MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 12182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013159	GCC	2	6	1535735	1535740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4002	NC_013159	TG	3	6	1535796	1535801	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_013159	TGC	2	6	1535806	1535811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_013159	CG	3	6	1535832	1535837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4005	NC_013159	GCA	2	6	1535845	1535850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_013159	CAGT	2	8	1535883	1535890	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4007	NC_013159	TCC	2	6	1539146	1539151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4008	NC_013159	GAT	2	6	1539216	1539221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_013159	GA	3	6	1539244	1539249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_013159	TG	3	6	1539284	1539289	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_013159	ACG	2	6	1539897	1539902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_013159	GTCA	2	8	1539946	1539953	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4013	NC_013159	AC	3	6	1543203	1543208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4014	NC_013159	GAGT	2	8	1543237	1543244	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_013159	CGG	2	6	1543251	1543256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_013159	CTG	2	6	1543285	1543290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_013159	GC	3	6	1543297	1543302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4018	NC_013159	TG	3	6	1543366	1543371	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_013159	CGAC	2	8	1544305	1544312	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4020	NC_013159	ACT	2	6	1546161	1546166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_013159	CAG	2	6	1546176	1546181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_013159	GGA	2	6	1546190	1546195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_013159	CCG	2	6	1546220	1546225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_013159	ACC	2	6	1546263	1546268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4025	NC_013159	AGG	2	6	1546344	1546349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_013159	TGTT	2	8	1546399	1546406	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_013159	GA	3	6	1546443	1546448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_013159	GGA	2	6	1546450	1546455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_013159	CGG	2	6	1547211	1547216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_013159	AGC	2	6	1547217	1547222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_013159	CGA	2	6	1547237	1547242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_013159	GC	3	6	1547839	1547844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_013159	TCGT	2	8	1547858	1547865	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4034	NC_013159	CGTG	2	8	1547886	1547893	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4035	NC_013159	TCG	2	6	1550352	1550357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_013159	GGC	2	6	1550421	1550426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_013159	CGTT	2	8	1550915	1550922	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4038	NC_013159	CTG	2	6	1550945	1550950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_013159	GTC	2	6	1550958	1550963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_013159	GAG	2	6	1550974	1550979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_013159	CGAC	2	8	1550982	1550989	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4042	NC_013159	GCC	2	6	1557061	1557066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4043	NC_013159	GCC	2	6	1557084	1557089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4044	NC_013159	GATC	2	8	1557099	1557106	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4045	NC_013159	CGG	2	6	1557897	1557902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_013159	CAC	3	9	1557906	1557914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4047	NC_013159	CCT	2	6	1559619	1559624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4048	NC_013159	TCT	2	6	1559629	1559634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_013159	GGC	2	6	1559656	1559661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_013159	CTGT	2	8	1559674	1559681	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4051	NC_013159	GGC	2	6	1559698	1559703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_013159	GTC	2	6	1559734	1559739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_013159	CCG	2	6	1562251	1562256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_013159	GCC	2	6	1562276	1562281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4055	NC_013159	CGTGTC	2	12	1562286	1562297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_013159	TGTCCG	2	12	1562300	1562311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_013159	TGCCCA	2	12	1562312	1562323	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4058	NC_013159	GTC	2	6	1562350	1562355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_013159	CGG	2	6	1562364	1562369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_013159	CTC	2	6	1562377	1562382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4061	NC_013159	TGC	2	6	1562446	1562451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_013159	ACG	2	6	1562455	1562460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_013159	TCG	2	6	1562461	1562466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_013159	C	6	6	1562505	1562510	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4065	NC_013159	GAC	2	6	1562559	1562564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_013159	CG	3	6	1562625	1562630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4067	NC_013159	CGT	2	6	1562646	1562651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_013159	AGT	2	6	1562655	1562660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_013159	GCG	3	9	1562694	1562702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_013159	AACG	2	8	1562740	1562747	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4071	NC_013159	GTCAC	2	10	1562765	1562774	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4072	NC_013159	GCG	2	6	1562793	1562798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_013159	CGC	2	6	1562866	1562871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4074	NC_013159	GAC	2	6	1562958	1562963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_013159	TGG	3	9	1565625	1565633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_013159	CGC	2	6	1565637	1565642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4077	NC_013159	GCT	2	6	1565668	1565673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_013159	AC	3	6	1565675	1565680	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4079	NC_013159	CG	3	6	1565682	1565687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4080	NC_013159	TGG	2	6	1567584	1567589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_013159	TAG	2	6	1567605	1567610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_013159	CCG	2	6	1568851	1568856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4083	NC_013159	GTCC	2	8	1568869	1568876	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4084	NC_013159	GAC	2	6	1570275	1570280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_013159	TGG	2	6	1570305	1570310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_013159	ACG	2	6	1570313	1570318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_013159	TTC	2	6	1570320	1570325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_013159	GAG	2	6	1570326	1570331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_013159	TCG	2	6	1571074	1571079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_013159	CATC	2	8	1571118	1571125	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4091	NC_013159	GACCG	2	10	1573850	1573859	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4092	NC_013159	ACG	2	6	1574341	1574346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_013159	CCG	2	6	1574376	1574381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4094	NC_013159	GCA	2	6	1574384	1574389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_013159	AGCACC	2	12	1574395	1574406	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4096	NC_013159	CCG	2	6	1574439	1574444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4097	NC_013159	GCC	2	6	1574516	1574521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4098	NC_013159	CGT	2	6	1574523	1574528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_013159	TCC	2	6	1574537	1574542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4100	NC_013159	C	6	6	1574547	1574552	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4101	NC_013159	C	6	6	1574561	1574566	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4102	NC_013159	GAC	2	6	1574598	1574603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_013159	CGCCAC	3	18	1574629	1574646	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
4104	NC_013159	CCGG	2	8	1577106	1577113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4105	NC_013159	G	8	8	1579399	1579406	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_013159	G	6	6	1580234	1580239	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_013159	TG	3	6	1580318	1580323	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_013159	CCG	2	6	1582063	1582068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4109	NC_013159	CAG	2	6	1584490	1584495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_013159	ACC	2	6	1584570	1584575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4111	NC_013159	ACACG	2	10	1584605	1584614	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4112	NC_013159	GAG	2	6	1584622	1584627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_013159	GGC	2	6	1585328	1585333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_013159	CCG	2	6	1585338	1585343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4115	NC_013159	GGT	2	6	1585824	1585829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_013159	CGTC	2	8	1585830	1585837	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4117	NC_013159	GGA	2	6	1585841	1585846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_013159	CGT	2	6	1585853	1585858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_013159	GCGG	2	8	1585895	1585902	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4120	NC_013159	ACT	2	6	1585941	1585946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_013159	GGA	2	6	1586046	1586051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_013159	CGCT	2	8	1586080	1586087	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4123	NC_013159	ACA	2	6	1586812	1586817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_013159	GCC	2	6	1588584	1588589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4125	NC_013159	CAC	2	6	1588626	1588631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4126	NC_013159	GAG	2	6	1588654	1588659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_013159	GTC	2	6	1590202	1590207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_013159	GA	3	6	1590234	1590239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_013159	CGA	2	6	1594135	1594140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_013159	GGC	2	6	1594611	1594616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4132	NC_013159	CGC	2	6	1594658	1594663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4135	NC_013159	CGA	2	6	1594717	1594722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4251	NC_013159	TCAG	2	8	1674030	1674037	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4252	NC_013159	TG	3	6	1674116	1674121	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_013159	CA	3	6	1674124	1674129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4254	NC_013159	TGA	2	6	1674185	1674190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4260	NC_013159	ACC	2	6	1676576	1676581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4261	NC_013159	GT	3	6	1676662	1676667	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_013159	ACC	2	6	1676680	1676685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4263	NC_013159	CA	3	6	1676691	1676696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4264	NC_013159	TGT	2	6	1678349	1678354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4266	NC_013159	TTG	2	6	1678383	1678388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4268	NC_013159	ATCG	2	8	1678514	1678521	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4272	NC_013159	GTC	2	6	1678620	1678625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4281	NC_013159	GGCA	2	8	1683161	1683168	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4292	NC_013159	CGG	2	6	1684495	1684500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4295	NC_013159	TCG	2	6	1684647	1684652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4301	NC_013159	GGAC	2	8	1684838	1684845	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4302	NC_013159	CGG	2	6	1684891	1684896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4375	NC_013159	CGGG	2	8	1719721	1719728	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4376	NC_013159	GGGT	2	8	1721020	1721027	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4377	NC_013159	CTCG	2	8	1721055	1721062	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4382	NC_013159	GGC	2	6	1722575	1722580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4384	NC_013159	TTGA	2	8	1722615	1722622	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4385	NC_013159	TCAA	2	8	1722635	1722642	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4386	NC_013159	AATC	2	8	1722643	1722650	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4387	NC_013159	AAG	2	6	1722651	1722656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4388	NC_013159	CCGC	2	8	1722673	1722680	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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4390	NC_013159	CGC	2	6	1722738	1722743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4391	NC_013159	GATA	2	8	1723727	1723734	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4392	NC_013159	AG	3	6	1723869	1723874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4393	NC_013159	A	7	7	1724694	1724700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4394	NC_013159	GTC	2	6	1727029	1727034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4480	NC_013159	TCG	2	6	1758384	1758389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4484	NC_013159	CCGGA	2	10	1758568	1758577	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4485	NC_013159	CTG	2	6	1759703	1759708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4486	NC_013159	TGA	2	6	1759782	1759787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4487	NC_013159	CGAT	2	8	1759811	1759818	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4488	NC_013159	TCG	2	6	1759830	1759835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4490	NC_013159	TGAG	2	8	1761040	1761047	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4491	NC_013159	CCAG	2	8	1761090	1761097	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4492	NC_013159	AGCC	2	8	1761112	1761119	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4493	NC_013159	ACC	2	6	1761145	1761150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4499	NC_013159	GATG	2	8	1762697	1762704	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4500	NC_013159	CGAC	2	8	1762716	1762723	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

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