MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis BM407 chromosome

Total Repeats: 3897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012926	AAC	2	6	9	14	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012926	TCA	2	6	1452	1457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012926	ACT	2	6	1480	1485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012926	ATA	2	6	1505	1510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012926	ATA	2	6	2663	2668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012926	ACT	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012926	GAG	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012926	TTC	2	6	5530	5535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012926	GTT	2	6	5536	5541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012926	GAT	2	6	5615	5620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012926	AAT	2	6	9762	9767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012926	AGG	2	6	10523	10528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012926	AAC	2	6	13083	13088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012926	CTA	2	6	13644	13649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012926	CAA	2	6	15945	15950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012926	GAA	2	6	16533	16538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012926	GAT	2	6	16621	16626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012926	AGA	2	6	16706	16711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012926	AGA	2	6	16860	16865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012926	GGC	2	6	17005	17010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012926	GCA	2	6	17324	17329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012926	CGC	2	6	17371	17376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_012926	TGT	2	6	17410	17415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012926	AGA	2	6	17419	17424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012926	AGA	2	6	17431	17436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012926	CAG	2	6	17493	17498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012926	GGA	2	6	17683	17688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012926	GAA	2	6	17947	17952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012926	GGT	2	6	18021	18026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012926	GTC	2	6	18035	18040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012926	CAT	2	6	18103	18108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012926	TAA	2	6	18138	18143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012926	GGA	2	6	18147	18152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012926	ATC	2	6	18171	18176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012926	CGC	2	6	18337	18342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_012926	CAC	2	6	18382	18387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_012926	GAT	2	6	18453	18458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012926	CCT	2	6	18509	18514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_012926	TCT	2	6	18544	18549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012926	AGG	2	6	18610	18615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012926	AAC	2	6	18645	18650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_012926	GTT	2	6	18655	18660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012926	ATC	2	6	18848	18853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012926	AGT	2	6	18856	18861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012926	ACG	2	6	18986	18991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012926	TAG	2	6	19157	19162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012926	AGG	2	6	19179	19184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012926	GAG	2	6	19192	19197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012926	CTC	2	6	19202	19207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_012926	AGA	2	6	19244	19249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012926	TCG	2	6	19347	19352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012926	GGA	2	6	19360	19365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012926	ACA	2	6	19478	19483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012926	ATG	2	6	19545	19550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012926	TAT	2	6	19610	19615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012926	GGA	2	6	19678	19683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012926	ACC	2	6	19944	19949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_012926	AAT	2	6	19964	19969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012926	AGC	2	6	20024	20029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012926	AAG	2	6	20161	20166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012926	GAG	2	6	20176	20181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012926	ACA	2	6	20332	20337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012926	GAT	2	6	20736	20741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012926	AGG	2	6	20781	20786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012926	CGG	2	6	20827	20832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012926	TAC	2	6	21097	21102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012926	CCT	2	6	21185	21190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_012926	GGT	2	6	21321	21326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012926	TCG	2	6	21436	21441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012926	CGT	2	6	21516	21521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_012926	AGT	2	6	21907	21912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012926	CAG	2	6	21958	21963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012926	AGT	2	6	21984	21989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012926	ACC	2	6	22507	22512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_012926	CGT	2	6	22544	22549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012926	CGC	2	6	22937	22942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_012926	GGA	2	6	23041	23046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012926	TCC	2	6	23124	23129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_012926	CTA	2	6	23134	23139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012926	AGC	2	6	23151	23156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012926	TCG	2	6	23165	23170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_012926	CGG	2	6	23277	23282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_012926	TAT	2	6	23325	23330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012926	GGT	2	6	23383	23388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012926	TAA	2	6	24914	24919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012926	GAG	2	6	24975	24980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012926	AGG	2	6	26341	26346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012926	CTT	2	6	27343	27348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_012926	TAT	2	6	27371	27376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012926	AAC	2	6	30630	30635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_012926	TGT	2	6	30644	30649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012926	TTA	2	6	42786	42791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012926	GAA	2	6	46633	46638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012926	AAG	2	6	46647	46652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012926	ATT	2	6	46692	46697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012926	CGT	2	6	46710	46715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012926	GTC	2	6	46717	46722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012926	AGG	2	6	46765	46770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012926	TAT	2	6	46826	46831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012926	TCG	2	6	46844	46849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_012926	GTC	2	6	46852	46857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_012926	ATT	2	6	46886	46891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012926	ATT	2	6	46929	46934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012926	AAG	2	6	46936	46941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012926	ATC	2	6	46969	46974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_012926	CGC	2	6	46987	46992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_012926	GTC	2	6	46994	46999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_012926	TAA	3	9	52262	52270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012926	TGA	2	6	52281	52286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012926	GGA	2	6	52349	52354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012926	GAA	2	6	52388	52393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012926	GAA	2	6	52444	52449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012926	GAG	2	6	52484	52489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012926	TAA	2	6	55317	55322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012926	AAG	2	6	55346	55351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012926	GAA	2	6	56344	56349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012926	GTC	2	6	56425	56430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012926	GAA	2	6	56457	56462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012926	ATT	2	6	56467	56472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012926	ATG	2	6	56497	56502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012926	AAT	2	6	56522	56527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012926	ATG	2	6	56593	56598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012926	AGG	2	6	56714	56719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012926	CAA	2	6	57997	58002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_012926	GTT	2	6	58016	58021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012926	TGA	2	6	58355	58360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012926	AGG	2	6	59496	59501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012926	ATA	2	6	60886	60891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012926	GAA	2	6	60911	60916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012926	AGG	2	6	62482	62487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012926	ATT	2	6	62533	62538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012926	AGG	2	6	66447	66452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012926	GTT	2	6	68903	68908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012926	TAA	2	6	68951	68956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012926	ATA	2	6	69028	69033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012926	TAA	2	6	69048	69053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012926	AAT	2	6	69522	69527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012926	AAG	2	6	69560	69565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012926	TCC	2	6	71583	71588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_012926	ATG	2	6	71631	71636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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