	CAC	2	6	718823	718828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_013959	TGT	2	6	718832	718837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_013959	CGC	2	6	718845	718850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_013959	GCA	2	6	718868	718873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_013959	CCG	2	6	718883	718888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_013959	GTC	2	6	718925	718930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_013959	GAA	2	6	719962	719967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_013959	CTG	2	6	720025	720030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_013959	TGC	3	9	720065	720073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_013959	TA	3	6	720366	720371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_013959	TGCAT	2	10	720473	720482	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1112	NC_013959	CTGC	2	8	720611	720618	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_013959	GAA	2	6	720641	720646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_013959	AGT	2	6	721101	721106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_013959	CTTTA	2	10	721135	721144	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1116	NC_013959	ATA	2	6	721162	721167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_013959	ATT	2	6	721264	721269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_013959	AGAA	2	8	721290	721297	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_013959	GCA	2	6	721348	721353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_013959	TGT	2	6	721362	721367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_013959	GAT	2	6	721398	721403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_013959	ATT	2	6	721594	721599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_013959	T	6	6	721625	721630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_013959	GAA	2	6	721672	721677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_013959	CGC	2	6	722949	722954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_013959	CT	3	6	723022	723027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_013959	GAAC	2	8	723049	723056	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1128	NC_013959	ATG	2	6	723095	723100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_013959	ACC	2	6	724255	724260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_013959	GGA	2	6	724696	724701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_013959	TGGG	2	8	724710	724717	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_013959	GCA	2	6	724748	724753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_013959	TCAG	2	8	724765	724772	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1134	NC_013959	TAGCT	2	10	724810	724819	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1135	NC_013959	GCAG	2	8	724832	724839	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1407	NC_013959	AGG	2	6	851817	851822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1408	NC_013959	CTG	2	6	851830	851835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1409	NC_013959	GTC	2	6	851881	851886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1410	NC_013959	CAA	2	6	851899	851904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1429	NC_013959	ATGC	2	8	861274	861281	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1430	NC_013959	TTCTG	2	10	861351	861360	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1440	NC_013959	TGT	3	9	863941	863949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1443	NC_013959	CTT	2	6	864314	864319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1445	NC_013959	TTCA	2	8	864373	864380	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1447	NC_013959	TGT	2	6	864848	864853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1450	NC_013959	TTG	2	6	866157	866162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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