MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis SC84

Total Repeats: 6993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_012924	ATT	2	6	114491	114496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_012924	TC	4	8	118160	118167	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
504	NC_012924	GAAA	2	8	118194	118201	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
505	NC_012924	AT	4	8	118204	118211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_012924	TCC	2	6	118849	118854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_012924	TCG	2	6	118954	118959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_012924	CCT	2	6	118967	118972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_012924	AT	3	6	118984	118989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_012924	GTCTG	2	10	118992	119001	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
511	NC_012924	CAGT	2	8	119018	119025	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
512	NC_012924	CCA	2	6	119040	119045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_012924	GGCCT	2	10	119060	119069	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
514	NC_012924	GGTA	2	8	119118	119125	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_012924	GTCAA	2	10	119157	119166	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
516	NC_012924	GCT	2	6	119234	119239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_012924	ACC	2	6	119387	119392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_012924	CGAC	2	8	119413	119420	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
519	NC_012924	GCT	2	6	119433	119438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_012924	AAT	2	6	119494	119499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_012924	AG	3	6	119510	119515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
522	NC_012924	GGC	2	6	119546	119551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_012924	ACC	2	6	119567	119572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_012924	AGA	2	6	119585	119590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_012924	T	7	7	119621	119627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_012924	T	6	6	119630	119635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_012924	T	6	6	119653	119658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_012924	ATT	2	6	119659	119664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_012924	A	6	6	119670	119675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_012924	GAG	2	6	119713	119718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_012924	AACT	2	8	125620	125627	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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533	NC_012924	GT	3	6	125708	125713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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536	NC_012924	T	6	6	125906	125911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_012924	T	6	6	125924	125929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_012924	AG	3	6	126525	126530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
539	NC_012924	A	8	8	127794	127801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_012924	CATGA	2	10	128913	128922	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
541	NC_012924	TAC	2	6	128924	128929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_012924	AG	3	6	129054	129059	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_012924	TTA	2	6	129110	129115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_012924	TTTG	2	8	129238	129245	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
545	NC_012924	CAA	2	6	129256	129261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_012924	TTG	2	6	129371	129376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_012924	CAA	2	6	129478	129483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_012924	TTG	2	6	129498	129503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_012924	TCTA	2	8	129611	129618	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
550	NC_012924	GTG	2	6	129638	129643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_012924	GAAAG	2	10	130352	130361	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
552	NC_012924	AGA	2	6	131968	131973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_012924	AGG	2	6	132817	132822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_012924	CTATA	2	10	133270	133279	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
555	NC_012924	CGA	2	6	133318	133323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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558	NC_012924	T	7	7	135735	135741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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561	NC_012924	A	6	6	135908	135913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_012924	TA	3	6	135914	135919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_012924	TAAGAT	2	12	136948	136959	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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566	NC_012924	T	6	6	137145	137150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_012924	TA	3	6	142699	142704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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610	NC_012924	T	6	6	145903	145908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_012924	TTTG	2	8	145919	145926	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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621	NC_012924	GTA	2	6	150566	150571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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623	NC_012924	A	6	6	150602	150607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_012924	GTCT	2	8	150623	150630	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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642	NC_012924	TGA	2	6	159784	159789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
643	NC_012924	GA	3	6	159891	159896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
644	NC_012924	TTC	2	6	159901	159906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
645	NC_012924	CAT	2	6	162003	162008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
646	NC_012924	AAC	2	6	162086	162091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
647	NC_012924	TAGT	2	8	162099	162106	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
648	NC_012924	AATTG	2	10	162121	162130	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
649	NC_012924	TA	3	6	162171	162176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
650	NC_012924	A	7	7	162205	162211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
651	NC_012924	T	6	6	162228	162233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
652	NC_012924	TA	3	6	162289	162294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
653	NC_012924	ATAA	2	8	162326	162333	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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656	NC_012924	AGG	2	6	162433	162438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
657	NC_012924	AAC	2	6	162472	162477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
658	NC_012924	TTTTC	2	10	162480	162489	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
659	NC_012924	GAG	2	6	162541	162546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
660	NC_012924	TGT	2	6	162563	162568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
661	NC_012924	GAA	3	9	162645	162653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
662	NC_012924	ATA	2	6	162820	162825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
663	NC_012924	AGA	2	6	162878	162883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
664	NC_012924	ATG	2	6	162919	162924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
665	NC_012924	GAT	2	6	163014	163019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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668	NC_012924	CA	3	6	163097	163102	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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672	NC_012924	GTTG	2	8	163301	163308	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
673	NC_012924	AAC	2	6	163325	163330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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676	NC_012924	AAC	2	6	163484	163489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
677	NC_012924	GCA	2	6	163635	163640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
678	NC_012924	ATG	2	6	163744	163749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
679	NC_012924	ACTGAT	2	12	163761	163772	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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681	NC_012924	TTG	2	6	163795	163800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
682	NC_012924	AT	3	6	163802	163807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
683	NC_012924	CTTA	2	8	163866	163873	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
684	NC_012924	TTG	2	6	164011	164016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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686	NC_012924	CT	3	6	164086	164091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
687	NC_012924	ATC	2	6	164126	164131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
688	NC_012924	TTG	2	6	164326	164331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
689	NC_012924	AGA	2	6	164441	164446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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691	NC_012924	GGT	2	6	164568	164573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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693	NC_012924	TTA	2	6	164599	164604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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699	NC_012924	ACA	2	6	164812	164817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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702	NC_012924	ATG	2	6	164872	164877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
703	NC_012924	GCT	2	6	165047	165052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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762	NC_012924	A	6	6	182075	182080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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766	NC_012924	ATA	2	6	183847	183852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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769	NC_012924	TGATTT	2	12	184090	184101	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
770	NC_012924	T	6	6	186391	186396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
771	NC_012924	ATA	2	6	186400	186405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
772	NC_012924	TAT	2	6	186418	186423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
773	NC_012924	TA	4	8	186459	186466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
774	NC_012924	ACG	2	6	186485	186490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
775	NC_012924	ATG	2	6	186508	186513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
776	NC_012924	GAG	2	6	186544	186549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
777	NC_012924	T	7	7	187363	187369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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779	NC_012924	T	6	6	187491	187496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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921	NC_012924	TGA	2	6	223681	223686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
922	NC_012924	T	6	6	226789	226794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
923	NC_012924	C	6	6	226824	226829	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
924	NC_012924	TCC	2	6	226833	226838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
925	NC_012924	T	6	6	226863	226868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
926	NC_012924	T	9	9	226934	226942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
927	NC_012924	TAG	2	6	226955	226960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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929	NC_012924	ACT	2	6	227325	227330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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931	NC_012924	ACTT	2	8	227349	227356	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
932	NC_012924	ATT	2	6	227362	227367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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935	NC_012924	TAA	2	6	227528	227533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
936	NC_012924	AAG	2	6	229120	229125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
937	NC_012924	GAT	2	6	230142	230147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
938	NC_012924	ATA	2	6	230154	230159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
939	NC_012924	TA	3	6	230163	230168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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942	NC_012924	ATAAA	2	10	231137	231146	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
943	NC_012924	A	6	6	231144	231149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
944	NC_012924	AACG	2	8	231158	231165	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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949	NC_012924	TAAAA	2	10	236022	236031	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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951	NC_012924	GA	3	6	236102	236107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
952	NC_012924	AGG	2	6	236290	236295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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954	NC_012924	CAAA	2	8	238561	238568	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
955	NC_012924	TAT	2	6	238597	238602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
956	NC_012924	AAG	2	6	238603	238608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
957	NC_012924	TAT	2	6	239352	239357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
958	NC_012924	T	6	6	240744	240749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
959	NC_012924	TTA	2	6	240752	240757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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961	NC_012924	ATT	2	6	240787	240792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
962	NC_012924	AGA	2	6	240818	240823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
963	NC_012924	A	7	7	240838	240844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
964	NC_012924	TAA	2	6	240846	240851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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967	NC_012924	GTTT	2	8	240898	240905	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
968	NC_012924	AAGA	2	8	240920	240927	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
969	NC_012924	GGA	2	6	240939	240944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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971	NC_012924	AAG	2	6	241910	241915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
972	NC_012924	GGAAT	2	10	242019	242028	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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974	NC_012924	T	6	6	242079	242084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
975	NC_012924	GAA	2	6	242143	242148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
976	NC_012924	T	6	6	242153	242158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
977	NC_012924	CTG	2	6	242165	242170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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986	NC_012924	TA	3	6	252332	252337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
987	NC_012924	AAAT	2	8	252356	252363	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
988	NC_012924	ATAA	2	8	252385	252392	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
989	NC_012924	AAT	2	6	252457	252462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1000	NC_012924	TA	3	6	255500	255505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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