MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptosporangium roseum DSM 43021 chromosome

Total Repeats: 35733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013595	GTC	2	6	208497	208502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_013595	GCGGT	2	10	208530	208539	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1003	NC_013595	GTG	2	6	208572	208577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_013595	TGG	2	6	208591	208596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_013595	GGC	2	6	208631	208636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_013595	CAG	2	6	208637	208642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_013595	TGC	2	6	208741	208746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_013595	GCGA	2	8	208755	208762	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_013595	GTC	2	6	208784	208789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_013595	GCC	2	6	208818	208823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_013595	TCC	2	6	209505	209510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_013595	GAGG	2	8	209544	209551	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_013595	CGC	2	6	209601	209606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_013595	AGT	2	6	209661	209666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_013595	ATC	2	6	209672	209677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_013595	AAG	2	6	209691	209696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_013595	TCCAC	2	10	209742	209751	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1018	NC_013595	CGG	2	6	209756	209761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_013595	CG	3	6	209790	209795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_013595	CGT	2	6	209802	209807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_013595	GCC	2	6	209831	209836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_013595	CAC	2	6	209846	209851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_013595	CGA	2	6	209953	209958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_013595	GTG	2	6	209978	209983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_013595	TCG	2	6	210016	210021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_013595	GGGT	2	8	210043	210050	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_013595	CTC	2	6	211951	211956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_013595	GTT	2	6	212659	212664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_013595	GGC	2	6	212832	212837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_013595	CGG	2	6	212867	212872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_013595	CGG	2	6	212884	212889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_013595	GCCG	2	8	212913	212920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_013595	CGG	2	6	212997	213002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_013595	GC	3	6	213033	213038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_013595	CGC	2	6	213046	213051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_013595	C	6	6	213082	213087	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1037	NC_013595	C	6	6	213096	213101	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1038	NC_013595	CGC	2	6	213113	213118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_013595	GCC	2	6	213132	213137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_013595	CAC	2	6	213143	213148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_013595	C	6	6	213155	213160	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1042	NC_013595	GCC	2	6	213185	213190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_013595	TCG	2	6	213213	213218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_013595	TCC	2	6	213267	213272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_013595	CCG	2	6	213330	213335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_013595	CGC	2	6	214076	214081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_013595	GC	3	6	214085	214090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_013595	GCGA	2	8	214648	214655	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_013595	TCG	2	6	214830	214835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_013595	CGG	2	6	214836	214841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_013595	GCG	2	6	214860	214865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_013595	AACG	2	8	215054	215061	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_013595	CGC	2	6	215090	215095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_013595	CTG	2	6	215103	215108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_013595	CCGG	2	8	215111	215118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1056	NC_013595	TTC	2	6	215144	215149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_013595	GGC	2	6	215174	215179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_013595	GGA	2	6	215195	215200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_013595	CCG	2	6	215213	215218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_013595	CAG	2	6	215251	215256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_013595	CGGT	2	8	215284	215291	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1062	NC_013595	AGG	2	6	215294	215299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_013595	GGCC	2	8	216753	216760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_013595	GGGA	2	8	216775	216782	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_013595	GGAAG	2	10	217297	217306	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_013595	CTCGAC	2	12	217350	217361	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_013595	GGT	2	6	217410	217415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_013595	TCG	2	6	217427	217432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_013595	CCT	2	6	217433	217438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_013595	GGTG	2	8	217480	217487	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_013595	GGC	2	6	217490	217495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_013595	CGG	2	6	217609	217614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_013595	CGG	2	6	219409	219414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_013595	TCG	2	6	220131	220136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_013595	CGCGG	2	10	220250	220259	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1076	NC_013595	CCA	2	6	220275	220280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_013595	CGG	2	6	220285	220290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_013595	ATC	2	6	220326	220331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_013595	AATT	2	8	220343	220350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_013595	CGC	2	6	220392	220397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_013595	G	6	6	220426	220431	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_013595	CGT	2	6	221717	221722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_013595	GGC	2	6	221728	221733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_013595	GAG	2	6	221829	221834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_013595	ACG	2	6	221848	221853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_013595	CGG	2	6	226151	226156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_013595	AC	3	6	226201	226206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1088	NC_013595	TCA	2	6	226223	226228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_013595	CGA	2	6	226233	226238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_013595	CCGG	2	8	226242	226249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_013595	G	6	6	226248	226253	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_013595	CCT	2	6	226865	226870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_013595	ACC	2	6	226915	226920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_013595	AGA	2	6	227093	227098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_013595	GCACG	2	10	227124	227133	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1096	NC_013595	TCCC	2	8	227147	227154	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1097	NC_013595	CGGC	2	8	227206	227213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_013595	CCG	2	6	227344	227349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_013595	TCC	2	6	227367	227372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_013595	CACCG	2	10	227413	227422	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1101	NC_013595	TCC	2	6	227473	227478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_013595	TCC	2	6	227514	227519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_013595	CGA	2	6	227571	227576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_013595	TTAC	2	8	227634	227641	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_013595	AGCG	2	8	227644	227651	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1106	NC_013595	CAG	2	6	227722	227727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_013595	ATC	2	6	227745	227750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_013595	CAG	2	6	227776	227781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_013595	CGT	2	6	227854	227859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_013595	GGA	2	6	227860	227865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_013595	GAA	2	6	227869	227874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_013595	GATC	2	8	228429	228436	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1113	NC_013595	C	6	6	228572	228577	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1114	NC_013595	CGGC	2	8	228605	228612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_013595	CCA	2	6	228695	228700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_013595	CGC	3	9	228720	228728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_013595	CGGTG	2	10	228741	228750	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1118	NC_013595	GGA	2	6	228762	228767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_013595	GACAGG	3	18	228834	228851	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1120	NC_013595	CGG	2	6	228867	228872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_013595	CGG	2	6	228879	228884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_013595	CGG	2	6	228901	228906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_013595	CCG	2	6	229060	229065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_013595	GACC	2	8	229182	229189	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_013595	GGC	2	6	229191	229196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_013595	CGG	2	6	229221	229226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_013595	GTCA	2	8	229234	229241	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1128	NC_013595	AGC	2	6	229259	229264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_013595	ACA	2	6	229265	229270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_013595	GGCC	2	8	229310	229317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_013595	ACG	2	6	229330	229335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_013595	CCG	2	6	229468	229473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_013595	GAT	2	6	229483	229488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_013595	CCG	2	6	230674	230679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_013595	GCA	2	6	230748	230753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_013595	GTG	2	6	230824	230829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_013595	GTG	2	6	230842	230847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_013595	AG	3	6	230964	230969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_013595	GCAC	2	8	232893	232900	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1140	NC_013595	AGC	2	6	232943	232948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1141	NC_013595	AAG	2	6	233048	233053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_013595	GGTC	2	8	233124	233131	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1143	NC_013595	TCC	2	6	233199	233204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1144	NC_013595	TGG	2	6	233985	233990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1148	NC_013595	CGC	2	6	234315	234320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1150	NC_013595	CGG	2	6	234410	234415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1153	NC_013595	CGC	2	6	234587	234592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1155	NC_013595	CTT	2	6	234638	234643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1157	NC_013595	G	6	6	235494	235499	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1158	NC_013595	AG	3	6	235520	235525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1159	NC_013595	GTG	2	6	235584	235589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1160	NC_013595	CTC	2	6	235676	235681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1161	NC_013595	GCC	2	6	235708	235713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1162	NC_013595	CG	3	6	235737	235742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1163	NC_013595	TTG	2	6	235759	235764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1164	NC_013595	CCG	2	6	235773	235778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1165	NC_013595	GC	3	6	235782	235787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1166	NC_013595	CTG	2	6	235789	235794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1167	NC_013595	CAC	2	6	235804	235809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1171	NC_013595	CGG	2	6	236045	236050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1195	NC_013595	CGG	2	6	240668	240673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1250	NC_013595	ATC	2	6	246200	246205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1252	NC_013595	GCG	2	6	246276	246281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1253	NC_013595	CGA	2	6	246691	246696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1254	NC_013595	GA	3	6	246741	246746	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_013595	GAT	2	6	246790	246795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1257	NC_013595	CA	3	6	246894	246899	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1258	NC_013595	G	7	7	246988	246994	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1259	NC_013595	TGGTG	2	10	247045	247054	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1260	NC_013595	GGC	2	6	247164	247169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1261	NC_013595	CGG	2	6	247174	247179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1262	NC_013595	AGC	2	6	247198	247203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1263	NC_013595	GAC	2	6	247225	247230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1264	NC_013595	CGGC	2	8	247295	247302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1265	NC_013595	CTG	3	9	247315	247323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1266	NC_013595	CCCAC	2	10	247392	247401	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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1268	NC_013595	TCG	2	6	247567	247572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1500	NC_013595	GA	3	6	326104	326109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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