MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis SC84

Total Repeats: 6993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012924	TCTGC	2	10	255512	255521	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1002	NC_012924	GGAA	2	8	257125	257132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_012924	T	6	6	257142	257147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_012924	TAGT	2	8	257205	257212	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_012924	CAT	2	6	258008	258013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_012924	ACA	2	6	258029	258034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_012924	TTG	2	6	258057	258062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_012924	AAG	2	6	258107	258112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_012924	ATT	2	6	260179	260184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_012924	ATC	2	6	260233	260238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_012924	A	6	6	260321	260326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_012924	TTTAG	2	10	260327	260336	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_012924	AAT	2	6	260359	260364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_012924	T	6	6	260479	260484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_012924	GCTG	2	8	260493	260500	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1016	NC_012924	A	6	6	260508	260513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_012924	CAAA	2	8	260616	260623	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_012924	GGT	2	6	260662	260667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_012924	AGA	2	6	260814	260819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_012924	AGA	2	6	260838	260843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_012924	GA	3	6	260868	260873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_012924	GT	3	6	260927	260932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_012924	CAA	2	6	260968	260973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_012924	ATT	2	6	261002	261007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_012924	A	6	6	261059	261064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_012924	A	6	6	261111	261116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_012924	TTC	2	6	261155	261160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_012924	ATT	2	6	261184	261189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_012924	T	6	6	261274	261279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_012924	A	7	7	261287	261293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_012924	TAA	2	6	261297	261302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_012924	TGA	2	6	261303	261308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_012924	AGG	2	6	261351	261356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_012924	GGAA	2	8	261371	261378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_012924	GAA	2	6	261504	261509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_012924	CTG	3	9	261551	261559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_012924	AAT	2	6	261595	261600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_012924	TAT	2	6	261612	261617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_012924	AACCAA	2	12	261716	261727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_012924	CTGC	2	8	261745	261752	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_012924	CCA	2	6	261775	261780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_012924	ACC	2	6	261903	261908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_012924	AGC	2	6	261992	261997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_012924	CCA	2	6	262120	262125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_012924	ACC	2	6	262203	262208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_012924	AGC	2	6	262247	262252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_012924	ACC	2	6	262323	262328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_012924	CCG	2	6	262397	262402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_012924	TAA	2	6	262434	262439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_012924	GGT	2	6	262579	262584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_012924	ACA	2	6	262623	262628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_012924	AGA	2	6	262638	262643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_012924	TA	3	6	262866	262871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_012924	ATCT	2	8	262950	262957	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_012924	ATTT	2	8	263027	263034	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_012924	A	6	6	263074	263079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_012924	TGT	2	6	263114	263119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_012924	TCC	2	6	263477	263482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_012924	T	6	6	263563	263568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_012924	GTAAA	2	10	263569	263578	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_012924	T	7	7	263592	263598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_012924	T	6	6	263602	263607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_012924	AGG	2	6	263638	263643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_012924	GAA	2	6	263696	263701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_012924	GCT	2	6	265034	265039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_012924	TTTTA	2	10	265043	265052	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_012924	A	6	6	265059	265064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_012924	CTT	2	6	265083	265088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_012924	CCT	2	6	266141	266146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_012924	GTT	2	6	266187	266192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_012924	AGG	2	6	266242	266247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_012924	TAC	2	6	266284	266289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_012924	A	7	7	266299	266305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_012924	AGAA	2	8	266356	266363	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_012924	CAAA	2	8	266404	266411	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1076	NC_012924	CAAAA	2	10	266463	266472	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1077	NC_012924	A	6	6	266476	266481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_012924	A	6	6	266486	266491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_012924	AAATA	2	10	266510	266519	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_012924	A	6	6	266519	266524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_012924	TAG	2	6	266525	266530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_012924	GGA	2	6	266575	266580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_012924	TAGG	2	8	269389	269396	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_012924	AGT	2	6	269397	269402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_012924	TTGT	2	8	269494	269501	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_012924	TGG	2	6	269512	269517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_012924	TCTA	2	8	269579	269586	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1088	NC_012924	TAGAA	2	10	269615	269624	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_012924	A	6	6	269623	269628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_012924	T	6	6	269633	269638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_012924	ATTT	2	8	271141	271148	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_012924	GTTT	2	8	271174	271181	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_012924	TTAAA	2	10	271194	271203	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_012924	TA	3	6	271233	271238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_012924	TA	3	6	278645	278650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_012924	AAC	2	6	278674	278679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_012924	GT	3	6	278733	278738	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_012924	TAG	2	6	278765	278770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_012924	AG	3	6	282935	282940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_012924	CAA	2	6	282963	282968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_012924	A	6	6	282980	282985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_012924	AAAG	2	8	286528	286535	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_012924	CAAC	2	8	286551	286558	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_012924	ATA	2	6	286561	286566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_012924	TAGAAA	2	12	286599	286610	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_012924	TAGCCG	2	12	286638	286649	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_012924	AGA	2	6	286653	286658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_012924	AT	3	6	286737	286742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_012924	AGA	2	6	286751	286756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_012924	GA	3	6	287034	287039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_012924	T	6	6	288413	288418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_012924	GGA	2	6	289166	289171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_012924	T	8	8	289180	289187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_012924	CCA	2	6	289196	289201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_012924	T	6	6	289251	289256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_012924	T	6	6	289279	289284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_012924	A	6	6	291048	291053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_012924	TTC	2	6	292963	292968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_012924	CTC	2	6	292986	292991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_012924	GCCTA	2	10	293022	293031	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1121	NC_012924	T	6	6	293073	293078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_012924	ATT	2	6	293126	293131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_012924	TAA	2	6	293135	293140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_012924	GAAAG	2	10	293207	293216	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_012924	TAT	2	6	293256	293261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_012924	TG	3	6	293294	293299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_012924	ACT	2	6	294553	294558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_012924	CTTT	2	8	294698	294705	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1129	NC_012924	A	6	6	294711	294716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_012924	T	6	6	297089	297094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_012924	ATT	2	6	297102	297107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_012924	TGG	2	6	297144	297149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_012924	A	6	6	297167	297172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_012924	GTCA	2	8	298118	298125	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1135	NC_012924	GGTT	2	8	298847	298854	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_012924	ATG	2	6	298910	298915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_012924	T	6	6	298929	298934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_012924	T	6	6	298948	298953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_012924	ATT	3	9	299713	299721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1278	NC_012924	AG	3	6	328917	328922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1396	NC_012924	ATA	2	6	344942	344947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1398	NC_012924	ATC	2	6	344957	344962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1405	NC_012924	T	6	6	351191	351196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1406	NC_012924	A	6	6	351209	351214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1407	NC_012924	AAAT	2	8	351877	351884	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1408	NC_012924	TAA	2	6	351892	351897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1409	NC_012924	GTTT	2	8	351931	351938	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_012924	AT	3	6	351956	351961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1411	NC_012924	TGTT	2	8	352021	352028	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1414	NC_012924	CATTA	2	10	352513	352522	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1415	NC_012924	A	6	6	352605	352610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1416	NC_012924	GAC	2	6	352618	352623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1417	NC_012924	GTT	2	6	354285	354290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_012924	TTGAT	2	10	354294	354303	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_012924	ATCTGC	2	12	354317	354328	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1420	NC_012924	TCT	2	6	354413	354418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1421	NC_012924	TAA	2	6	354523	354528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_012924	GAT	2	6	356071	356076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1424	NC_012924	TGA	2	6	356196	356201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1425	NC_012924	GAG	2	6	356239	356244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1426	NC_012924	TA	3	6	356294	356299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1427	NC_012924	GA	3	6	356300	356305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1428	NC_012924	CAA	2	6	356348	356353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1429	NC_012924	GTT	2	6	356367	356372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1431	NC_012924	GT	3	6	356502	356507	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_012924	GGT	2	6	356617	356622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_012924	TTGA	2	8	356633	356640	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_012924	TGA	2	6	356644	356649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_012924	CAG	2	6	356657	356662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1437	NC_012924	GGC	2	6	356719	356724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1439	NC_012924	GAA	3	9	356849	356857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1440	NC_012924	GGA	2	6	356943	356948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1443	NC_012924	AGGAAA	2	12	357177	357188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1445	NC_012924	ACG	2	6	357293	357298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1446	NC_012924	TTGA	2	8	357332	357339	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1447	NC_012924	AG	3	6	357827	357832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1449	NC_012924	TGA	2	6	357855	357860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1451	NC_012924	A	6	6	357869	357874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_012924	AGAT	2	8	357880	357887	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1456	NC_012924	AT	3	6	358887	358892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1457	NC_012924	A	6	6	363003	363008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1458	NC_012924	GAG	2	6	364195	364200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1475	NC_012924	T	6	6	374747	374752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1476	NC_012924	T	7	7	374804	374810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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