MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stackebrandtia nassauensis DSM 44728 chromosome

Total Repeats: 13084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013947	TCC	2	6	499644	499649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_013947	ACC	2	6	499675	499680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_013947	CGA	2	6	500460	500465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_013947	CCG	2	6	500494	500499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_013947	ACG	2	6	500504	500509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_013947	GCCT	2	8	500514	500521	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_013947	GAGGT	2	10	500525	500534	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_013947	CCT	2	6	501433	501438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_013947	CAT	2	6	501525	501530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_013947	CA	3	6	502448	502453	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_013947	TCA	2	6	502459	502464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_013947	CA	3	6	502498	502503	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_013947	CGG	2	6	502510	502515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_013947	G	6	6	502514	502519	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_013947	GCC	2	6	502523	502528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_013947	GC	4	8	502545	502552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_013947	CG	3	6	502564	502569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_013947	TG	3	6	502603	502608	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_013947	GAGGT	2	10	502616	502625	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_013947	GGC	2	6	502983	502988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_013947	GTC	3	9	502992	503000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_013947	CTC	3	9	503023	503031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_013947	CGC	2	6	503062	503067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_013947	ACCC	2	8	503461	503468	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1025	NC_013947	GAA	2	6	503474	503479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_013947	ACGAC	2	10	503529	503538	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1027	NC_013947	GCAG	2	8	503580	503587	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_013947	GCG	2	6	503592	503597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_013947	AGCC	2	8	503606	503613	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_013947	CCG	2	6	503634	503639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_013947	GC	3	6	503664	503669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_013947	C	6	6	503918	503923	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1033	NC_013947	CCG	2	6	503934	503939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_013947	GACGCC	2	12	504012	504023	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_013947	AACCCG	2	12	504048	504059	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_013947	GGT	2	6	509609	509614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_013947	ACCG	2	8	510152	510159	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_013947	CCG	2	6	511863	511868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_013947	CGCT	2	8	511878	511885	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_013947	CGT	2	6	514291	514296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_013947	GAAG	2	8	514303	514310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_013947	TCGA	2	8	514318	514325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_013947	ACGA	2	8	514333	514340	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_013947	CGC	2	6	514375	514380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_013947	AAG	2	6	514388	514393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_013947	AC	3	6	514418	514423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_013947	CT	3	6	514460	514465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_013947	CGC	2	6	515424	515429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_013947	CGC	2	6	516236	516241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_013947	GCC	2	6	516249	516254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_013947	ACG	2	6	516303	516308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_013947	CAG	2	6	516316	516321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_013947	ACG	2	6	516323	516328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_013947	TCT	2	6	518741	518746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_013947	AGG	2	6	518773	518778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_013947	GC	3	6	523168	523173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_013947	CG	3	6	523809	523814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_013947	GCG	2	6	526261	526266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_013947	AGGCG	2	10	527110	527119	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1060	NC_013947	GCG	2	6	529450	529455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_013947	CGT	2	6	529461	529466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_013947	TGAC	2	8	529524	529531	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_013947	CA	3	6	529533	529538	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_013947	GGT	2	6	529543	529548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_013947	CCA	2	6	531329	531334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_013947	CG	3	6	533925	533930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_013947	GTCC	2	8	535528	535535	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_013947	CGG	2	6	535627	535632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_013947	CTG	2	6	536156	536161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_013947	GC	3	6	536977	536982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_013947	GCC	2	6	536992	536997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_013947	GAC	2	6	541187	541192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_013947	CGC	2	6	545283	545288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_013947	CGA	2	6	545847	545852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_013947	GCC	2	6	545856	545861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_013947	GTG	2	6	545879	545884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_013947	ACC	2	6	545918	545923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_013947	CGT	2	6	545934	545939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_013947	AC	3	6	545940	545945	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_013947	CGG	2	6	545966	545971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_013947	GCGG	2	8	545984	545991	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_013947	CTTCG	2	10	548172	548181	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1083	NC_013947	CAA	2	6	548227	548232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_013947	CTA	2	6	548270	548275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_013947	AGC	2	6	548300	548305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_013947	CCG	2	6	548439	548444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_013947	CGG	2	6	548463	548468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_013947	AGG	2	6	548478	548483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_013947	CCA	2	6	548640	548645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_013947	GGGGA	2	10	548664	548673	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_013947	CCT	2	6	552771	552776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_013947	ACCG	2	8	552850	552857	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_013947	GCGAC	2	10	552888	552897	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1094	NC_013947	CCG	2	6	553914	553919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_013947	GTG	2	6	553928	553933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_013947	CGG	2	6	553941	553946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_013947	TCAGG	2	10	553952	553961	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1098	NC_013947	CAA	2	6	553985	553990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_013947	CAG	2	6	553994	553999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_013947	CA	3	6	554113	554118	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_013947	CGA	2	6	554119	554124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_013947	TCG	2	6	554160	554165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_013947	AGC	2	6	554166	554171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_013947	GCC	2	6	554172	554177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_013947	TCG	2	6	554181	554186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_013947	TCG	2	6	554199	554204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_013947	GCT	2	6	554888	554893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_013947	TCA	2	6	554905	554910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_013947	CAG	2	6	555090	555095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_013947	GAG	2	6	555123	555128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_013947	GA	3	6	555134	555139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_013947	ACC	2	6	555140	555145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_013947	CCG	2	6	555279	555284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_013947	GGC	2	6	555298	555303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_013947	CTC	2	6	555382	555387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_013947	GATA	2	8	555395	555402	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_013947	CAC	2	6	555433	555438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_013947	AGGC	2	8	555462	555469	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_013947	ACT	2	6	558061	558066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_013947	GGA	2	6	560004	560009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_013947	ACC	2	6	562343	562348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_013947	CAC	2	6	562370	562375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_013947	AGA	2	6	562418	562423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_013947	GGTAAG	2	12	562444	562455	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_013947	GCC	2	6	562477	562482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_013947	AGATC	2	10	562553	562562	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1127	NC_013947	AAC	2	6	562637	562642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_013947	TC	3	6	562745	562750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_013947	CTC	2	6	562759	562764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_013947	TCT	2	6	562768	562773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_013947	GAG	2	6	562782	562787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_013947	ATTC	2	8	562819	562826	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1133	NC_013947	ACA	2	6	563030	563035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_013947	ACC	2	6	567608	567613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_013947	GACGC	2	10	571266	571275	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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