MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 12182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013159	GAG	2	6	412596	412601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_013159	GAG	2	6	413031	413036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_013159	TCGG	2	8	413668	413675	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1004	NC_013159	CGG	3	9	413684	413692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_013159	GCC	2	6	413705	413710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_013159	GGCG	2	8	413738	413745	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_013159	AGGAA	2	10	413751	413760	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_013159	GAG	2	6	414872	414877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_013159	GTC	2	6	417319	417324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_013159	ACA	2	6	420070	420075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_013159	TGC	2	6	420104	420109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_013159	CGAAG	2	10	421736	421745	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1013	NC_013159	CGTG	2	8	421769	421776	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_013159	TGT	2	6	421837	421842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_013159	G	7	7	421843	421849	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_013159	AGC	2	6	421852	421857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_013159	GTG	2	6	421864	421869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_013159	CGT	2	6	425157	425162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_013159	GCC	2	6	425204	425209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_013159	GC	4	8	425264	425271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_013159	GCC	2	6	429338	429343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_013159	CGG	2	6	429348	429353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_013159	CGG	2	6	429384	429389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_013159	CGA	2	6	429422	429427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_013159	CGG	2	6	429428	429433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_013159	TTCACG	2	12	431510	431521	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_013159	ACT	2	6	431528	431533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_013159	ACA	2	6	431549	431554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_013159	CGT	2	6	431579	431584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_013159	GGA	2	6	431997	432002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_013159	CGG	2	6	432329	432334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_013159	TGC	2	6	432793	432798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_013159	CTGTT	2	10	432814	432823	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1034	NC_013159	CCA	2	6	432834	432839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_013159	GGC	2	6	432856	432861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_013159	CAG	2	6	433739	433744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_013159	TAC	2	6	433749	433754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_013159	GA	3	6	433838	433843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_013159	C	6	6	433866	433871	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1040	NC_013159	TTG	3	9	433908	433916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_013159	GC	3	6	433918	433923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_013159	GCCC	2	8	434939	434946	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1043	NC_013159	GT	3	6	434982	434987	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_013159	GTG	2	6	435054	435059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_013159	GTC	2	6	435151	435156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_013159	TG	3	6	435160	435165	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_013159	CGA	2	6	435183	435188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_013159	ATT	2	6	436546	436551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_013159	TTG	2	6	436579	436584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_013159	CGA	2	6	436591	436596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_013159	CG	3	6	436650	436655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_013159	GCC	2	6	439516	439521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_013159	GAG	2	6	439528	439533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_013159	CGGGC	2	10	439540	439549	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1055	NC_013159	CAC	2	6	439599	439604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_013159	GCC	2	6	439653	439658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_013159	CCGC	2	8	439696	439703	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1058	NC_013159	ACGA	2	8	439729	439736	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_013159	GGTGT	2	10	439755	439764	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_013159	CAC	2	6	439772	439777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_013159	CGG	2	6	439781	439786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_013159	GAC	2	6	439791	439796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_013159	GGC	2	6	439808	439813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_013159	GGTTCG	2	12	439825	439836	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1065	NC_013159	CGC	2	6	439850	439855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_013159	CAC	2	6	439928	439933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_013159	GCG	2	6	439950	439955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_013159	GCG	3	9	440020	440028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_013159	GCC	2	6	440095	440100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_013159	GCG	2	6	440111	440116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_013159	TGC	2	6	440149	440154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1078	NC_013159	GC	3	6	440464	440469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_013159	CCG	2	6	440476	440481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1081	NC_013159	GGT	2	6	440502	440507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_013159	C	6	6	440513	440518	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1083	NC_013159	TG	3	6	440562	440567	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_013159	CGG	2	6	440575	440580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_013159	CGT	2	6	440597	440602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1087	NC_013159	CAA	2	6	440630	440635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_013159	CGT	3	9	440639	440647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1090	NC_013159	GGTT	2	8	441715	441722	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_013159	GCGT	2	8	441802	441809	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1093	NC_013159	GCG	2	6	441852	441857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_013159	ACC	2	6	441859	441864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_013159	AC	3	6	441902	441907	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1096	NC_013159	AAC	2	6	441944	441949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_013159	CGA	2	6	445386	445391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_013159	CGA	3	9	445395	445403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_013159	GCG	2	6	446302	446307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_013159	CGGA	2	8	449777	449784	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_013159	CCG	2	6	449790	449795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_013159	GTT	2	6	449933	449938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_013159	ACGTGG	2	12	449943	449954	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1104	NC_013159	CAGC	2	8	449963	449970	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_013159	GGTA	2	8	451399	451406	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_013159	TGTGG	2	10	451475	451484	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_013159	TGC	2	6	454121	454126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1109	NC_013159	GCT	2	6	454946	454951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1111	NC_013159	CGG	2	6	455015	455020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_013159	GGGC	2	8	455099	455106	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1113	NC_013159	GGCCG	2	10	455107	455116	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1114	NC_013159	GGC	2	6	457303	457308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_013159	TCG	2	6	457397	457402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_013159	GTG	2	6	457404	457409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_013159	GTCTC	2	10	457429	457438	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1118	NC_013159	CCG	2	6	457460	457465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_013159	TG	3	6	457466	457471	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_013159	GT	3	6	457477	457482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_013159	CGTG	2	8	457521	457528	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_013159	CGT	2	6	457563	457568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_013159	GAG	2	6	457583	457588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_013159	CGT	2	6	457648	457653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_013159	TG	3	6	457674	457679	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_013159	CGG	2	6	457800	457805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1128	NC_013159	AG	3	6	458239	458244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_013159	GAC	2	6	459903	459908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_013159	GCG	2	6	459919	459924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_013159	GCC	2	6	459937	459942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_013159	CGCC	2	8	459956	459963	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1133	NC_013159	CGG	2	6	459978	459983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_013159	CAC	2	6	460353	460358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_013159	ACT	2	6	460389	460394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_013159	ACG	2	6	460431	460436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_013159	GTTT	2	8	460519	460526	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_013159	CGT	2	6	460594	460599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1139	NC_013159	T	6	6	461522	461527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_013159	TCC	2	6	461566	461571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1141	NC_013159	A	7	7	461572	461578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_013159	AGGA	2	8	461646	461653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_013159	ACGCC	2	10	462300	462309	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1144	NC_013159	GTGTT	2	10	462327	462336	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1145	NC_013159	GATC	2	8	462344	462351	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1146	NC_013159	CGC	2	6	462352	462357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1147	NC_013159	CGG	2	6	462387	462392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1148	NC_013159	GAT	2	6	462414	462419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1149	NC_013159	CG	3	6	462562	462567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1150	NC_013159	GTT	2	6	462570	462575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1151	NC_013159	CCG	2	6	464723	464728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1152	NC_013159	CGG	2	6	466312	466317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1153	NC_013159	CGA	2	6	469412	469417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1156	NC_013159	GA	3	6	473353	473358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1157	NC_013159	AACG	2	8	476633	476640	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1158	NC_013159	CCT	2	6	478380	478385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1159	NC_013159	GACC	2	8	478427	478434	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1161	NC_013159	G	6	6	478470	478475	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1162	NC_013159	AC	3	6	478495	478500	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1163	NC_013159	CCGA	2	8	478502	478509	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1164	NC_013159	CTTG	2	8	479463	479470	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1165	NC_013159	TGCGG	2	10	479472	479481	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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1169	NC_013159	CCG	2	6	481125	481130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1172	NC_013159	CCA	2	6	481496	481501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1173	NC_013159	CGT	2	6	481565	481570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1174	NC_013159	CGT	2	6	481579	481584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1242	NC_013159	GAG	2	6	502425	502430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1255	NC_013159	GTG	2	6	504300	504305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1256	NC_013159	AC	3	6	504319	504324	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1257	NC_013159	TCG	2	6	504376	504381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1262	NC_013159	G	7	7	504788	504794	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1265	NC_013159	CGG	2	6	505521	505526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1266	NC_013159	CAC	2	6	505534	505539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1267	NC_013159	TCG	2	6	505541	505546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1268	NC_013159	CGG	2	6	505557	505562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1399	NC_013159	CGAT	2	8	562156	562163	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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