MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Sebaldella termitidis ATCC 33386 plasmid pSTERM01

Total Repeats: 144

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013518	ATT	2	6	56	61	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013518	GTT	2	6	67	72	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013518	AGT	2	6	260	265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013518	TTC	2	6	311	316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013518	ATA	2	6	371	376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013518	TCA	2	6	384	389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013518	ATA	2	6	454	459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013518	TCC	2	6	1120	1125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_013518	ATT	2	6	1126	1131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013518	ATT	2	6	1142	1147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013518	TAT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013518	TAT	2	6	1304	1309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013518	AAG	2	6	1366	1371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013518	TCC	2	6	2779	2784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_013518	TAT	2	6	2897	2902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013518	TAT	3	9	2990	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013518	AAT	2	6	3049	3054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013518	AAC	2	6	3162	3167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013518	TCA	2	6	5275	5280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013518	ATA	2	6	5288	5293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013518	TCC	2	6	5394	5399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_013518	TAA	2	6	5555	5560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013518	AAT	2	6	5599	5604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013518	TAA	2	6	5675	5680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013518	ACC	2	6	6528	6533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_013518	TCC	2	6	8232	8237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_013518	TAA	2	6	8287	8292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013518	ACC	2	6	8354	8359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_013518	TCT	2	6	8367	8372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013518	CTG	2	6	8531	8536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013518	AAT	2	6	9777	9782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013518	TTG	2	6	9815	9820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013518	TTA	2	6	9883	9888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013518	TAT	2	6	10456	10461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013518	TAT	3	9	10472	10480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013518	ATA	3	9	10484	10492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013518	ATT	2	6	10651	10656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013518	TTC	2	6	11073	11078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013518	TGG	2	6	11332	11337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013518	AAT	2	6	11366	11371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013518	TCC	2	6	11696	11701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_013518	TAA	2	6	12688	12693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013518	AAT	2	6	16250	16255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013518	TAT	2	6	16272	16277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013518	ATA	2	6	16381	16386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013518	ATT	2	6	16449	16454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013518	TAG	2	6	16459	16464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013518	TAA	2	6	16513	16518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013518	ATT	2	6	16603	16608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013518	TCC	2	6	17170	17175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_013518	ATT	2	6	17180	17185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013518	TAT	2	6	17231	17236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013518	AGT	2	6	17246	17251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013518	AGA	2	6	17939	17944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013518	TCT	2	6	18002	18007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013518	ATA	2	6	18009	18014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013518	TAT	2	6	18021	18026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013518	GAA	2	6	18743	18748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013518	AGG	2	6	18899	18904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013518	ATA	2	6	19252	19257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013518	TTG	2	6	19335	19340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013518	TAT	2	6	19531	19536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013518	TGC	2	6	19551	19556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013518	AAG	2	6	19597	19602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013518	GTT	2	6	19664	19669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013518	AAT	2	6	19788	19793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013518	ATA	2	6	19856	19861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013518	TCT	2	6	19887	19892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013518	TCC	2	6	20008	20013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_013518	AGA	2	6	20025	20030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013518	CTT	2	6	20091	20096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013518	TCC	2	6	20131	20136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_013518	TAT	2	6	20154	20159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013518	CAA	2	6	20171	20176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013518	CGT	2	6	20252	20257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013518	CCG	2	6	20282	20287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_013518	TGT	2	6	20337	20342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013518	ATG	2	6	20345	20350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013518	TTA	2	6	20979	20984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013518	TAA	2	6	23586	23591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013518	CTT	2	6	23669	23674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013518	TAA	2	6	23753	23758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013518	ATA	2	6	23759	23764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013518	ATT	2	6	23786	23791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013518	GGT	2	6	24209	24214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013518	CTT	2	6	26080	26085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013518	TAA	2	6	28249	28254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013518	TAA	2	6	28277	28282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013518	TAT	2	6	28351	28356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013518	TCC	2	6	28602	28607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_013518	CCT	2	6	29510	29515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_013518	TAC	2	6	29595	29600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013518	TCC	2	6	29621	29626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_013518	TAA	2	6	29667	29672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013518	TTC	2	6	29836	29841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013518	TTA	2	6	30430	30435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013518	AAT	2	6	30458	30463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013518	TGT	2	6	30666	30671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013518	CAT	2	6	30810	30815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013518	TTA	2	6	30835	30840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013518	ATT	2	6	30877	30882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013518	TTA	2	6	31473	31478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013518	ATA	2	6	31570	31575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013518	AAT	2	6	31809	31814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013518	ATA	2	6	31854	31859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013518	ATA	2	6	31872	31877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013518	GAT	2	6	31922	31927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013518	ATT	2	6	31928	31933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013518	ACA	2	6	31948	31953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013518	ATA	2	6	31969	31974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013518	ATT	3	9	32067	32075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013518	ATT	2	6	32117	32122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013518	TTA	2	6	32139	32144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013518	AAT	2	6	32147	32152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013518	TCC	2	6	39821	39826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_013518	TAT	2	6	39835	39840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013518	TTG	2	6	41717	41722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013518	TAA	2	6	41849	41854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013518	TTA	2	6	41906	41911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013518	CTC	2	6	42598	42603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_013518	AAC	2	6	42869	42874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013518	ATG	2	6	42902	42907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013518	CAT	2	6	43292	43297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_013518	TAA	2	6	43377	43382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013518	ATC	2	6	43732	43737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013518	TTG	2	6	43896	43901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013518	TAT	2	6	43933	43938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013518	TAC	2	6	43987	43992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013518	TAA	2	6	43996	44001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013518	AAG	2	6	44049	44054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013518	TAA	2	6	44109	44114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013518	ATT	2	6	44314	44319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013518	GTT	2	6	44420	44425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013518	TCC	2	6	45050	45055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_013518	GTA	2	6	45124	45129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013518	TCT	2	6	45274	45279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_013518	CTA	2	6	45295	45300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_013518	TTC	2	6	45314	45319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_013518	TCC	2	6	53269	53274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_013518	CCT	2	6	53784	53789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_013518	TAA	2	6	53801	53806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013518	TTA	2	6	53915	53920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013518	ACG	2	6	53987	53992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_013518	TAT	2	6	54144	54149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.