MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptobacillus moniliformis DSM 12112 chromosome

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013515	AATTAA	2	12	8141	8152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013515	TATTTT	2	12	12113	12124	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013515	TAATTT	2	12	18957	18968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013515	TATAAA	2	12	64079	64090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013515	TTTTAT	2	12	64713	64724	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013515	TAAAAA	2	12	94779	94790	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013515	TCTATT	2	12	148406	148417	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013515	TTACTT	2	12	150033	150044	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_013515	TTGAAG	2	12	186686	186697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013515	ACCAAG	2	12	187113	187124	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013515	TATTTT	2	12	191453	191464	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013515	AAATAA	2	12	198728	198739	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013515	GAAAAT	2	12	205627	205638	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013515	CTATGT	2	12	212090	212101	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_013515	GTCTAT	2	12	215292	215303	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_013515	TTTTAA	2	12	225616	225627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013515	CTATGT	2	12	276348	276359	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_013515	AGTTAG	2	12	312359	312370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013515	TTAATA	2	12	405570	405581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013515	TTTTAT	2	12	444671	444682	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013515	ATAAAA	2	12	451783	451794	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013515	TATTTT	2	12	469126	469137	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013515	TAATGT	2	12	496719	496730	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013515	TATATG	2	12	499425	499436	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013515	ATTTTA	2	12	499471	499482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013515	ATAAAA	2	12	537919	537930	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013515	GAATTA	2	12	538321	538332	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013515	ATTATG	2	12	538532	538543	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013515	GCAAAG	2	12	538803	538814	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_013515	TAAAAA	2	12	551836	551847	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013515	TTTTAA	2	12	627027	627038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013515	AATTTT	2	12	638313	638324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013515	ATCATA	2	12	638685	638696	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_013515	AGAAAA	2	12	644191	644202	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013515	GATTTA	2	12	645425	645436	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013515	AAAGAT	2	12	645855	645866	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013515	AAAATA	2	12	646088	646099	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013515	AATTTA	2	12	646300	646311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013515	AATGAA	2	12	688159	688170	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013515	TTTGTG	2	12	697470	697481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013515	ATCCGA	2	12	728360	728371	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013515	AAAGAA	2	12	732551	732562	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013515	ATCTTT	2	12	733713	733724	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_013515	AGAAAG	2	12	738454	738465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013515	CAAAAC	2	12	772334	772345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013515	AAAATA	2	12	773873	773884	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013515	TTTAAT	2	12	775751	775762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013515	TTATAT	2	12	866168	866179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013515	AAATAA	2	12	877510	877521	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013515	CCTAAA	2	12	885728	885739	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013515	TAACTC	2	12	897449	897460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013515	ATTAAT	2	12	927569	927580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013515	TTTAAA	2	12	956846	956857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013515	TTTAAA	2	12	988142	988153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013515	ATTTTT	2	12	990546	990557	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013515	ATATTT	2	12	993121	993132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013515	ATATTA	2	12	993146	993157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013515	ATTTAA	2	12	1024028	1024039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013515	AATAAA	2	12	1095904	1095915	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013515	AAAATC	2	12	1129063	1129074	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_013515	TTTTAA	2	12	1143677	1143688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013515	TTTTTA	2	12	1147825	1147836	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013515	CTTTCA	2	12	1155492	1155503	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013515	CTTTTC	2	12	1156263	1156274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013515	ATTATC	2	12	1156349	1156360	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013515	AATATC	2	12	1171172	1171183	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_013515	ATTTAA	2	12	1172291	1172302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013515	TATCTT	2	12	1172605	1172616	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_013515	TCTCCA	2	12	1173471	1173482	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_013515	TTTTAA	2	12	1184942	1184953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013515	TATTTT	2	12	1213259	1213270	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013515	TTTAAA	2	12	1225687	1225698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013515	ATATTT	2	12	1245185	1245196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013515	CTATTT	2	12	1260481	1260492	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_013515	ACCAGC	2	12	1261345	1261356	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013515	ATTATA	2	12	1262074	1262085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013515	TTCATT	2	12	1262107	1262118	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_013515	ATTAGT	2	12	1262167	1262178	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013515	AATCAT	2	12	1263927	1263938	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_013515	TTTAAA	2	12	1277557	1277568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013515	CTTATA	2	12	1277625	1277636	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_013515	TAAATT	2	12	1277811	1277822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013515	TATTTA	2	12	1293596	1293607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013515	TAAAAA	2	12	1301922	1301933	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013515	TATTTT	2	12	1310235	1310246	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013515	AAAAAT	2	12	1312769	1312780	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013515	GCTTTC	2	12	1317320	1317331	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013515	GTTTTA	2	12	1330400	1330411	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013515	TAATTT	2	12	1335380	1335391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013515	TATCAA	2	12	1335417	1335428	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_013515	AAAATT	2	12	1338523	1338534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013515	TCCATA	2	12	1423497	1423508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013515	AACTAA	2	12	1424132	1424143	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_013515	TAAAAA	2	12	1424498	1424509	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013515	TTTTTA	2	12	1437895	1437906	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013515	AGTTAG	2	12	1439437	1439448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013515	TTAATT	2	12	1461931	1461942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013515	TTCTCT	2	12	1462008	1462019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013515	AAAATT	2	12	1464778	1464789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013515	CTTTCT	2	12	1466544	1466555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013515	ATTAAA	2	12	1468509	1468520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013515	TTAAAT	2	12	1468791	1468802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013515	TTTAAA	2	12	1472414	1472425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013515	AGTATA	2	12	1475503	1475514	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013515	TAAAAA	2	12	1495752	1495763	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013515	AAGTAA	2	12	1506376	1506387	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013515	CATATT	2	12	1537126	1537137	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_013515	ACTTAA	2	12	1555587	1555598	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_013515	GTCCCA	2	12	1556572	1556583	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013515	TAAATT	2	12	1570083	1570094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013515	TATTTT	2	12	1633371	1633382	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013515	AGTATA	2	12	1643975	1643986	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013515	TAATTT	2	12	1644100	1644111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013515	TATACA	2	12	1651054	1651065	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_013515	TTAAAA	2	12	1651232	1651243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.