MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ED98 plasmid pAVX

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013453	TCA	2	6	102	107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013453	TCT	2	6	501	506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013453	AAT	2	6	526	531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013453	ATT	2	6	610	615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013453	ATA	2	6	619	624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013453	CAA	2	6	630	635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013453	ATT	2	6	646	651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013453	AGT	2	6	709	714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013453	AAG	2	6	756	761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013453	TCT	2	6	855	860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013453	GAT	3	9	879	887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013453	ATT	2	6	888	893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013453	AAT	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013453	ATA	2	6	1151	1156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013453	TAG	2	6	1240	1245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013453	TAT	2	6	1255	1260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013453	ACT	2	6	1269	1274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013453	ACT	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013453	CCT	2	6	2938	2943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_013453	AGT	2	6	3011	3016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013453	TCT	2	6	3065	3070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013453	AAT	2	6	3099	3104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013453	GAA	2	6	3133	3138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013453	AAT	2	6	3287	3292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013453	ATT	2	6	4398	4403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013453	ACA	2	6	4525	4530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013453	GAA	2	6	4556	4561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013453	TAT	2	6	4592	4597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013453	ATC	2	6	4778	4783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013453	AAT	2	6	5406	5411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013453	AAT	2	6	5469	5474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013453	CTA	2	6	5543	5548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013453	TTA	2	6	5748	5753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013453	TAG	2	6	5770	5775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013453	GTT	2	6	5804	5809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013453	TAT	2	6	5813	5818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013453	GAA	2	6	5821	5826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013453	ATC	2	6	5853	5858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013453	TAA	2	6	5866	5871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013453	ATT	3	9	6050	6058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013453	TTA	2	6	6068	6073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013453	ATT	2	6	7688	7693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013453	ATT	2	6	7719	7724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013453	TTA	2	6	7790	7795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013453	AAT	2	6	7808	7813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013453	TAT	2	6	7924	7929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013453	TAT	2	6	7960	7965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013453	TTA	2	6	8003	8008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013453	TGA	2	6	8082	8087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013453	ATT	2	6	8100	8105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013453	GCT	2	6	8667	8672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013453	TTA	2	6	8699	8704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013453	AAT	2	6	8753	8758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013453	ACA	2	6	9891	9896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013453	TAT	2	6	9920	9925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013453	TAT	3	9	12012	12020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013453	TAT	2	6	12036	12041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013453	ATC	2	6	12073	12078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013453	AGA	2	6	12815	12820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013453	TAT	2	6	12888	12893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013453	GAA	2	6	12977	12982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013453	ATA	2	6	13173	13178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013453	TAT	2	6	13250	13255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013453	ATA	2	6	13366	13371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013453	CTG	2	6	13382	13387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013453	AAG	2	6	14151	14156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013453	AAG	2	6	14159	14164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013453	TAA	2	6	14177	14182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013453	CAA	2	6	14237	14242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013453	CTT	2	6	15133	15138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013453	CAA	2	6	15233	15238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013453	TCA	2	6	15239	15244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013453	AGT	2	6	15285	15290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013453	ATT	2	6	15361	15366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013453	AAT	2	6	15394	15399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013453	AGA	2	6	16320	16325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013453	ATT	2	6	16337	16342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013453	AAT	2	6	17168	17173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013453	GCA	2	6	17185	17190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013453	TTG	2	6	17251	17256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.