MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stackebrandtia nassauensis DSM 44728 chromosome

Total Repeats: 13084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013947	AAT	2	6	2271371	2271376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_013947	CGG	2	6	2271387	2271392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_013947	CCA	2	6	2276406	2276411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4004	NC_013947	GGAGG	2	10	2276433	2276442	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_013947	CGC	2	6	2276458	2276463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4006	NC_013947	GCCCG	2	10	2276489	2276498	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4007	NC_013947	GCGGA	2	10	2276499	2276508	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4008	NC_013947	CCG	2	6	2276551	2276556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4009	NC_013947	TGG	2	6	2280161	2280166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_013947	GTCGC	2	10	2280200	2280209	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4011	NC_013947	CGT	2	6	2280210	2280215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_013947	GTC	2	6	2280285	2280290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_013947	A	6	6	2280299	2280304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_013947	GAG	2	6	2280349	2280354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_013947	CCG	2	6	2284587	2284592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4016	NC_013947	GCG	3	9	2284623	2284631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_013947	CGA	2	6	2284642	2284647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_013947	AAG	2	6	2284649	2284654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_013947	CGAC	2	8	2284668	2284675	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4020	NC_013947	GGT	2	6	2284774	2284779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_013947	GTG	2	6	2284798	2284803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_013947	CGA	2	6	2284817	2284822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_013947	GGC	2	6	2284832	2284837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_013947	CGT	2	6	2284859	2284864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_013947	GAC	2	6	2284881	2284886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_013947	ACA	2	6	2284894	2284899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_013947	CGA	2	6	2284928	2284933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_013947	GAA	2	6	2284970	2284975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_013947	CCAG	2	8	2284987	2284994	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4030	NC_013947	CGACGG	2	12	2285012	2285023	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_013947	GCA	2	6	2285041	2285046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_013947	CGCCGA	2	12	2285048	2285059	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_013947	GTG	2	6	2285886	2285891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_013947	CGC	2	6	2285931	2285936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4035	NC_013947	TGA	2	6	2285949	2285954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_013947	CG	3	6	2286096	2286101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4037	NC_013947	CGC	2	6	2286149	2286154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4038	NC_013947	TGT	2	6	2286167	2286172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_013947	TGG	2	6	2286202	2286207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_013947	CCG	2	6	2303423	2303428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4041	NC_013947	GAG	2	6	2303533	2303538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_013947	GCC	2	6	2307840	2307845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4043	NC_013947	ACCG	2	8	2308441	2308448	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4044	NC_013947	AG	3	6	2308451	2308456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_013947	GGC	2	6	2310223	2310228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_013947	CCG	2	6	2311219	2311224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4047	NC_013947	TTC	2	6	2311244	2311249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_013947	CGC	4	12	2311261	2311272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4049	NC_013947	GCG	2	6	2311280	2311285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_013947	ACC	2	6	2311308	2311313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4051	NC_013947	GCC	3	9	2311314	2311322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4052	NC_013947	CGC	2	6	2311358	2311363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4053	NC_013947	GCA	2	6	2311381	2311386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_013947	ACC	2	6	2311419	2311424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4055	NC_013947	GCA	2	6	2311459	2311464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_013947	CAC	2	6	2311535	2311540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4057	NC_013947	CAG	2	6	2311541	2311546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_013947	ACC	2	6	2311593	2311598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4059	NC_013947	GAA	2	6	2311649	2311654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_013947	CGG	2	6	2311672	2311677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_013947	GGT	2	6	2311697	2311702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_013947	CGC	2	6	2311804	2311809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4063	NC_013947	GCA	2	6	2311828	2311833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_013947	CGA	2	6	2311841	2311846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_013947	CGA	3	9	2311868	2311876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_013947	CCG	2	6	2311900	2311905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4067	NC_013947	GTC	2	6	2311922	2311927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_013947	CGG	2	6	2311928	2311933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_013947	C	6	6	2312042	2312047	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4070	NC_013947	TC	3	6	2312062	2312067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4071	NC_013947	GAG	2	6	2312081	2312086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_013947	ACC	2	6	2312098	2312103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4073	NC_013947	CAG	2	6	2312105	2312110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_013947	CCA	2	6	2313069	2313074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4075	NC_013947	CTG	2	6	2316938	2316943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_013947	CCG	2	6	2316991	2316996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4077	NC_013947	CCCT	2	8	2320784	2320791	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4078	NC_013947	GGC	2	6	2320804	2320809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_013947	GTC	3	9	2320813	2320821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_013947	TCC	3	9	2320846	2320854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4081	NC_013947	CCT	2	6	2321857	2321862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4082	NC_013947	CGTG	2	8	2321879	2321886	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4083	NC_013947	TG	3	6	2322093	2322098	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_013947	GTTG	2	8	2322155	2322162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_013947	AAC	2	6	2322164	2322169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_013947	GACG	2	8	2322220	2322227	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4087	NC_013947	CGG	2	6	2322749	2322754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_013947	CCGT	2	8	2324201	2324208	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_013947	CG	3	6	2324234	2324239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4090	NC_013947	GGC	2	6	2324240	2324245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_013947	ACG	2	6	2324255	2324260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_013947	GGT	2	6	2324271	2324276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_013947	CG	4	8	2326388	2326395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4094	NC_013947	GTG	2	6	2326457	2326462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_013947	GCC	2	6	2326838	2326843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4096	NC_013947	GC	3	6	2326888	2326893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4097	NC_013947	CGA	2	6	2328628	2328633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_013947	C	6	6	2329361	2329366	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4099	NC_013947	CCCG	2	8	2329368	2329375	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4100	NC_013947	GAT	2	6	2330040	2330045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_013947	GGC	2	6	2330062	2330067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_013947	CCGCC	2	10	2330410	2330419	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
4103	NC_013947	ACC	2	6	2330422	2330427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4104	NC_013947	CCT	2	6	2333763	2333768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4105	NC_013947	CCGG	2	8	2333790	2333797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4106	NC_013947	GCA	2	6	2335984	2335989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_013947	CTC	2	6	2336033	2336038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4108	NC_013947	GCAG	2	8	2336059	2336066	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4109	NC_013947	CAC	2	6	2336074	2336079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4110	NC_013947	CGC	2	6	2336121	2336126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4111	NC_013947	GCA	2	6	2336152	2336157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_013947	CCGT	2	8	2336180	2336187	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4113	NC_013947	CCA	2	6	2336197	2336202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4114	NC_013947	ACC	2	6	2336214	2336219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4115	NC_013947	CGG	2	6	2336248	2336253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_013947	GCCA	2	8	2336304	2336311	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4117	NC_013947	CGG	2	6	2336317	2336322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_013947	GCGG	3	12	2336319	2336330	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4119	NC_013947	ACG	2	6	2336340	2336345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_013947	CGGGC	2	10	2336346	2336355	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4121	NC_013947	CCG	2	6	2336373	2336378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4122	NC_013947	CGG	2	6	2336425	2336430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_013947	GCG	2	6	2336443	2336448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_013947	CAG	2	6	2336474	2336479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_013947	GGC	2	6	2336480	2336485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_013947	GCC	2	6	2336553	2336558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4127	NC_013947	CGC	2	6	2337655	2337660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4128	NC_013947	GGC	2	6	2337690	2337695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_013947	GCG	2	6	2337770	2337775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_013947	GAT	2	6	2339711	2339716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4169	NC_013947	GGA	2	6	2352432	2352437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4257	NC_013947	TCG	2	6	2386564	2386569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4262	NC_013947	CGG	2	6	2386811	2386816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4387	NC_013947	CGGTG	2	10	2456783	2456792	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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