MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis SC84

Total Repeats: 6993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012924	T	7	7	384694	384700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_012924	TCG	2	6	384725	384730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_012924	GTTG	2	8	384828	384835	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_012924	TAG	2	6	384915	384920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_012924	TAA	2	6	385014	385019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_012924	A	6	6	386466	386471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_012924	T	6	6	386480	386485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_012924	A	6	6	386493	386498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_012924	AT	3	6	386502	386507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_012924	ATA	3	9	386511	386519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_012924	ACAA	2	8	386524	386531	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1512	NC_012924	TCAT	2	8	387514	387521	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1513	NC_012924	T	7	7	387531	387537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_012924	TTCAG	2	10	387577	387586	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1515	NC_012924	ATA	2	6	387615	387620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_012924	TTA	2	6	387634	387639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_012924	ATC	2	6	387656	387661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_012924	T	7	7	388706	388712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_012924	T	6	6	388734	388739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_012924	TGA	2	6	388848	388853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_012924	TAGCAG	2	12	388911	388922	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1522	NC_012924	GCAG	2	8	389028	389035	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1523	NC_012924	GTA	2	6	389065	389070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_012924	GAA	2	6	389116	389121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_012924	TAGA	2	8	389123	389130	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_012924	TGTGAT	2	12	389237	389248	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_012924	TGA	2	6	389311	389316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_012924	TTC	2	6	389317	389322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_012924	T	7	7	389324	389330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_012924	TAAA	2	8	391935	391942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_012924	AAAT	2	8	391997	392004	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_012924	CTT	2	6	392257	392262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_012924	ATCTT	2	10	392982	392991	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1534	NC_012924	AGA	2	6	393019	393024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_012924	CTT	2	6	395819	395824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_012924	ATA	2	6	395831	395836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_012924	T	8	8	396437	396444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_012924	ATA	2	6	396448	396453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_012924	AGT	2	6	396456	396461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_012924	GCTT	2	8	396920	396927	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1541	NC_012924	AGT	2	6	397029	397034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_012924	CGG	2	6	397082	397087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_012924	A	6	6	397163	397168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_012924	GATG	2	8	397222	397229	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_012924	GAT	2	6	397268	397273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_012924	GGT	2	6	397281	397286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_012924	TAGC	2	8	397342	397349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1548	NC_012924	A	6	6	400012	400017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_012924	GAA	2	6	400039	400044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_012924	T	6	6	400075	400080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_012924	ATTC	2	8	400244	400251	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1552	NC_012924	A	7	7	400258	400264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_012924	CTT	2	6	400327	400332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_012924	TA	3	6	400339	400344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_012924	T	7	7	400384	400390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_012924	TCC	2	6	400879	400884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_012924	TGA	2	6	400892	400897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_012924	TAT	2	6	400901	400906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_012924	A	7	7	400986	400992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_012924	AGA	2	6	402622	402627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_012924	TTGGG	2	10	402666	402675	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_012924	AGAA	2	8	403400	403407	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_012924	GA	3	6	403408	403413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_012924	ATG	2	6	403786	403791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_012924	AGG	2	6	403807	403812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_012924	AAAT	2	8	403912	403919	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_012924	T	7	7	406339	406345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_012924	A	6	6	406369	406374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_012924	AGG	2	6	408696	408701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_012924	T	7	7	411530	411536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_012924	TGA	2	6	411635	411640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_012924	TCA	2	6	411756	411761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_012924	AAACTA	2	12	411782	411793	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1574	NC_012924	TA	3	6	411792	411797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_012924	TCAG	2	8	411798	411805	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1576	NC_012924	TGGA	2	8	411823	411830	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_012924	T	6	6	411844	411849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_012924	CTT	2	6	416038	416043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_012924	TTA	2	6	416995	417000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_012924	TA	3	6	417006	417011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_012924	A	6	6	417022	417027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_012924	ATA	2	6	417030	417035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_012924	A	7	7	417037	417043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_012924	T	7	7	417714	417720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_012924	AATA	2	8	417742	417749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_012924	TAA	2	6	419737	419742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_012924	GAA	2	6	419747	419752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1589	NC_012924	ATA	2	6	420326	420331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_012924	A	6	6	420369	420374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_012924	TA	3	6	420388	420393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_012924	A	6	6	420448	420453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_012924	A	6	6	420459	420464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_012924	AGA	2	6	420546	420551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1601	NC_012924	AGA	2	6	421105	421110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_012924	AGA	2	6	421117	421122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_012924	CAG	2	6	421179	421184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_012924	AGCG	2	8	421234	421241	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1605	NC_012924	AT	3	6	421363	421368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_012924	GGA	2	6	421369	421374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_012924	CT	3	6	421394	421399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1608	NC_012924	GAA	2	6	421633	421638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_012924	GGT	2	6	421707	421712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_012924	GTC	2	6	421721	421726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_012924	TCGTG	2	10	421730	421739	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1612	NC_012924	CAT	2	6	421789	421794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_012924	TAA	2	6	421824	421829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_012924	GGA	2	6	421833	421838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_012924	ATC	2	6	421857	421862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1617	NC_012924	CGC	2	6	422023	422028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1618	NC_012924	AC	3	6	422053	422058	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1619	NC_012924	CAC	2	6	422068	422073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1620	NC_012924	AGCC	2	8	422116	422123	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1621	NC_012924	GAT	2	6	422139	422144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1623	NC_012924	TCT	2	6	422230	422235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_012924	AGG	2	6	422296	422301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1626	NC_012924	GTT	2	6	422341	422346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1628	NC_012924	ATC	2	6	422534	422539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_012924	AGT	2	6	422542	422547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1631	NC_012924	ACG	2	6	422672	422677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1633	NC_012924	TCAC	2	8	422752	422759	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_012924	TAG	2	6	422843	422848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_012924	GCGA	2	8	422851	422858	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1638	NC_012924	CTC	2	6	422888	422893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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