MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis BM407 chromosome

Total Repeats: 7546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012926	AT	3	6	1130715	1130720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_012926	AT	3	6	1130733	1130738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_012926	TTA	2	6	1130759	1130764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_012926	AT	3	6	1130784	1130789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_012926	TAA	2	6	1130802	1130807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_012926	CT	3	6	1131490	1131495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4007	NC_012926	ATT	2	6	1131496	1131501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_012926	T	7	7	1131504	1131510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_012926	T	6	6	1131529	1131534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_012926	ATAA	2	8	1132619	1132626	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_012926	TC	3	6	1134601	1134606	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4012	NC_012926	A	7	7	1134630	1134636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_012926	CTC	2	6	1134701	1134706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_012926	C	6	6	1134763	1134768	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4015	NC_012926	TTC	2	6	1134865	1134870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_012926	A	6	6	1135748	1135753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_012926	TAC	2	6	1136413	1136418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_012926	AT	3	6	1136427	1136432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_012926	TA	3	6	1136434	1136439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_012926	A	6	6	1136463	1136468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_012926	ATC	2	6	1137455	1137460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_012926	TAT	2	6	1137480	1137485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_012926	AATT	2	8	1137538	1137545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_012926	CTC	2	6	1142965	1142970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4025	NC_012926	TAA	2	6	1142971	1142976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_012926	AAT	2	6	1142978	1142983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_012926	A	6	6	1143018	1143023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_012926	TCAA	2	8	1143043	1143050	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4029	NC_012926	CCT	2	6	1146665	1146670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4030	NC_012926	A	6	6	1146740	1146745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_012926	A	7	7	1146747	1146753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_012926	TTTTA	2	10	1149109	1149118	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_012926	AG	3	6	1149141	1149146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_012926	ATTT	2	8	1149179	1149186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4036	NC_012926	CAAG	2	8	1149306	1149313	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4037	NC_012926	AACCA	2	10	1149346	1149355	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4038	NC_012926	A	6	6	1149518	1149523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_012926	CTA	2	6	1149561	1149566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_012926	ATA	2	6	1149671	1149676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_012926	TGG	2	6	1149700	1149705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_012926	GCT	2	6	1149706	1149711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_012926	CTA	2	6	1149746	1149751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_012926	CTT	2	6	1149812	1149817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_012926	AAG	2	6	1149860	1149865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_012926	TCCAGC	2	12	1149939	1149950	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4047	NC_012926	A	6	6	1150069	1150074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_012926	GACA	2	8	1150079	1150086	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4049	NC_012926	AG	3	6	1150097	1150102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_012926	AAATA	2	10	1150118	1150127	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_012926	TCA	2	6	1150159	1150164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_012926	ATAG	3	12	1150234	1150245	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_012926	TGA	2	6	1150252	1150257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_012926	TC	3	6	1150280	1150285	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4055	NC_012926	AAT	2	6	1150305	1150310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_012926	A	6	6	1150346	1150351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_012926	TTG	2	6	1150367	1150372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_012926	TCA	2	6	1150415	1150420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_012926	TA	3	6	1150549	1150554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_012926	GTTT	2	8	1151622	1151629	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_012926	T	6	6	1151636	1151641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_012926	TTA	2	6	1151644	1151649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_012926	TTGT	2	8	1151669	1151676	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_012926	A	6	6	1151688	1151693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_012926	TA	3	6	1151700	1151705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_012926	AT	3	6	1151718	1151723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_012926	TTA	2	6	1151776	1151781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_012926	A	7	7	1151796	1151802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_012926	A	7	7	1151840	1151846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_012926	AGA	2	6	1151858	1151863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_012926	TAA	2	6	1152563	1152568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_012926	TA	3	6	1153461	1153466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_012926	TCA	2	6	1153563	1153568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_012926	CTT	3	9	1153627	1153635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4077	NC_012926	TAGA	2	8	1153759	1153766	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_012926	GTTG	2	8	1153797	1153804	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_012926	CGAT	2	8	1153822	1153829	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4080	NC_012926	AGG	2	6	1153859	1153864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_012926	T	6	6	1153922	1153927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_012926	CAT	2	6	1153957	1153962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_012926	TTG	2	6	1153963	1153968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_012926	CTGC	2	8	1153990	1153997	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4085	NC_012926	GC	3	6	1153996	1154001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4086	NC_012926	CTTG	2	8	1154031	1154038	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4087	NC_012926	TCA	2	6	1154049	1154054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4089	NC_012926	GAA	2	6	1154151	1154156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_012926	CGC	2	6	1154216	1154221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4092	NC_012926	TTTG	2	8	1154317	1154324	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_012926	TAA	2	6	1154340	1154345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_012926	GT	3	6	1154365	1154370	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_012926	GCT	2	6	1154422	1154427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_012926	CT	3	6	1154426	1154431	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4097	NC_012926	TGTT	2	8	1154478	1154485	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_012926	TCT	2	6	1154505	1154510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_012926	TAA	2	6	1154553	1154558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_012926	TTC	2	6	1154567	1154572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_012926	TTA	2	6	1154613	1154618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_012926	TTC	2	6	1154672	1154677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_012926	CAG	2	6	1154794	1154799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4105	NC_012926	TTC	2	6	1154906	1154911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_012926	CAA	2	6	1155046	1155051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_012926	GTA	2	6	1155215	1155220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_012926	TCG	2	6	1155267	1155272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_012926	TAA	2	6	1155323	1155328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_012926	GGAA	2	8	1155329	1155336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_012926	GTTT	2	8	1155437	1155444	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_012926	CAT	2	6	1155445	1155450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_012926	CTG	2	6	1155514	1155519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_012926	CTGT	2	8	1155588	1155595	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4115	NC_012926	CATTC	2	10	1155598	1155607	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4116	NC_012926	AAT	2	6	1155617	1155622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_012926	CAC	2	6	1155646	1155651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4118	NC_012926	GTTC	2	8	1155702	1155709	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4119	NC_012926	ATC	2	6	1155713	1155718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_012926	GCA	2	6	1155720	1155725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_012926	AAG	2	6	1155759	1155764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_012926	AGCG	2	8	1155776	1155783	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4123	NC_012926	C	6	6	1156017	1156022	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4124	NC_012926	TTC	2	6	1156189	1156194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_012926	TGC	2	6	1156204	1156209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_012926	AATC	2	8	1156300	1156307	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4127	NC_012926	GTT	2	6	1156325	1156330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_012926	AGT	2	6	1156341	1156346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_012926	AT	3	6	1156398	1156403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_012926	TGC	2	6	1156425	1156430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_012926	GAT	2	6	1156486	1156491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4133	NC_012926	TGT	2	6	1156525	1156530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4280	NC_012926	T	6	6	1198756	1198761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4352	NC_012926	A	7	7	1208452	1208458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4385	NC_012926	TTCT	2	8	1216032	1216039	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4394	NC_012926	TCT	2	6	1217117	1217122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4400	NC_012926	CTTT	2	8	1221900	1221907	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4401	NC_012926	T	6	6	1221905	1221910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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