MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis BM407 chromosome

Total Repeats: 7546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012926	GAA	2	6	243153	243158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_012926	GTTT	2	8	243164	243171	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_012926	AAGA	2	8	243186	243193	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_012926	GGA	2	6	243205	243210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_012926	ATC	2	6	244155	244160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_012926	AAG	2	6	244176	244181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_012926	GGAAT	2	10	244285	244294	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_012926	AT	3	6	244309	244314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_012926	T	6	6	244345	244350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_012926	GAA	2	6	244409	244414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_012926	T	6	6	244419	244424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_012926	CTG	2	6	244431	244436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_012926	AG	3	6	245721	245726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_012926	TA	3	6	246559	246564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_012926	A	6	6	246566	246571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_012926	TTC	2	6	249808	249813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_012926	TCCTT	2	10	254529	254538	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1018	NC_012926	TGT	2	6	254539	254544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_012926	AT	3	6	254563	254568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_012926	AT	3	6	254582	254587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_012926	TA	3	6	254598	254603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_012926	AAAT	2	8	254622	254629	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_012926	ATAA	2	8	254651	254658	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_012926	AAT	2	6	254723	254728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_012926	AGT	2	6	254734	254739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_012926	TAA	2	6	254745	254750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_012926	TAG	2	6	254805	254810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_012926	GGT	2	6	254818	254823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_012926	CTA	2	6	256751	256756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_012926	TAT	2	6	256804	256809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_012926	GTT	2	6	256823	256828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_012926	A	8	8	256833	256840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_012926	TCG	2	6	257733	257738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_012926	TTTTTC	2	12	257741	257752	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1035	NC_012926	TA	3	6	257766	257771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_012926	TCTGC	2	10	257778	257787	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1037	NC_012926	GGAA	2	8	259391	259398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_012926	T	6	6	259408	259413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_012926	TAGT	2	8	259471	259478	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_012926	CAT	2	6	260274	260279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_012926	ACA	2	6	260295	260300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_012926	TTG	2	6	260323	260328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_012926	AAG	2	6	260373	260378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_012926	ATT	2	6	262688	262693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_012926	ATC	2	6	262742	262747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_012926	A	6	6	262830	262835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_012926	TTTAG	2	10	262836	262845	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_012926	AAT	2	6	262868	262873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_012926	T	6	6	262988	262993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_012926	GCTG	2	8	263002	263009	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1051	NC_012926	A	6	6	263017	263022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_012926	CAAA	2	8	263125	263132	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_012926	GGT	2	6	263171	263176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_012926	AGA	2	6	263323	263328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_012926	AGA	2	6	263347	263352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_012926	GA	3	6	263377	263382	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_012926	GT	3	6	263436	263441	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_012926	CAA	2	6	263477	263482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_012926	ATT	2	6	263511	263516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_012926	A	6	6	263568	263573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_012926	A	6	6	263620	263625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_012926	TTC	2	6	263664	263669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_012926	ATT	2	6	263693	263698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_012926	T	6	6	263783	263788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_012926	A	7	7	263796	263802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_012926	TAA	2	6	263806	263811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_012926	TGA	2	6	263812	263817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1069	NC_012926	GGAA	2	8	263880	263887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_012926	GAA	2	6	264013	264018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_012926	CTG	3	9	264060	264068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_012926	AAT	2	6	264104	264109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_012926	TAT	2	6	264121	264126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_012926	AACCAA	2	12	264225	264236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1083	NC_012926	ACA	2	6	264853	264858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_012926	AGA	2	6	264868	264873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_012926	TA	3	6	265096	265101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_012926	ATCT	2	8	265180	265187	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1087	NC_012926	ATTT	2	8	265257	265264	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1089	NC_012926	TGT	2	6	265344	265349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1092	NC_012926	GTAAA	2	10	265799	265808	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_012926	T	7	7	265822	265828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_012926	T	6	6	265832	265837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_012926	AGG	2	6	265868	265873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1101	NC_012926	CCT	2	6	268371	268376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_012926	GTT	2	6	268417	268422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_012926	AGG	2	6	268472	268477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_012926	TAC	2	6	268514	268519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1106	NC_012926	AGAA	2	8	268586	268593	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_012926	CAAA	2	8	268634	268641	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1108	NC_012926	CAAAA	2	10	268693	268702	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1109	NC_012926	A	6	6	268706	268711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_012926	A	6	6	268716	268721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_012926	AAATA	2	10	268740	268749	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_012926	A	6	6	268749	268754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_012926	TAG	2	6	268755	268760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1117	NC_012926	TTGT	2	8	271724	271731	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_012926	TGG	2	6	271742	271747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_012926	TCTA	2	8	271809	271816	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1120	NC_012926	TAGAA	2	10	271845	271854	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_012926	A	6	6	271853	271858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_012926	T	6	6	271863	271868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_012926	ATTT	2	8	273371	273378	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_012926	GTTT	2	8	273404	273411	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_012926	TTAAA	2	10	273424	273433	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_012926	TA	3	6	273463	273468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_012926	GAT	2	6	273490	273495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_012926	AGAAA	2	10	273523	273532	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_012926	A	6	6	273530	273535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_012926	ATT	2	6	273629	273634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_012926	CTA	2	6	273667	273672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_012926	GGGTG	2	10	273676	273685	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_012926	GGGCT	2	10	273775	273784	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1134	NC_012926	TCTT	2	8	273814	273821	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1135	NC_012926	CGG	3	9	273866	273874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_012926	CTA	2	6	273918	273923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_012926	CTA	2	6	273927	273932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_012926	AGC	2	6	274329	274334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1139	NC_012926	CTT	2	6	274362	274367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1140	NC_012926	T	6	6	274387	274392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_012926	TGA	3	9	274430	274438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1143	NC_012926	AGA	2	6	274578	274583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1144	NC_012926	CAGGG	2	10	274634	274643	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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1150	NC_012926	TGA	2	6	274920	274925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1152	NC_012926	TGG	2	6	275069	275074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1153	NC_012926	TCA	3	9	275090	275098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1155	NC_012926	GGAG	2	8	275154	275161	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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1161	NC_012926	AAC	2	6	281074	281079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1174	NC_012926	AGA	2	6	289151	289156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1181	NC_012926	T	6	6	291679	291684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1259	NC_012926	CAT	2	6	326462	326467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1271	NC_012926	TTTC	2	8	327895	327902	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1272	NC_012926	TAT	2	6	327915	327920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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