MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus mutans NN2025

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013928	TTTTGT	2	12	1	12	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013928	GGAATA	2	12	14697	14708	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013928	TTACGT	2	12	19441	19452	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_013928	GGTAAA	2	12	39968	39979	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013928	TTTTAG	2	12	42455	42466	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013928	TGGATT	2	12	69692	69703	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013928	TAGAAT	2	12	116090	116101	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013928	ATGAGA	2	12	138023	138034	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013928	TCTTTT	2	12	152898	152909	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013928	ATCGTT	2	12	158531	158542	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_013928	TTTAAG	2	12	181327	181338	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013928	TTACGT	2	12	184221	184232	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013928	CTTACT	2	12	191600	191611	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013928	AGTAAA	2	12	266170	266181	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013928	TTATCA	2	12	276649	276660	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_013928	TTATCA	2	12	277499	277510	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_013928	TTTGAT	2	12	281479	281490	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013928	GCGAAA	2	12	289146	289157	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_013928	ATTGAA	2	12	289368	289379	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013928	TAAGAA	2	12	302226	302237	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013928	TTAACT	2	12	350588	350599	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_013928	GAAATA	2	12	361775	361786	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013928	AATAGA	2	12	361928	361939	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013928	TTACGT	2	12	380426	380437	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_013928	ATTAAT	2	12	393864	393875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013928	ATAAAT	2	12	394972	394983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013928	TTACGT	2	12	408162	408173	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_013928	TATTTT	2	12	413967	413978	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013928	CGTAGA	2	12	433653	433664	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_013928	GAAATT	2	12	455422	455433	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013928	GAAAGT	2	12	459662	459673	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013928	CTTTTT	2	12	460090	460101	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_013928	AAAAAT	2	12	512271	512282	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013928	AAAAAG	2	12	513727	513738	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013928	TGTAAA	2	12	515452	515463	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013928	TTGATT	2	12	532448	532459	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013928	TTTTCT	2	12	540768	540779	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013928	GTGATT	2	12	579615	579626	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013928	TCTTTT	2	12	583696	583707	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_013928	AAAACG	2	12	653813	653824	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_013928	TATAAA	2	12	682883	682894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013928	TAGATT	2	12	686104	686115	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013928	AATTTT	2	12	689303	689314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013928	TTTTAA	2	12	732122	732133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013928	TTATAA	2	12	734846	734857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013928	CCAAAA	2	12	744020	744031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013928	TAAAGA	2	12	761882	761893	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013928	GCTTTA	2	12	761894	761905	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_013928	ATAGAT	2	12	765651	765662	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013928	TAACAA	2	12	771494	771505	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_013928	ATATGG	2	12	772759	772770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013928	CTTTCA	2	12	794142	794153	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013928	TGAAAG	2	12	794167	794178	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013928	TAGAAA	2	12	830812	830823	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013928	TTCGGG	2	12	883862	883873	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_013928	TTTAAG	2	12	895586	895597	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013928	TTTTTA	2	12	895624	895635	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013928	ATTCTT	2	12	905140	905151	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_013928	TTATCT	2	12	965428	965439	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_013928	TAATTT	2	12	979964	979975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013928	ATTTTA	2	12	1002616	1002627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013928	CATGTA	2	12	1009716	1009727	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_013928	AAATTT	2	12	1015640	1015651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013928	TGATTA	2	12	1015840	1015851	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013928	AAATCT	2	12	1022992	1023003	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013928	AGTTAG	2	12	1062664	1062675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013928	TAAAAA	2	12	1067376	1067387	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013928	AATAGT	2	12	1080539	1080550	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013928	AGTGAA	2	12	1086845	1086856	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013928	TAGTGT	2	12	1121997	1122008	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013928	CATCTC	2	12	1131855	1131866	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013928	AGTTAT	2	12	1180617	1180628	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013928	TATAAC	2	12	1204767	1204778	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_013928	TATGTA	2	12	1204853	1204864	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013928	ATTAAT	2	12	1205014	1205025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013928	TATTAC	2	12	1257343	1257354	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_013928	AACAAA	2	12	1263133	1263144	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_013928	TAAAAT	2	12	1283534	1283545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013928	GCCTTA	2	12	1287289	1287300	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013928	GAAGAC	2	12	1303770	1303781	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_013928	AAAATC	2	12	1305503	1305514	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_013928	AAAAGA	2	12	1319267	1319278	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013928	CATTCT	2	12	1322569	1322580	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013928	GTAACC	2	12	1323221	1323232	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013928	GGACTT	2	12	1333672	1333683	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_013928	AAATCA	2	12	1341680	1341691	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_013928	AAAAGA	2	12	1344438	1344449	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013928	CTTTTT	2	12	1351174	1351185	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_013928	ATTGTT	2	12	1386790	1386801	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013928	AAAATT	2	12	1388062	1388073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013928	TGATAA	2	12	1403399	1403410	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013928	AAAAAT	2	12	1421200	1421211	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013928	AATTTT	2	12	1444679	1444690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013928	CGATCT	2	12	1445104	1445115	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013928	AAAGAA	2	12	1445237	1445248	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013928	AAAATT	2	12	1494838	1494849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013928	CTATTA	2	12	1504330	1504341	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_013928	TATAGT	2	12	1521089	1521100	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013928	AAAATT	2	12	1523644	1523655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013928	TATCAG	2	12	1534147	1534158	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_013928	TAAAGA	2	12	1568748	1568759	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013928	GTTTCT	2	12	1577446	1577457	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_013928	GCAAAG	2	12	1591385	1591396	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_013928	TAAAAG	2	12	1596979	1596990	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013928	GAATTA	2	12	1611181	1611192	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013928	CTTTTT	2	12	1615657	1615668	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_013928	AAAAAT	2	12	1619849	1619860	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013928	AAATTA	2	12	1637401	1637412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013928	CTAAGC	2	12	1666718	1666729	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013928	TAGTAA	2	12	1667528	1667539	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013928	TATTTA	2	12	1677778	1677789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013928	ATTTCA	2	12	1682806	1682817	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_013928	TGAAAA	2	12	1696653	1696664	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013928	TGACTT	2	12	1705844	1705855	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_013928	TTATAG	2	12	1705891	1705902	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013928	AAAATT	2	12	1716505	1716516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013928	AGAAAA	2	12	1717635	1717646	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013928	GTTAAT	2	12	1721015	1721026	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013928	CTTCTC	2	12	1782923	1782934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_013928	AAATCG	2	12	1797102	1797113	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_013928	GATGTA	2	12	1830417	1830428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013928	CCCGAA	2	12	1834741	1834752	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_013928	ACGTAA	2	12	1837999	1838010	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_013928	AAAAGA	2	12	1891053	1891064	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013928	AAAAAG	2	12	1897141	1897152	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013928	CTTTTT	2	12	1906178	1906189	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_013928	AAAAAG	2	12	1928725	1928736	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013928	GTTTTA	2	12	1930895	1930906	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013928	TATAGT	2	12	1931193	1931204	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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131	NC_013928	TCCTTT	2	12	1943806	1943817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013928	TCTTGT	2	12	1954234	1954245	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.