MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis BM407 chromosome

Total Repeats: 7546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012926	GAG	2	6	119876	119881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_012926	GCTG	2	8	123174	123181	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
503	NC_012926	GGCAA	2	10	123246	123255	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
504	NC_012926	A	6	6	123320	123325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_012926	TGAA	2	8	123344	123351	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
506	NC_012926	TTA	2	6	123429	123434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_012926	ATC	2	6	123513	123518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_012926	AGG	2	6	123522	123527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_012926	AACT	2	8	125783	125790	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
510	NC_012926	AT	3	6	125864	125869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_012926	GT	3	6	125871	125876	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
512	NC_012926	GGATG	2	10	125936	125945	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
513	NC_012926	TTGC	2	8	125969	125976	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
514	NC_012926	AC	3	6	126053	126058	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
515	NC_012926	T	6	6	126069	126074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_012926	T	6	6	126086	126091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_012926	CAA	2	6	126656	126661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_012926	TGC	2	6	126675	126680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_012926	AG	3	6	126687	126692	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_012926	A	6	6	127956	127961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_012926	CATGA	2	10	129073	129082	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
522	NC_012926	TAC	2	6	129084	129089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_012926	AG	3	6	129204	129209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_012926	TTA	2	6	129260	129265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_012926	TTTG	2	8	129388	129395	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
526	NC_012926	CAA	2	6	129406	129411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_012926	TCTA	2	8	129646	129653	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
528	NC_012926	GTG	2	6	129673	129678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_012926	GAAAG	2	10	130387	130396	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
530	NC_012926	AGA	2	6	132003	132008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_012926	AGG	2	6	132852	132857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_012926	CTATA	2	10	133305	133314	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
533	NC_012926	CGA	2	6	133353	133358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_012926	A	6	6	133613	133618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_012926	AGG	2	6	133809	133814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_012926	T	7	7	135770	135776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_012926	TC	3	6	135855	135860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
538	NC_012926	AC	3	6	135900	135905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
539	NC_012926	A	6	6	135943	135948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_012926	TA	3	6	135949	135954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_012926	TAAGAT	2	12	136983	136994	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_012926	GAAGC	2	10	137029	137038	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
543	NC_012926	CAAT	2	8	137050	137057	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
544	NC_012926	T	6	6	137180	137185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_012926	TCTA	2	8	139510	139517	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
546	NC_012926	ACCT	2	8	139519	139526	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
547	NC_012926	T	7	7	139538	139544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_012926	ACG	2	6	139548	139553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_012926	CA	3	6	139561	139566	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
550	NC_012926	ATACTC	2	12	139577	139588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_012926	TGA	2	6	139624	139629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_012926	AGT	2	6	139688	139693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_012926	CGA	2	6	139710	139715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_012926	AAAC	2	8	139935	139942	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
555	NC_012926	TA	3	6	139956	139961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_012926	A	6	6	140019	140024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_012926	TGT	2	6	140101	140106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_012926	ACT	2	6	140137	140142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_012926	CAA	2	6	140189	140194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_012926	TTG	2	6	140209	140214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_012926	AAAT	2	8	140266	140273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_012926	ATT	2	6	140281	140286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_012926	TTTG	2	8	140296	140303	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
564	NC_012926	A	6	6	140315	140320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_012926	ATAG	2	8	140332	140339	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
566	NC_012926	AGA	2	6	140345	140350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_012926	AGT	2	6	140398	140403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_012926	AGG	2	6	140424	140429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
569	NC_012926	TGA	2	6	140442	140447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_012926	AAAG	2	8	140477	140484	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
571	NC_012926	A	6	6	142540	142545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_012926	A	6	6	142574	142579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_012926	TTAAG	2	10	142603	142612	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
574	NC_012926	ACC	2	6	142629	142634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_012926	T	6	6	142669	142674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_012926	T	6	6	142684	142689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_012926	TA	3	6	142734	142739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_012926	AGG	2	6	142838	142843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_012926	T	6	6	143896	143901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_012926	GTT	2	6	143958	143963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_012926	A	7	7	144037	144043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_012926	A	6	6	144058	144063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_012926	GTAAA	2	10	144085	144094	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
584	NC_012926	TGC	2	6	145698	145703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_012926	AGA	2	6	145768	145773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_012926	A	7	7	145924	145930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_012926	GTT	2	6	145934	145939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_012926	T	6	6	145938	145943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_012926	TTTG	2	8	145954	145961	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
590	NC_012926	CTT	2	6	145978	145983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_012926	ATT	2	6	146005	146010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_012926	AGG	2	6	146036	146041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_012926	GAAAA	2	10	146063	146072	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
594	NC_012926	CTATT	2	10	146089	146098	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
595	NC_012926	A	9	9	146673	146681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_012926	TAA	2	6	148568	148573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_012926	T	6	6	148614	148619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_012926	ATAAA	2	10	148642	148651	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_012926	GTA	2	6	150601	150606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_012926	CTTT	2	8	150613	150620	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
601	NC_012926	A	6	6	150637	150642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_012926	GTCT	2	8	150658	150665	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
603	NC_012926	GT	3	6	150845	150850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_012926	ACTAAG	2	12	150858	150869	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
605	NC_012926	CTA	2	6	150952	150957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_012926	ATT	2	6	150981	150986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_012926	A	6	6	150989	150994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_012926	AG	3	6	151015	151020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
609	NC_012926	AAAG	2	8	151133	151140	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
610	NC_012926	A	6	6	154216	154221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_012926	A	6	6	154224	154229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_012926	GTTATA	2	12	154289	154300	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
613	NC_012926	TCG	2	6	154317	154322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_012926	AAAAG	2	10	154334	154343	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
615	NC_012926	TAT	2	6	154347	154352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_012926	TTC	2	6	155651	155656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_012926	CTT	2	6	155664	155669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_012926	GAA	2	6	155678	155683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_012926	TGA	2	6	159763	159768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_012926	GA	3	6	159870	159875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_012926	TTC	2	6	159880	159885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_012926	CAT	2	6	161982	161987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_012926	AAC	2	6	162065	162070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_012926	TAGT	2	8	162078	162085	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
625	NC_012926	AATTG	2	10	162100	162109	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
626	NC_012926	TA	3	6	162150	162155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_012926	A	7	7	162184	162190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_012926	T	6	6	162207	162212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_012926	TA	3	6	162268	162273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_012926	ATAA	2	8	162305	162312	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_012926	AGG	2	6	162347	162352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
632	NC_012926	ATG	2	6	162387	162392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_012926	AGG	2	6	162412	162417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_012926	AAC	2	6	162451	162456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_012926	TTTTC	2	10	162459	162468	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
636	NC_012926	GAG	2	6	162520	162525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_012926	TGT	2	6	162542	162547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_012926	GAA	3	9	162624	162632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_012926	ATA	2	6	162799	162804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_012926	AGA	2	6	162857	162862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
641	NC_012926	ATG	2	6	162898	162903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
642	NC_012926	GAT	2	6	162993	162998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
643	NC_012926	CACCT	2	10	163022	163031	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
644	NC_012926	CTTA	2	8	163042	163049	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
645	NC_012926	CA	3	6	163076	163081	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
646	NC_012926	GTC	2	6	163132	163137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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649	NC_012926	GTTG	2	8	163280	163287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
650	NC_012926	AAC	2	6	163304	163309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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653	NC_012926	AAC	2	6	163463	163468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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661	NC_012926	TTG	2	6	163990	163995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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663	NC_012926	CT	3	6	164065	164070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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668	NC_012926	GGT	2	6	164547	164552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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670	NC_012926	TTA	2	6	164578	164583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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675	NC_012926	GCT	2	6	164763	164768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
676	NC_012926	ACA	2	6	164791	164796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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682	NC_012926	A	6	6	165018	165023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
683	NC_012926	TGA	2	6	165032	165037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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952	NC_012926	T	6	6	224988	224993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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