MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946 chromosome

Total Repeats: 158

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013512	TAAAA	2	10	1216	1225	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013512	AACCT	2	10	2706	2715	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_013512	AATAA	2	10	35199	35208	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013512	GCTTT	2	10	35268	35277	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013512	CTTTT	2	10	39017	39026	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_013512	TAAAA	2	10	101758	101767	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013512	ATTAA	2	10	112383	112392	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013512	TTATT	2	10	126837	126846	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013512	ATTTT	2	10	153272	153281	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013512	CTATG	2	10	159666	159675	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_013512	TTAAT	2	10	210849	210858	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013512	ATTCT	2	10	215461	215470	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_013512	CAGGG	2	10	270205	270214	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_013512	AAAGC	2	10	301281	301290	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_013512	CCTTT	2	10	309610	309619	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_013512	TAAAG	2	10	310439	310448	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013512	CTTTC	2	10	325279	325288	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_013512	AAAAC	2	10	325468	325477	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013512	TAAAA	2	10	328966	328975	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013512	CTTAA	2	10	338834	338843	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_013512	TAATT	2	10	345048	345057	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013512	AGAAA	2	10	439959	439968	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013512	ATCTT	2	10	444264	444273	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_013512	CTTTA	2	10	456238	456247	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_013512	AACAA	2	10	467489	467498	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_013512	AATTT	2	10	504755	504764	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013512	TTAAT	2	10	527305	527314	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013512	AAAGC	2	10	534159	534168	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_013512	TTAAA	2	10	534343	534352	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013512	AAAGC	2	10	541012	541021	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_013512	AAAGC	2	10	541150	541159	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_013512	TAAAT	2	10	612759	612768	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013512	TATAA	2	10	612792	612801	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013512	TTTCA	2	10	613572	613581	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_013512	TATCT	2	10	624122	624131	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_013512	CTTTA	2	10	651255	651264	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_013512	AATGA	2	10	675668	675677	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013512	GGTTG	2	10	715774	715783	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013512	AGAGC	2	10	717500	717509	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_013512	TTGAG	2	10	721353	721362	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013512	AAATT	2	10	722458	722467	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013512	AATTA	2	10	722473	722482	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013512	TTGCA	2	10	732000	732009	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_013512	CTTTT	2	10	732132	732141	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_013512	TGAAA	2	10	763525	763534	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013512	CAGAG	2	10	778389	778398	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_013512	TTTAT	2	10	781711	781720	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013512	TCGTT	2	10	784604	784613	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_013512	GCTTT	2	10	801438	801447	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_013512	AAAGC	2	10	825395	825404	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_013512	AAAGC	2	10	841230	841239	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_013512	TTTTA	2	10	858297	858306	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013512	TATAA	2	10	892768	892777	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013512	TGAAA	2	10	900859	900868	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013512	CAGAC	2	10	903824	903833	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_013512	CAGAC	2	10	904151	904160	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_013512	AAAAT	2	10	907236	907245	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013512	TTCTC	2	10	907438	907447	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_013512	TATAA	2	10	932587	932596	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013512	ATTTC	2	10	939352	939361	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_013512	TAATT	2	10	963589	963598	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013512	TCAGA	2	10	965116	965125	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_013512	TCCAC	2	10	979998	980007	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
64	NC_013512	TTTAT	2	10	990448	990457	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013512	TCTCC	2	10	1012662	1012671	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
66	NC_013512	TTGTT	2	10	1015669	1015678	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013512	TTGTT	2	10	1018266	1018275	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013512	TTGAT	2	10	1024886	1024895	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013512	CACTT	2	10	1026080	1026089	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_013512	TTTAA	2	10	1026157	1026166	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013512	AAGCG	2	10	1027233	1027242	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_013512	CTTAA	2	10	1029063	1029072	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_013512	AGCAA	2	10	1033152	1033161	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_013512	TATTT	2	10	1033172	1033181	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013512	GCTTT	2	10	1082919	1082928	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_013512	CATTA	2	10	1092401	1092410	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_013512	AAACA	2	10	1092459	1092468	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_013512	TTTTA	2	10	1095818	1095827	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013512	TACAC	2	10	1106148	1106157	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_013512	GTGCT	2	10	1129204	1129213	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_013512	AAAGC	2	10	1146784	1146793	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_013512	CTTTT	2	10	1159263	1159272	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_013512	AAACA	2	10	1160329	1160338	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_013512	ACAAA	2	10	1165597	1165606	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_013512	CATTT	2	10	1168105	1168114	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_013512	CATTT	2	10	1170195	1170204	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_013512	TACAT	3	15	1183058	1183072	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_013512	CTCTT	2	10	1187771	1187780	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_013512	GTAAA	2	10	1191647	1191656	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013512	GTATT	2	10	1221029	1221038	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013512	TAAAA	2	10	1230844	1230853	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013512	ATTTT	2	10	1245152	1245161	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013512	CAAAA	2	10	1254955	1254964	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_013512	ATTTT	2	10	1281607	1281616	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013512	AAAGC	2	10	1319024	1319033	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_013512	AATTG	2	10	1332880	1332889	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013512	ATCTC	2	10	1405264	1405273	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_013512	TCTTT	2	10	1409539	1409548	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_013512	TAAGG	2	10	1423987	1423996	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013512	GATAC	2	10	1437581	1437590	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_013512	AAAGC	2	10	1441406	1441415	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_013512	TTTTA	2	10	1458657	1458666	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013512	AAATG	2	10	1465926	1465935	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013512	TCATT	2	10	1465954	1465963	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_013512	AAAGC	2	10	1475460	1475469	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_013512	ATTCT	2	10	1481548	1481557	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_013512	ATATC	2	10	1513739	1513748	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_013512	TTTTA	2	10	1517279	1517288	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013512	TTAAA	2	10	1522150	1522159	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013512	CATAA	2	10	1540704	1540713	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_013512	GTTAT	2	10	1541420	1541429	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013512	AAAGC	2	10	1554453	1554462	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_013512	AAATT	2	10	1614552	1614561	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013512	GCTAC	2	10	1641949	1641958	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_013512	ATAAA	2	10	1643439	1643448	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013512	ACAAA	2	10	1658628	1658637	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_013512	CTATT	2	10	1682001	1682010	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_013512	TTTTC	2	10	1684080	1684089	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_013512	AGCTT	2	10	1691402	1691411	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_013512	CTTCG	2	10	1693804	1693813	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_013512	CACGA	2	10	1695509	1695518	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_013512	AGCTT	2	10	1697556	1697565	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_013512	CTTCG	2	10	1699958	1699967	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_013512	CACGA	2	10	1701663	1701672	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_013512	GTATA	2	10	1731529	1731538	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013512	CTAAA	2	10	1741475	1741484	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_013512	GGTCA	2	10	1771817	1771826	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_013512	AAAGC	2	10	1834755	1834764	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_013512	CAAAA	2	10	1856692	1856701	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_013512	TTCTA	2	10	1871503	1871512	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_013512	CCATA	2	10	1894472	1894481	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_013512	AAGTT	2	10	1937835	1937844	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013512	ATTAA	2	10	1960891	1960900	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013512	TTATT	2	10	1986501	1986510	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013512	TATTT	2	10	2010177	2010186	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013512	AAATA	2	10	2060279	2060288	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013512	ATTTT	2	10	2064790	2064799	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013512	TTTAT	2	10	2072378	2072387	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013512	AAAGC	2	10	2085145	2085154	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_013512	TTATA	2	10	2088093	2088102	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013512	TAAAA	2	10	2094869	2094878	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013512	TTTAC	2	10	2097951	2097960	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_013512	TGAAA	2	10	2097976	2097985	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013512	AGATT	2	10	2102974	2102983	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013512	TATTG	2	10	2116941	2116950	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013512	GTTTT	2	10	2132625	2132634	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013512	ACGAT	2	10	2149496	2149505	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_013512	AAAGC	2	10	2157038	2157047	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_013512	CAAAA	2	10	2172937	2172946	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_013512	AATAC	2	10	2174811	2174820	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_013512	GCTTT	2	10	2184725	2184734	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
152	NC_013512	CATAA	2	10	2207908	2207917	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_013512	AAAAT	2	10	2240873	2240882	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013512	TATCA	2	10	2276126	2276135	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
155	NC_013512	AGCTT	2	10	2276529	2276538	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
156	NC_013512	CTTCG	2	10	2278931	2278940	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
157	NC_013512	CACGA	2	10	2280636	2280645	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
158	NC_013512	TAACA	2	10	2303698	2303707	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.