MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 214

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013159	AGCGGG	2	12	15278	15289	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_013159	GTGTTC	2	12	16973	16984	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013159	ACGCGC	2	12	21564	21575	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013159	GTGAGC	2	12	22930	22941	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_013159	GCCGGT	2	12	53153	53164	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013159	GGGGGA	2	12	53166	53177	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013159	CTGGTG	2	12	158019	158030	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013159	AGCCGA	2	12	159806	159817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013159	GCGTCG	2	12	210594	210605	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013159	CGAAGC	2	12	218334	218345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013159	TCAAGA	2	12	218846	218857	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_013159	TCGCGG	2	12	244603	244614	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013159	TTTCGG	2	12	272158	272169	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013159	CGGACT	2	12	304401	304412	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013159	GCGGAT	2	12	386509	386520	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_013159	AACTAC	2	12	393115	393126	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013159	GAACGC	2	12	396638	396649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013159	GGGCCG	2	12	411922	411933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013159	TTCACG	2	12	431510	431521	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013159	GGTTCG	2	12	439825	439836	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_013159	ACGTGG	2	12	449943	449954	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_013159	GGAGCC	2	12	482029	482040	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013159	GCCCCG	2	12	485623	485634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_013159	TGACCG	2	12	506491	506502	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013159	GCGTGC	2	12	553545	553556	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013159	GCGGCC	2	12	563811	563822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013159	GTCCGG	2	12	641692	641703	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013159	CGGCCG	2	12	641870	641881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013159	GTGCCG	2	12	652079	652090	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013159	ACCGGC	2	12	678345	678356	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013159	TCGGCG	2	12	688159	688170	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013159	CCCGGC	2	12	700433	700444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_013159	GTCGCC	2	12	709875	709886	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013159	CTTTTA	2	12	722822	722833	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_013159	GTGACG	2	12	730278	730289	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_013159	GCGGCC	2	12	742251	742262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013159	CGTTGT	2	12	812127	812138	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013159	GCGAGT	2	12	814934	814945	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013159	TCGCCC	2	12	908742	908753	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_013159	CGCTGT	2	12	954237	954248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013159	AGGACG	2	12	1006927	1006938	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_013159	TTCCCG	2	12	1028356	1028367	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013159	GCCGTC	2	12	1046250	1046261	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013159	ACCTGC	2	12	1061925	1061936	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013159	ACGTCG	2	12	1063166	1063177	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013159	CGCGGT	2	12	1088804	1088815	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013159	CGAGGG	2	12	1111064	1111075	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_013159	ATGCCG	2	12	1235621	1235632	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013159	ACGTCG	2	12	1235733	1235744	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013159	ATCCCG	2	12	1280225	1280236	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013159	GCCCCC	2	12	1281888	1281899	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
52	NC_013159	GCTGAG	2	12	1286087	1286098	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_013159	ATCCCG	2	12	1287815	1287826	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013159	GTGGAC	2	12	1314320	1314331	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_013159	TGCCGC	2	12	1317256	1317267	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013159	CGGGTG	2	12	1338928	1338939	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_013159	CGGGTG	2	12	1338995	1339006	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_013159	CGGGTG	2	12	1339062	1339073	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_013159	CGGGTG	2	12	1339129	1339140	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_013159	CGGGTG	2	12	1339196	1339207	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_013159	GATGGC	2	12	1395559	1395570	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013159	GCCGTC	2	12	1405363	1405374	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013159	CCCGGA	2	12	1422233	1422244	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_013159	GCTGAT	2	12	1426851	1426862	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_013159	GGCAAC	2	12	1427378	1427389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013159	GTGAAT	2	12	1435610	1435621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013159	CGGACG	2	12	1441146	1441157	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013159	GTGCCG	2	12	1492470	1492481	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013159	AGTGAC	2	12	1493943	1493954	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_013159	TGAAGC	2	12	1503453	1503464	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_013159	TGCGAA	2	12	1513842	1513853	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_013159	CGTGTC	2	12	1562286	1562297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013159	TGTCCG	2	12	1562300	1562311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013159	TGCCCA	2	12	1562312	1562323	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013159	AGCACC	2	12	1574395	1574406	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013159	CGCCAC	3	18	1574629	1574646	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_013159	ACGTCG	2	12	1710842	1710853	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013159	CCCGTT	2	12	1748454	1748465	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013159	CGCGGT	2	12	1796282	1796293	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013159	AGGTGG	2	12	1801601	1801612	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013159	GCCTCG	2	12	1806634	1806645	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013159	ACCGCG	2	12	1809942	1809953	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_013159	ACCACG	2	12	1810219	1810230	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013159	CGTGGC	2	12	1846376	1846387	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013159	TCGGAT	2	12	1877292	1877303	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_013159	TGGGGT	2	12	1893311	1893322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013159	CAAGAT	2	12	1906525	1906536	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_013159	CGGTGC	2	12	1970717	1970728	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013159	CGGATG	2	12	1985623	1985634	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_013159	CGAGCA	2	12	2010928	2010939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013159	ATGAAA	2	12	2011114	2011125	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013159	TGCCAC	2	12	2044540	2044551	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013159	TGGCGG	2	12	2046886	2046897	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_013159	CACTTT	2	12	2047184	2047195	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013159	CACCGA	2	12	2056590	2056601	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013159	ACGTCG	2	12	2056636	2056647	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013159	GACGTC	2	12	2058071	2058082	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013159	TGGGGA	2	12	2061098	2061109	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013159	CCCGGC	2	12	2063130	2063141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_013159	GACCCG	2	12	2067949	2067960	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013159	CTCACG	2	12	2070953	2070964	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013159	CACCCG	2	12	2080507	2080518	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_013159	GGAGAA	2	12	2083663	2083674	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013159	ACCGGC	2	12	2102653	2102664	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_013159	GTTTTC	2	12	2104894	2104905	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_013159	AGTGAG	2	12	2130967	2130978	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013159	GTCCGT	2	12	2181919	2181930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013159	GAGTTC	3	18	2196432	2196449	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_013159	CACCGC	2	12	2209381	2209392	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_013159	GCCGGA	2	12	2249798	2249809	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013159	GCCGGT	2	12	2255117	2255128	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013159	TCGGTG	2	12	2256555	2256566	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_013159	CCGCGG	2	12	2296255	2296266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_013159	GGCCGA	2	12	2309978	2309989	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013159	GCCACC	2	12	2320805	2320816	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_013159	CCCCGA	2	12	2327134	2327145	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_013159	ACGGCC	2	12	2409340	2409351	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
118	NC_013159	GCGACG	2	12	2436465	2436476	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013159	ACCCTC	2	12	2500324	2500335	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_013159	CCGGCG	2	12	2516631	2516642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013159	CGACGG	2	12	2517607	2517618	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013159	GGCCAA	2	12	2554461	2554472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013159	GTCGGG	2	12	2559805	2559816	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_013159	GCACGG	2	12	2559949	2559960	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013159	GAGGTG	2	12	2601218	2601229	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013159	CACCCG	2	12	2607022	2607033	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_013159	CCGGGG	2	12	2610572	2610583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013159	GCCGTC	2	12	2622279	2622290	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
129	NC_013159	GCGGGG	2	12	2625285	2625296	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_013159	CCGTCC	2	12	2652733	2652744	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_013159	CACTGT	2	12	2656865	2656876	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013159	CGGCAC	2	12	2664246	2664257	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
133	NC_013159	TTCCCG	2	12	2676622	2676633	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
134	NC_013159	AGCGTT	2	12	2711788	2711799	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_013159	ACAGCC	2	12	2760997	2761008	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
136	NC_013159	CGGCGT	2	12	2761332	2761343	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_013159	CCCTAA	2	12	2769060	2769071	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_013159	GCCCTC	2	12	2801405	2801416	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_013159	GGCGTC	2	12	2819991	2820002	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_013159	GCCGTG	2	12	2857042	2857053	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_013159	GGTGCC	2	12	2866899	2866910	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_013159	AACGCC	2	12	2866992	2867003	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
143	NC_013159	TCCGGA	2	12	2900219	2900230	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_013159	CGGTCA	2	12	2904802	2904813	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_013159	ACATCT	2	12	2905048	2905059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_013159	CCGACA	2	12	2980576	2980587	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
147	NC_013159	ACTCCC	2	12	2983514	2983525	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_013159	CACCCC	2	12	2984312	2984323	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
149	NC_013159	CGACCC	2	12	2984544	2984555	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_013159	TCGCCG	2	12	3012251	3012262	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
151	NC_013159	CCTTCC	2	12	3051147	3051158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_013159	GCCGAG	2	12	3088008	3088019	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_013159	CCGTCC	2	12	3097629	3097640	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_013159	CGCCCG	2	12	3098820	3098831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_013159	TCGACG	2	12	3101417	3101428	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_013159	CTCGTT	2	12	3112132	3112143	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_013159	CGACAA	2	12	3125176	3125187	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_013159	CGCTCC	2	12	3140608	3140619	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_013159	CGACAG	2	12	3146159	3146170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_013159	GAACAC	2	12	3153200	3153211	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_013159	GTCCAG	2	12	3157870	3157881	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_013159	CGGTCA	2	12	3176556	3176567	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_013159	TCGCGT	2	12	3178418	3178429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_013159	CCCGTC	2	12	3259593	3259604	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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167	NC_013159	ATCTCG	2	12	3271237	3271248	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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172	NC_013159	CTCGTC	2	12	3426930	3426941	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
173	NC_013159	TTGGCA	2	12	3432150	3432161	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
174	NC_013159	AACGGC	2	12	3451468	3451479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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188	NC_013159	TCCCTG	2	12	3717699	3717710	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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200	NC_013159	CCTTCT	2	12	4036375	4036386	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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210	NC_013159	CCGCGG	2	12	4257264	4257275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
211	NC_013159	GCCGTT	2	12	4266200	4266211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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213	NC_013159	CCCGCC	2	12	4291186	4291197	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.