MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Spirosoma linguale DSM 74 plasmid pSLIN01

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013731	GGAA	2	8	2399	2406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013731	GGGT	2	8	2432	2439	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013731	ATTC	2	8	2608	2615	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013731	TTTG	2	8	2713	2720	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013731	CAAT	2	8	3497	3504	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013731	GATT	2	8	10162	10169	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013731	GCAG	2	8	16143	16150	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013731	CATC	2	8	18186	18193	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013731	TACC	2	8	19822	19829	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013731	CTAT	2	8	20999	21006	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013731	TAGG	2	8	21072	21079	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013731	TAAA	2	8	23139	23146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013731	GAGC	2	8	23488	23495	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013731	ACAA	2	8	25690	25697	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013731	ATTT	2	8	25702	25709	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013731	CCGG	2	8	25728	25735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013731	TTCA	2	8	29301	29308	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013731	CGGG	2	8	32544	32551	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013731	TTGG	2	8	32690	32697	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013731	TCAA	2	8	32811	32818	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013731	AAAT	2	8	32833	32840	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013731	AAGG	2	8	37173	37180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013731	TACA	2	8	43421	43428	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013731	AACA	2	8	46555	46562	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013731	AGAA	2	8	47321	47328	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013731	TTGA	2	8	49675	49682	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013731	GTTT	2	8	50086	50093	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013731	AAAT	2	8	52085	52092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013731	TCGT	2	8	53884	53891	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013731	TATT	2	8	54113	54120	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013731	TTAA	2	8	55547	55554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013731	ATAA	2	8	64906	64913	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013731	TAAA	2	8	70608	70615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013731	TGGG	2	8	74197	74204	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013731	ACGA	2	8	79020	79027	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013731	GTGC	2	8	80210	80217	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013731	TAAC	2	8	85837	85844	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_013731	TTTA	2	8	86321	86328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013731	TACC	2	8	87640	87647	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013731	GTTC	2	8	90798	90805	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013731	TGCT	2	8	90813	90820	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013731	GCCA	2	8	91150	91157	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013731	TTTA	2	8	93502	93509	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013731	CTCA	2	8	95360	95367	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013731	TAGC	2	8	96132	96139	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013731	GGTT	2	8	98063	98070	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013731	AAGG	2	8	98110	98117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013731	GCCT	2	8	103542	103549	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013731	TAAG	2	8	103634	103641	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013731	TTAC	2	8	103649	103656	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013731	AAAG	2	8	103658	103665	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013731	TGAT	2	8	104396	104403	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013731	GATT	2	8	105870	105877	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013731	GGGT	2	8	113716	113723	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013731	AAAG	2	8	113766	113773	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013731	GCCA	2	8	114010	114017	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013731	CGCC	2	8	114126	114133	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
58	NC_013731	TTGA	2	8	115423	115430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013731	TGCC	2	8	115488	115495	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013731	AGCA	2	8	115852	115859	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013731	TTGA	2	8	116175	116182	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013731	ATGA	2	8	116521	116528	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013731	AATA	2	8	126158	126165	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013731	TTCA	2	8	126175	126182	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_013731	GCGG	2	8	126488	126495	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013731	AGAC	2	8	126560	126567	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_013731	TTTA	2	8	126839	126846	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013731	AATA	2	8	126850	126857	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013731	CGGG	2	8	128628	128635	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013731	TTTG	2	8	128707	128714	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013731	CATT	2	8	131016	131023	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_013731	GCTG	2	8	131440	131447	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_013731	TAGC	2	8	132828	132835	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_013731	TGGC	2	8	132860	132867	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_013731	CGGG	2	8	134833	134840	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_013731	CTTT	2	8	135324	135331	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_013731	ACAA	2	8	147821	147828	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_013731	ACCA	2	8	151535	151542	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013731	GGGC	2	8	151716	151723	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_013731	CGTT	2	8	151885	151892	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_013731	CAAT	2	8	154505	154512	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_013731	TGGT	2	8	155642	155649	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013731	TACG	2	8	155735	155742	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_013731	CCAG	2	8	157503	157510	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_013731	TGCG	2	8	158922	158929	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_013731	GAAC	2	8	161522	161529	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_013731	GTTA	2	8	162529	162536	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013731	CCAA	2	8	164720	164727	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013731	ACCC	2	8	165022	165029	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_013731	GCGG	2	8	167455	167462	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_013731	TGGG	2	8	167485	167492	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013731	TTGC	2	8	168936	168943	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_013731	AGGT	2	8	169057	169064	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013731	CAAA	2	8	169144	169151	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_013731	TGGC	2	8	169156	169163	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_013731	AATT	2	8	169200	169207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013731	TACT	2	8	170721	170728	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_013731	TGGC	2	8	172436	172443	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_013731	CGGA	2	8	172875	172882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_013731	TTGG	2	8	179489	179496	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013731	GTCG	2	8	180408	180415	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_013731	ATTG	2	8	180432	180439	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013731	ACCC	2	8	180801	180808	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
104	NC_013731	CGAC	2	8	181452	181459	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_013731	AAGA	2	8	181532	181539	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013731	TTTC	2	8	182258	182265	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013731	AAAC	2	8	188664	188671	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_013731	CAAC	2	8	188932	188939	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.