MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus lugdunensis HKU09-01 chromosome

Total Repeats: 10491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013893	ATA	2	6	27	32	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013893	TTA	2	6	74	79	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013893	AAT	2	6	108	113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013893	ATA	2	6	135	140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013893	AC	3	6	216	221	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013893	ATT	2	6	234	239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013893	TTA	2	6	266	271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013893	T	6	6	276	281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013893	AAAT	2	8	284	291	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013893	ATT	2	6	318	323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013893	TAA	2	6	328	333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013893	TCA	2	6	387	392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013893	T	6	6	890	895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013893	ATT	2	6	925	930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013893	AGT	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013893	AT	3	6	994	999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013893	TTC	2	6	1027	1032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013893	GAT	2	6	1044	1049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013893	TAA	2	6	1067	1072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013893	ATC	2	6	1494	1499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013893	TAAT	2	8	1505	1512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013893	TAA	2	6	1526	1531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013893	TGT	2	6	1558	1563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013893	ATT	2	6	1567	1572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013893	TAA	2	6	1573	1578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013893	AG	3	6	2011	2016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013893	TAAT	2	8	2029	2036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013893	TAA	2	6	2042	2047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013893	T	7	7	2069	2075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013893	TAA	2	6	2180	2185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013893	ATT	2	6	2192	2197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013893	ATA	2	6	2250	2255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013893	A	6	6	2262	2267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013893	TAA	2	6	2268	2273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013893	GTT	2	6	2292	2297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013893	TAT	2	6	2818	2823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013893	T	6	6	2846	2851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013893	T	6	6	2874	2879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013893	TTA	2	6	2881	2886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013893	GTA	2	6	2887	2892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013893	AATC	2	8	2967	2974	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013893	TAA	2	6	2988	2993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013893	TAC	2	6	3037	3042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013893	T	6	6	3129	3134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013893	TTTA	2	8	3143	3150	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013893	AAATG	2	10	3204	3213	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013893	T	7	7	4311	4317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013893	ATC	2	6	4905	4910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013893	TA	3	6	4939	4944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013893	AATT	2	8	4960	4967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013893	AC	3	6	4986	4991	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013893	TAA	2	6	4997	5002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013893	AATT	2	8	5015	5022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013893	TA	4	8	5024	5031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013893	A	6	6	5031	5036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013893	GGA	2	6	5038	5043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013893	GGT	2	6	5976	5981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013893	TAA	2	6	6655	6660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013893	ACT	2	6	6683	6688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013893	AGT	2	6	6701	6706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013893	AGCA	2	8	6718	6725	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_013893	AT	3	6	6759	6764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013893	TGCAAC	2	12	6777	6788	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013893	TGTT	2	8	6811	6818	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013893	CTT	2	6	6941	6946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013893	A	6	6	7013	7018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013893	TTAT	2	8	7027	7034	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013893	CTT	3	9	8040	8048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013893	ATG	2	6	8198	8203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013893	ATG	2	6	8321	8326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013893	GAT	2	6	8339	8344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013893	A	6	6	8353	8358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013893	ATT	2	6	8388	8393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013893	ACC	2	6	8420	8425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_013893	ATT	2	6	8476	8481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013893	T	6	6	8495	8500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013893	T	6	6	8516	8521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013893	TAA	2	6	8602	8607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013893	ATA	2	6	8611	8616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013893	A	6	6	8620	8625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013893	AT	3	6	8632	8637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013893	A	7	7	8640	8646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013893	ATAAA	2	10	8702	8711	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013893	ATC	2	6	8759	8764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013893	GCAT	2	8	8787	8794	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_013893	TTA	2	6	8797	8802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013893	ATT	2	6	8804	8809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013893	ACT	2	6	8839	8844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013893	CAG	2	6	8890	8895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013893	ATT	2	6	8900	8905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013893	TGC	2	6	8924	8929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013893	CTTT	2	8	9017	9024	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_013893	CCCCA	2	10	9046	9055	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
94	NC_013893	TTGCT	2	10	9058	9067	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_013893	TTG	2	6	9094	9099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013893	TAA	2	6	9213	9218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013893	ACTAA	2	10	9224	9233	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_013893	ATA	2	6	9324	9329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013893	TTG	2	6	9351	9356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013893	TAT	2	6	9432	9437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013893	AAT	2	6	9469	9474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013893	T	6	6	9491	9496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013893	T	6	6	9530	9535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013893	TA	3	6	9537	9542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013893	A	6	6	9612	9617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013893	TAAA	2	8	9677	9684	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013893	AAT	2	6	11540	11545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013893	TAA	2	6	12719	12724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013893	TTA	2	6	12731	12736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013893	A	6	6	15570	15575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013893	A	6	6	15629	15634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013893	AT	3	6	15684	15689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013893	A	6	6	15744	15749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013893	AGC	2	6	15759	15764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013893	CGT	3	9	15773	15781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013893	TAAC	2	8	15784	15791	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_013893	ATT	2	6	17577	17582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013893	ATT	2	6	17590	17595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013893	TAAT	2	8	17601	17608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013893	CCT	2	6	20229	20234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_013893	AAT	2	6	20273	20278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013893	A	6	6	20290	20295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013893	AAT	2	6	20355	20360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013893	AGT	2	6	20456	20461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013893	TA	3	6	20466	20471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013893	AAT	2	6	20546	20551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013893	ATT	2	6	20570	20575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013893	TAAAT	2	10	20596	20605	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013893	ATT	2	6	20624	20629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013893	T	7	7	20628	20634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013893	ATA	2	6	20692	20697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013893	TGA	2	6	25299	25304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013893	A	7	7	27986	27992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013893	TTA	3	9	28008	28016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013893	AT	3	6	28079	28084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013893	TA	3	6	28095	28100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013893	GAA	2	6	28128	28133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013893	A	7	7	28158	28164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013893	CTT	2	6	28167	28172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_013893	TA	3	6	28176	28181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013893	AAT	2	6	28561	28566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013893	AGT	2	6	29280	29285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013893	AT	4	8	29329	29336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013893	T	6	6	29362	29367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013893	AATT	2	8	29453	29460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013893	TCA	2	6	29574	29579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_013893	TA	3	6	29588	29593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013893	TTTTG	2	10	29596	29605	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013893	TATTT	2	10	29652	29661	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013893	TTA	2	6	29672	29677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013893	AAC	2	6	29780	29785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_013893	TTTA	2	8	29788	29795	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_013893	TAA	2	6	38831	38836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_013893	ATT	2	6	116743	116748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_013893	AAT	2	6	116981	116986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_013893	TTA	2	6	128711	128716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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