MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 12182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013159	GCC	2	6	1859727	1859732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5002	NC_013159	CGA	2	6	1859741	1859746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_013159	CACG	2	8	1860636	1860643	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5004	NC_013159	CGG	2	6	1861472	1861477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_013159	GTG	2	6	1862563	1862568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_013159	GCG	2	6	1862599	1862604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_013159	GTC	2	6	1862662	1862667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_013159	GGA	2	6	1862697	1862702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_013159	GTGG	2	8	1862707	1862714	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_013159	GGC	3	9	1862760	1862768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_013159	CGGT	2	8	1862774	1862781	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5012	NC_013159	GGT	2	6	1862788	1862793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_013159	GGA	2	6	1862847	1862852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_013159	GTC	2	6	1862866	1862871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_013159	CGA	2	6	1862880	1862885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_013159	GGC	2	6	1862900	1862905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_013159	GGT	2	6	1863006	1863011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_013159	GGC	2	6	1863035	1863040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_013159	CGT	2	6	1863048	1863053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_013159	TCC	2	6	1863148	1863153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5021	NC_013159	GC	3	6	1863197	1863202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_013159	AAC	2	6	1863254	1863259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_013159	CCA	2	6	1863287	1863292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_013159	GTG	2	6	1863528	1863533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_013159	GAAC	2	8	1863554	1863561	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5026	NC_013159	GCC	2	6	1863563	1863568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5027	NC_013159	CGT	2	6	1863601	1863606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_013159	TCG	2	6	1863610	1863615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_013159	CCG	2	6	1863655	1863660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5030	NC_013159	ACG	2	6	1863700	1863705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_013159	A	6	6	1863729	1863734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_013159	ATC	3	9	1863738	1863746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_013159	CGGT	2	8	1863787	1863794	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5034	NC_013159	GT	4	8	1863816	1863823	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_013159	CGA	2	6	1863836	1863841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_013159	GGC	2	6	1863860	1863865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_013159	GTC	2	6	1863870	1863875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_013159	GAG	2	6	1863921	1863926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_013159	CACTG	2	10	1864019	1864028	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5040	NC_013159	CCT	2	6	1864069	1864074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5041	NC_013159	GCT	2	6	1864081	1864086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_013159	GAC	2	6	1864102	1864107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_013159	GGT	2	6	1864115	1864120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_013159	GAC	2	6	1864758	1864763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_013159	CAC	2	6	1864785	1864790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5046	NC_013159	GGA	3	9	1864795	1864803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_013159	GA	3	6	1865217	1865222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_013159	TCGGG	2	10	1865289	1865298	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5049	NC_013159	CGGC	2	8	1865333	1865340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5050	NC_013159	GCGT	2	8	1865386	1865393	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5051	NC_013159	CTG	2	6	1865417	1865422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_013159	CGT	2	6	1865479	1865484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_013159	CGG	2	6	1865553	1865558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_013159	CGA	2	6	1865596	1865601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_013159	GTC	2	6	1865642	1865647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_013159	GGT	2	6	1865659	1865664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_013159	CGG	2	6	1865726	1865731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_013159	CGG	2	6	1865762	1865767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_013159	TGC	2	6	1865805	1865810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_013159	GGT	2	6	1865819	1865824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_013159	GGA	2	6	1865846	1865851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_013159	CGA	2	6	1865855	1865860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_013159	CTA	2	6	1865951	1865956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_013159	CGT	2	6	1865995	1866000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_013159	CGA	2	6	1866018	1866023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_013159	CGG	2	6	1866068	1866073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_013159	GAG	2	6	1866109	1866114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_013159	GC	3	6	1866151	1866156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5069	NC_013159	GT	3	6	1866218	1866223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_013159	CGG	2	6	1866269	1866274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_013159	TGA	2	6	1866333	1866338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_013159	GCGGG	2	10	1866345	1866354	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5073	NC_013159	GGT	2	6	1866438	1866443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_013159	TGT	2	6	1866449	1866454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_013159	TTC	2	6	1866485	1866490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_013159	CGG	2	6	1866494	1866499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_013159	GTG	2	6	1866526	1866531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_013159	ACC	2	6	1866555	1866560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5079	NC_013159	GTG	2	6	1866613	1866618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_013159	ATC	2	6	1866677	1866682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_013159	CCCG	2	8	1870092	1870099	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5082	NC_013159	GTC	2	6	1870112	1870117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_013159	ACCGG	2	10	1870221	1870230	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5084	NC_013159	TTC	2	6	1873696	1873701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_013159	GTC	2	6	1873709	1873714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_013159	GAC	2	6	1874497	1874502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_013159	GAG	2	6	1874522	1874527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_013159	GCCG	2	8	1874536	1874543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5089	NC_013159	TGA	2	6	1876921	1876926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_013159	GGC	2	6	1877029	1877034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_013159	GTGC	2	8	1877057	1877064	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5092	NC_013159	GCG	2	6	1877109	1877114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_013159	GGCT	2	8	1877129	1877136	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5094	NC_013159	CAC	2	6	1877181	1877186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5095	NC_013159	TCG	2	6	1877245	1877250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_013159	ATC	2	6	1877279	1877284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_013159	TCGGAT	2	12	1877292	1877303	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5098	NC_013159	GAG	2	6	1877322	1877327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_013159	CAG	2	6	1878320	1878325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_013159	AGC	2	6	1878384	1878389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_013159	GAA	2	6	1878392	1878397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_013159	GGA	2	6	1878405	1878410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_013159	AC	3	6	1878795	1878800	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5104	NC_013159	GAG	2	6	1878830	1878835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_013159	GTG	2	6	1878853	1878858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_013159	CGA	2	6	1878860	1878865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_013159	CAC	2	6	1878879	1878884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5108	NC_013159	TCC	2	6	1878911	1878916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5109	NC_013159	GTC	2	6	1883731	1883736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_013159	GAA	2	6	1883789	1883794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_013159	TTC	2	6	1883799	1883804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_013159	CTT	2	6	1883846	1883851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_013159	GA	3	6	1883961	1883966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_013159	CGT	2	6	1883998	1884003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_013159	AT	3	6	1884006	1884011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_013159	ACA	2	6	1884031	1884036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_013159	CCGG	2	8	1885079	1885086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5118	NC_013159	GCC	2	6	1885090	1885095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5119	NC_013159	GGCG	2	8	1885110	1885117	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5120	NC_013159	GCC	2	6	1885123	1885128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5121	NC_013159	CGA	2	6	1885697	1885702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5123	NC_013159	CAC	2	6	1885746	1885751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5124	NC_013159	TGG	2	6	1885837	1885842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_013159	CGA	2	6	1885856	1885861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_013159	CCG	2	6	1885905	1885910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5127	NC_013159	TCT	2	6	1885929	1885934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_013159	CGG	2	6	1885957	1885962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_013159	GTGGC	2	10	1885968	1885977	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5130	NC_013159	CGA	2	6	1886396	1886401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_013159	GCT	2	6	1886425	1886430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_013159	CGG	2	6	1886438	1886443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5133	NC_013159	CGGC	2	8	1886516	1886523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5241	NC_013159	GAT	2	6	1903748	1903753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5242	NC_013159	TGT	2	6	1903761	1903766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5243	NC_013159	GTC	2	6	1903785	1903790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5246	NC_013159	GGC	2	6	1906370	1906375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5247	NC_013159	CTCG	2	8	1906412	1906419	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5248	NC_013159	CAT	2	6	1906466	1906471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5249	NC_013159	CAAGAT	2	12	1906525	1906536	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5250	NC_013159	TCGA	2	8	1912113	1912120	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5251	NC_013159	CGG	2	6	1912140	1912145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5252	NC_013159	CGC	2	6	1951377	1951382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5253	NC_013159	AGGA	2	8	1951386	1951393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5254	NC_013159	GGA	2	6	1959769	1959774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5255	NC_013159	GAG	2	6	1960503	1960508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5256	NC_013159	ACC	2	6	1960518	1960523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5257	NC_013159	ATCGA	2	10	1960529	1960538	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5258	NC_013159	CGT	2	6	1960602	1960607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5259	NC_013159	CGG	2	6	1960678	1960683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5260	NC_013159	GCGG	2	8	1960685	1960692	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5261	NC_013159	TGG	2	6	1963422	1963427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5272	NC_013159	GTT	2	6	1969876	1969881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5323	NC_013159	CGTCC	2	10	1987476	1987485	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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5383	NC_013159	TCG	2	6	2023692	2023697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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