MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sanguibacter keddieii DSM 10542 chromosome

Total Repeats: 171

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013521	CCGGCC	2	12	8665	8676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_013521	GCACCC	2	12	61267	61278	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_013521	GTCAGG	2	12	83872	83883	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_013521	CGGTCT	2	12	106761	106772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013521	TCGCCA	2	12	114091	114102	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013521	TCCGGA	2	12	146829	146840	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013521	CCGCAC	2	12	186256	186267	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_013521	CTCCGC	2	12	193254	193265	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_013521	CCGTCC	2	12	200511	200522	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_013521	TGCAGG	2	12	220558	220569	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_013521	ACCCGT	2	12	249532	249543	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013521	GGTGCT	2	12	250680	250691	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013521	GGTGCG	6	36	250726	250761	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013521	GACGCC	2	12	276127	276138	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013521	TGCTCC	2	12	289071	289082	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013521	GTCGCC	2	12	297723	297734	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013521	GTCTCG	2	12	304711	304722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013521	GCCGCA	2	12	450863	450874	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013521	GGGAGA	2	12	468840	468851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013521	CTGGTC	2	12	473643	473654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013521	GGAGGC	2	12	481361	481372	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_013521	GTCGCG	2	12	509160	509171	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013521	GCGCTC	2	12	531944	531955	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013521	CGGGGG	2	12	556162	556173	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_013521	GGGCGA	2	12	556644	556655	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_013521	GAGGGA	2	12	573736	573747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013521	TCGACC	2	12	607512	607523	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013521	GCCGAC	2	12	612171	612182	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013521	CGAGGC	2	12	640771	640782	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013521	CGTCGC	2	12	649493	649504	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013521	CGAGGA	2	12	655094	655105	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_013521	CGCTCG	2	12	759600	759611	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013521	AGTGCA	2	12	796411	796422	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_013521	GACGGG	2	12	908146	908157	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_013521	TCGGCG	2	12	920127	920138	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013521	GGCGGA	2	12	959407	959418	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_013521	GGCGCA	2	12	980570	980581	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013521	GCCTCG	2	12	999908	999919	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013521	GAAGTT	2	12	1029448	1029459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013521	GACGCT	2	12	1029562	1029573	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013521	GCACGA	2	12	1031862	1031873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013521	CAGACG	2	12	1068674	1068685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013521	CCAGCA	7	42	1119783	1119824	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013521	CGCCGG	2	12	1167540	1167551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013521	CGCCTG	2	12	1229607	1229618	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013521	AGTGCA	2	12	1234586	1234597	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_013521	CCCGTG	2	12	1369637	1369648	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013521	ACGGCG	2	12	1371702	1371713	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013521	CCTGCG	2	12	1387381	1387392	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013521	GGGGAT	2	12	1555583	1555594	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013521	CCCCTG	2	12	1562576	1562587	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_013521	CCCAGC	2	12	1570241	1570252	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_013521	CCCAGG	2	12	1625240	1625251	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013521	CAGGCC	2	12	1625262	1625273	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013521	TGCGGC	2	12	1632179	1632190	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013521	GGTCGC	2	12	1632235	1632246	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013521	GGGGTC	2	12	1652463	1652474	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_013521	GCGTGG	2	12	1688989	1689000	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_013521	CGGTGC	2	12	1747081	1747092	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013521	CAGTGG	2	12	1762588	1762599	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_013521	GCCGAC	2	12	1774854	1774865	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013521	CGGGTG	2	12	1777930	1777941	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_013521	CGGTCC	2	12	1812662	1812673	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_013521	GGCGCG	2	12	1812687	1812698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013521	GGCGCC	2	12	1908834	1908845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_013521	GGGGGA	2	12	1908848	1908859	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013521	CTGTGC	7	42	1909064	1909105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013521	CAGTGC	2	12	1909106	1909117	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013521	ACGCCT	2	12	1936561	1936572	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_013521	CTACCT	2	12	1971021	1971032	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013521	CCGCTG	2	12	1985036	1985047	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013521	CGGCCG	2	12	1995508	1995519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013521	GTGCTC	2	12	2073894	2073905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013521	TCGAGG	2	12	2073946	2073957	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_013521	CTCGTG	2	12	2087044	2087055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013521	CCGGGC	2	12	2105877	2105888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013521	GCCACG	2	12	2234792	2234803	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013521	CCAGAT	2	12	2234848	2234859	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013521	GACGTC	2	12	2242053	2242064	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013521	TCACCG	2	12	2261944	2261955	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
81	NC_013521	ACCCAC	2	12	2296579	2296590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_013521	GCTCGT	2	12	2351372	2351383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013521	TGGGTC	2	12	2387842	2387853	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_013521	GACCTG	2	12	2399393	2399404	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013521	GGACCG	2	12	2423937	2423948	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013521	CGGTCC	2	12	2423964	2423975	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013521	GCGCCG	2	12	2445503	2445514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013521	TGCACT	2	12	2471601	2471612	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013521	CCGTCC	2	12	2476749	2476760	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_013521	CCGTCC	2	12	2479411	2479422	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_013521	ACGACC	2	12	2570402	2570413	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_013521	CGACGT	2	12	2588813	2588824	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013521	CGGGGA	2	12	2594444	2594455	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_013521	CCGTCC	2	12	2664337	2664348	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_013521	GTGGCT	3	18	2673444	2673461	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_013521	GCTGTC	2	12	2673483	2673494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013521	CCGGCA	2	12	2673602	2673613	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013521	CGGCCG	2	12	2684797	2684808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013521	GTCGGC	2	12	2720217	2720228	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013521	CCCATG	2	12	2732668	2732679	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013521	ACCGGG	2	12	2735574	2735585	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013521	GGGCGG	2	12	2771065	2771076	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_013521	CGCGGC	2	12	2771110	2771121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_013521	CGCGAG	2	12	2779327	2779338	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013521	CGGGAG	2	12	2795087	2795098	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_013521	GTCGAA	2	12	2795222	2795233	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_013521	CACGGT	3	18	2814408	2814425	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013521	GCAGGA	2	12	2833973	2833984	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_013521	GGTCCT	2	12	2871749	2871760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013521	GCTGCC	2	12	2878246	2878257	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013521	GCCCGG	2	12	2947018	2947029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_013521	GAGGAA	2	12	2955854	2955865	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013521	GCTCAC	2	12	3029735	3029746	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_013521	AGGGCC	2	12	3073521	3073532	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013521	CCCGCG	2	12	3105169	3105180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_013521	GCCTCC	2	12	3106412	3106423	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_013521	GCTGAG	2	12	3128461	3128472	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_013521	AGGTGG	2	12	3135083	3135094	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013521	GCCGAA	2	12	3164356	3164367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013521	GCTCTG	2	12	3167268	3167279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013521	TCGGTC	2	12	3216073	3216084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013521	CCGAAC	2	12	3218644	3218655	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_013521	CCCACC	2	12	3301841	3301852	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
124	NC_013521	GCACGG	2	12	3307814	3307825	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013521	GCCCCG	2	12	3365925	3365936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_013521	GACGGC	2	12	3375520	3375531	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013521	GGGCCA	2	12	3397213	3397224	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013521	ACCAGC	2	12	3407805	3407816	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
129	NC_013521	TCTCGC	2	12	3415056	3415067	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
130	NC_013521	TCGGGT	2	12	3426110	3426121	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_013521	CCGCGC	2	12	3428513	3428524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_013521	CGTCAC	2	12	3433315	3433326	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
133	NC_013521	CGTGGG	2	12	3592470	3592481	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_013521	GCCGTC	2	12	3602845	3602856	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
135	NC_013521	AGACGG	2	12	3610016	3610027	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_013521	CGAGGG	2	12	3636348	3636359	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_013521	GCGCCC	2	12	3672484	3672495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_013521	GTCGCC	2	12	3713836	3713847	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
139	NC_013521	AGCGCC	2	12	3714018	3714029	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
140	NC_013521	GATCAC	2	12	3750550	3750561	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_013521	AGGGCG	2	12	3800215	3800226	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_013521	CCCGCT	2	12	3814807	3814818	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_013521	GCCCGT	2	12	3815058	3815069	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
144	NC_013521	CCGGCG	2	12	3817000	3817011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_013521	GCGTCG	2	12	3824012	3824023	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_013521	GCCGAC	2	12	3830860	3830871	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
147	NC_013521	GGTGAC	2	12	3831151	3831162	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_013521	GGTGCG	2	12	3861105	3861116	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_013521	GACGGC	2	12	3862024	3862035	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_013521	GCCGAA	2	12	3862356	3862367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_013521	GGTCGG	2	12	3862446	3862457	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_013521	TGGTGC	4	24	3926928	3926951	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_013521	TCGTGC	2	12	3948801	3948812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_013521	TCCCCC	2	12	3949644	3949655	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
155	NC_013521	GGTGCG	2	12	4011422	4011433	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_013521	CCCGCA	3	18	4028159	4028176	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_013521	GCGCCT	2	12	4028225	4028236	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
158	NC_013521	GCCTGC	5	30	4028239	4028268	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
159	NC_013521	GGCGCG	2	12	4028817	4028828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_013521	GGTCTG	2	12	4029278	4029289	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
161	NC_013521	GGTGCT	2	12	4061392	4061403	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
162	NC_013521	GCTGGT	2	12	4061406	4061417	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_013521	GGGGGC	2	12	4081675	4081686	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
164	NC_013521	TGCCCG	2	12	4085653	4085664	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
165	NC_013521	CGCGAG	2	12	4101894	4101905	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_013521	ATCGTC	2	12	4123735	4123746	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_013521	TGCACT	2	12	4144556	4144567	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_013521	CAGGCG	2	12	4149537	4149548	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_013521	GGCGCA	2	12	4160605	4160616	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_013521	CGTCTG	2	12	4181582	4181593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_013521	GGGTGG	2	12	4221697	4221708	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.