MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946 chromosome

Total Repeats: 3835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013512	GA	3	6	2120518	2120523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_013512	A	6	6	2132219	2132224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_013512	AAGA	2	8	2132251	2132258	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_013512	TAA	2	6	2132361	2132366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_013512	T	7	7	2132391	2132397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_013512	TAAT	2	8	2132447	2132454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_013512	CTA	2	6	2132457	2132462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_013512	A	6	6	2132490	2132495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_013512	GTTTT	2	10	2132625	2132634	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_013512	TAA	2	6	2132645	2132650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_013512	A	6	6	2136110	2136115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_013512	T	6	6	2136119	2136124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_013512	ATA	2	6	2136126	2136131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_013512	AT	3	6	2136214	2136219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_013512	A	6	6	2136269	2136274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_013512	ATG	2	6	2136318	2136323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_013512	T	6	6	2137367	2137372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_013512	A	7	7	2137383	2137389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_013512	GAA	2	6	2139343	2139348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_013512	TCC	2	6	2140332	2140337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3521	NC_013512	TTTG	2	8	2140338	2140345	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_013512	ATA	2	6	2141413	2141418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_013512	TAT	2	6	2141439	2141444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_013512	A	6	6	2143288	2143293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_013512	CCT	2	6	2145892	2145897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3526	NC_013512	TTA	2	6	2145923	2145928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_013512	AGG	2	6	2145930	2145935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_013512	AGA	2	6	2145965	2145970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_013512	AGA	2	6	2145973	2145978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_013512	A	6	6	2145978	2145983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_013512	A	8	8	2149466	2149473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_013512	ATT	2	6	2149483	2149488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_013512	ACGAT	2	10	2149496	2149505	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3534	NC_013512	TTG	2	6	2149522	2149527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_013512	GAA	2	6	2149531	2149536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_013512	CTT	2	6	2151693	2151698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_013512	AGG	2	6	2151705	2151710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_013512	ATA	2	6	2151742	2151747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_013512	T	6	6	2152989	2152994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_013512	A	6	6	2153014	2153019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_013512	CTT	2	6	2153099	2153104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_013512	TAA	2	6	2153105	2153110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_013512	A	6	6	2153135	2153140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_013512	TAT	2	6	2153144	2153149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_013512	TTA	2	6	2153159	2153164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_013512	TA	3	6	2153778	2153783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_013512	T	6	6	2153801	2153806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_013512	GTTT	2	8	2155110	2155117	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_013512	AAG	2	6	2155142	2155147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_013512	AAAGC	2	10	2157038	2157047	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3551	NC_013512	T	7	7	2157107	2157113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_013512	TAA	2	6	2157614	2157619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_013512	A	7	7	2157647	2157653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_013512	GAA	2	6	2160157	2160162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_013512	TCT	2	6	2162411	2162416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_013512	CT	3	6	2162415	2162420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3557	NC_013512	TAAT	2	8	2162449	2162456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_013512	A	8	8	2162483	2162490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_013512	GAC	2	6	2164406	2164411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_013512	T	6	6	2164464	2164469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_013512	T	7	7	2172395	2172401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_013512	A	6	6	2172492	2172497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_013512	TAA	2	6	2172500	2172505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_013512	TTA	3	9	2172508	2172516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_013512	TCAC	2	8	2172584	2172591	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3566	NC_013512	T	6	6	2172599	2172604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_013512	CAC	2	6	2172689	2172694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3568	NC_013512	ACC	2	6	2172783	2172788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3569	NC_013512	AGCTTC	2	12	2172800	2172811	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_013512	CAAAA	2	10	2172937	2172946	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3571	NC_013512	A	6	6	2172943	2172948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_013512	TTC	2	6	2172963	2172968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_013512	TTTTTC	2	12	2173001	2173012	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3574	NC_013512	AT	3	6	2173020	2173025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_013512	TCT	2	6	2173491	2173496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_013512	CCT	2	6	2173504	2173509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3577	NC_013512	T	6	6	2173509	2173514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_013512	AATAC	2	10	2174811	2174820	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3579	NC_013512	ATAA	2	8	2174823	2174830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_013512	TAT	2	6	2174881	2174886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_013512	TAA	2	6	2174894	2174899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_013512	CTA	2	6	2174921	2174926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_013512	A	6	6	2174926	2174931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_013512	CTG	2	6	2174946	2174951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_013512	CTT	2	6	2174955	2174960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_013512	AT	3	6	2175041	2175046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_013512	ATG	2	6	2175091	2175096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_013512	T	6	6	2177437	2177442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_013512	CAT	2	6	2177478	2177483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_013512	A	6	6	2182334	2182339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_013512	A	6	6	2182352	2182357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_013512	TTC	2	6	2184370	2184375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_013512	AGT	2	6	2184401	2184406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_013512	A	6	6	2184476	2184481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_013512	GCTTT	2	10	2184725	2184734	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3596	NC_013512	AT	3	6	2189828	2189833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_013512	T	6	6	2192225	2192230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_013512	CTT	2	6	2193177	2193182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_013512	A	6	6	2193204	2193209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_013512	TC	3	6	2195279	2195284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3601	NC_013512	TAT	2	6	2197868	2197873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_013512	CTTAAG	2	12	2197885	2197896	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3603	NC_013512	T	7	7	2197970	2197976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_013512	CTT	2	6	2197979	2197984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_013512	GAAA	2	8	2205062	2205069	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_013512	A	7	7	2205076	2205082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_013512	ATTT	2	8	2205093	2205100	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_013512	A	7	7	2205106	2205112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_013512	CTT	2	6	2205128	2205133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_013512	ATT	2	6	2205136	2205141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_013512	TA	3	6	2205155	2205160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_013512	TAA	2	6	2207887	2207892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_013512	T	6	6	2207900	2207905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_013512	CATAA	2	10	2207908	2207917	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3615	NC_013512	GT	3	6	2207919	2207924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_013512	A	6	6	2212396	2212401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_013512	AGA	3	9	2212407	2212415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_013512	CCTT	2	8	2213151	2213158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3619	NC_013512	TAT	2	6	2213170	2213175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_013512	ACT	2	6	2213176	2213181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_013512	CAT	2	6	2213251	2213256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_013512	ACA	2	6	2231014	2231019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_013512	A	7	7	2236223	2236229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_013512	AG	3	6	2236258	2236263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_013512	TGA	2	6	2237763	2237768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_013512	A	9	9	2237787	2237795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_013512	T	10	10	2237815	2237824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_013512	A	6	6	2237837	2237842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_013512	AAAAT	2	10	2240873	2240882	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_013512	TAA	2	6	2240889	2240894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_013512	AAG	2	6	2242232	2242237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_013512	CTT	2	6	2242240	2242245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3633	NC_013512	CTT	2	6	2242256	2242261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3635	NC_013512	CTT	2	6	2245594	2245599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3769	NC_013512	ATG	2	6	2280511	2280516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3771	NC_013512	TCC	3	9	2280537	2280545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3779	NC_013512	ACC	2	6	2281035	2281040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3780	NC_013512	GCT	2	6	2281194	2281199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3782	NC_013512	TCC	2	6	2281283	2281288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3785	NC_013512	CTG	2	6	2281337	2281342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3798	NC_013512	CT	3	6	2282061	2282066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3799	NC_013512	ATA	2	6	2282073	2282078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3800	NC_013512	AAC	2	6	2282149	2282154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3802	NC_013512	A	6	6	2282940	2282945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3803	NC_013512	CAA	2	6	2282960	2282965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3809	NC_013512	CTT	2	6	2290517	2290522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3822	NC_013512	TC	3	6	2291538	2291543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3823	NC_013512	T	6	6	2291544	2291549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3824	NC_013512	A	8	8	2291574	2291581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3825	NC_013512	CTG	2	6	2291586	2291591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3827	NC_013512	ATT	2	6	2291640	2291645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3832	NC_013512	GAAT	2	8	2299679	2299686	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3833	NC_013512	AAG	2	6	2299728	2299733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.