MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus mitis B6

Total Repeats: 295

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013853	TGAAA	2	10	2974	2983	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013853	AGGAA	2	10	9060	9069	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013853	TCGTG	2	10	17765	17774	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_013853	GTTAA	2	10	18487	18496	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013853	GGGAG	2	10	19005	19014	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013853	AGGGA	2	10	21216	21225	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013853	CTTTT	2	10	23900	23909	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_013853	GACAA	2	10	27869	27878	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013853	AATGG	2	10	33979	33988	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013853	AACAG	2	10	42875	42884	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_013853	AAGCT	2	10	43488	43497	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013853	AAACT	2	10	50318	50327	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_013853	GTGGG	2	10	56518	56527	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013853	AGATT	2	10	58130	58139	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013853	AAGGA	2	10	60319	60328	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013853	ATTTA	2	10	60515	60524	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013853	ATTTA	2	10	60641	60650	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013853	TATCG	2	10	61934	61943	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013853	GAGTA	2	10	62065	62074	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013853	GCTAG	2	10	62113	62122	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_013853	AGAGG	2	10	65078	65087	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013853	AAAGG	2	10	72942	72951	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013853	CAATC	2	10	78543	78552	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_013853	ATTCA	2	10	89163	89172	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_013853	GAGAA	2	10	90965	90974	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013853	AAACT	2	10	97127	97136	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_013853	AGAAA	2	10	104596	104605	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013853	AGACT	2	10	104641	104650	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_013853	TCCCG	2	10	106051	106060	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_013853	GCTTT	2	10	110103	110112	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_013853	GTAAA	2	10	111885	111894	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013853	ATTAC	2	10	119551	119560	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_013853	CTATA	2	10	123123	123132	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_013853	TTTTA	2	10	138639	138648	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013853	ATAAG	2	10	138728	138737	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013853	ATCTT	2	10	142822	142831	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_013853	TTTTA	2	10	158581	158590	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013853	AACCA	2	10	159153	159162	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_013853	TGATA	2	10	168043	168052	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013853	ATTTT	2	10	169709	169718	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013853	ATATA	2	10	171279	171288	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013853	TCGTG	2	10	174739	174748	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_013853	GTTAA	2	10	175461	175470	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013853	GGGAG	2	10	175979	175988	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013853	AGGGA	2	10	178190	178199	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013853	TAGTT	2	10	180857	180866	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013853	CCGCT	2	10	183588	183597	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
48	NC_013853	GTATA	2	10	189489	189498	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013853	GTAGG	2	10	196895	196904	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013853	ATTAT	2	10	203954	203963	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013853	TCAAT	2	10	209292	209301	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_013853	CTAAA	2	10	209311	209320	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_013853	GAGTT	2	10	212303	212312	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013853	ATTGA	2	10	219881	219890	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013853	TAGAA	2	10	222984	222993	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013853	TCGTG	2	10	239821	239830	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_013853	GTTAA	2	10	240543	240552	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013853	GGGAG	2	10	241061	241070	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013853	AGGGA	2	10	243272	243281	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013853	TTCAA	2	10	251799	251808	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_013853	AATAG	2	10	251900	251909	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013853	TAGAC	2	10	258768	258777	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_013853	CTACA	2	10	265700	265709	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_013853	ATAAA	2	10	283734	283743	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013853	AAATG	2	10	298204	298213	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013853	ATAGA	2	10	299099	299108	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013853	AATAG	2	10	301542	301551	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013853	TCTTT	2	10	308599	308608	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_013853	AGATA	2	10	314508	314517	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013853	TCTAT	2	10	335629	335638	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_013853	CTATT	2	10	337481	337490	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_013853	AATAA	2	10	343082	343091	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013853	CTTTT	2	10	344350	344359	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_013853	TAAAA	2	10	344363	344372	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013853	ATATA	2	10	356800	356809	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013853	TTCTT	2	10	359259	359268	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_013853	ATTGG	2	10	372347	372356	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013853	TATAA	2	10	372443	372452	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013853	CTTTT	2	10	375063	375072	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_013853	ATTTT	2	10	384889	384898	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013853	GAATG	2	10	412835	412844	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013853	TTGTT	2	10	442031	442040	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013853	TTAAA	2	10	445948	445957	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013853	TCGTG	2	10	452434	452443	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_013853	GTTAA	2	10	453156	453165	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013853	GGGAG	2	10	453674	453683	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013853	AGGGA	2	10	455885	455894	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013853	ATTAC	2	10	457571	457580	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_013853	TTTTA	2	10	476800	476809	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013853	TAGAA	2	10	478395	478404	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013853	GTCAG	2	10	485125	485134	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_013853	TTTCA	2	10	488182	488191	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_013853	AAAGA	2	10	488287	488296	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013853	TAATA	2	10	496013	496022	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013853	AATTA	2	10	497008	497017	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013853	CTTTT	2	10	501391	501400	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_013853	AAAAG	2	10	501962	501971	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013853	TCCTT	2	10	519922	519931	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_013853	GAAAA	2	10	520027	520036	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013853	TATTT	2	10	534453	534462	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013853	ATTTT	2	10	535757	535766	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013853	GAATA	2	10	538989	538998	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013853	ATAAA	2	10	545096	545105	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013853	ATATA	2	10	554461	554470	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013853	TTTTA	2	10	573359	573368	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013853	TCCTT	2	10	573873	573882	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_013853	ATAGA	2	10	573922	573931	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013853	AAAAG	2	10	587258	587267	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013853	ACCTT	2	10	606735	606744	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_013853	TTCTT	2	10	611209	611218	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_013853	TGATA	2	10	612867	612876	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013853	CTTTT	2	10	633337	633346	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_013853	AAAAG	2	10	633398	633407	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013853	TAATT	2	10	635165	635174	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013853	ATGAA	2	10	638213	638222	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013853	AGTAA	2	10	638270	638279	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013853	TTTCA	2	10	642352	642361	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_013853	TAATC	2	10	646781	646790	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_013853	AAAAT	2	10	653195	653204	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013853	ATAAA	2	10	665991	666000	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013853	ATAGA	2	10	668053	668062	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013853	TATAG	2	10	675445	675454	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013853	CTATG	2	10	677865	677874	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_013853	AATTC	2	10	706447	706456	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_013853	ATTTT	2	10	706953	706962	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013853	ACAAA	2	10	715813	715822	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_013853	ACAAA	2	10	715855	715864	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_013853	ACGAT	2	10	721923	721932	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_013853	TAAAA	2	10	736777	736786	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013853	ATAAA	2	10	748523	748532	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013853	TCCTT	2	10	765599	765608	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_013853	TAAAA	2	10	765651	765660	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013853	TAATT	2	10	771760	771769	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013853	GACAA	2	10	779926	779935	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_013853	ATGTT	2	10	781318	781327	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013853	GATTT	2	10	781456	781465	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013853	TAAAA	2	10	790629	790638	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013853	GGAAA	2	10	795621	795630	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013853	TAAAA	2	10	832989	832998	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013853	TAATT	2	10	833872	833881	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013853	ATAAA	2	10	834044	834053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013853	AAATA	2	10	846569	846578	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013853	ACTTT	2	10	853593	853602	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_013853	TATTT	2	10	863925	863934	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013853	AAAAG	2	10	879437	879446	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013853	ATAGA	2	10	892756	892765	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013853	TCTTT	2	10	916555	916564	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_013853	TAGAT	2	10	930785	930794	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_013853	TCCTT	2	10	2082506	2082515	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
290	NC_013853	TTTTG	2	10	2101398	2101407	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
291	NC_013853	CTTCC	2	10	2110467	2110476	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
292	NC_013853	ATTTT	2	10	2113668	2113677	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_013853	GCCCT	2	10	2118759	2118768	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
294	NC_013853	AGCTA	2	10	2143679	2143688	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
295	NC_013853	AAAAG	2	10	2145613	2145622	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.