MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis BM407 plasmid pBM407

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012923	TTG	2	6	945	950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012923	AAG	2	6	967	972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012923	AGT	2	6	2377	2382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012923	ACT	2	6	2398	2403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012923	TTA	2	6	2533	2538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012923	TAA	2	6	2554	2559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012923	TCC	2	6	3350	3355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_012923	TAT	2	6	3369	3374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012923	TAG	2	6	3389	3394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012923	TTG	2	6	3564	3569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012923	ATG	2	6	3570	3575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012923	TCC	2	6	3719	3724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_012923	TCT	2	6	4040	4045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012923	CCT	2	6	4409	4414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_012923	TCA	2	6	4483	4488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012923	TAA	2	6	4537	4542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012923	ATA	2	6	4564	4569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012923	TAT	2	6	4599	4604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012923	AAC	2	6	4607	4612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012923	ATC	2	6	4639	4644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012923	CTC	2	6	4706	4711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_012923	TCA	2	6	4716	4721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_012923	AAT	2	6	4900	4905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012923	AGA	2	6	4911	4916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012923	ACA	2	6	4960	4965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012923	TCG	2	6	7257	7262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012923	ACT	2	6	7286	7291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012923	AGT	2	6	7386	7391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012923	ATT	2	6	7581	7586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012923	ATC	2	6	7601	7606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012923	TTA	2	6	7684	7689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012923	ATA	2	6	7867	7872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012923	ATT	2	6	7900	7905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012923	CCA	2	6	7947	7952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_012923	ACC	2	6	7994	7999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_012923	TTC	2	6	8015	8020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012923	CTT	2	6	8029	8034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012923	CTT	2	6	8068	8073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012923	ATT	2	6	8074	8079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012923	GAT	2	6	8131	8136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012923	CTG	2	6	8150	8155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_012923	GCT	2	6	8274	8279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_012923	TAT	2	6	8399	8404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012923	AAC	2	6	8481	8486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012923	CAC	2	6	8676	8681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_012923	ATC	2	6	8690	8695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012923	AAT	2	6	8944	8949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012923	GCA	2	6	8956	8961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012923	TGC	2	6	8990	8995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012923	GCT	2	6	9049	9054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012923	TTC	2	6	9058	9063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012923	TCC	2	6	9098	9103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_012923	GCA	2	6	9108	9113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012923	AAT	2	6	9120	9125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012923	TCA	2	6	9186	9191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012923	AAT	2	6	9255	9260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012923	ATA	2	6	9270	9275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012923	TAA	2	6	9353	9358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012923	GCA	2	6	9437	9442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012923	CCT	2	6	9458	9463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_012923	CAG	2	6	9486	9491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012923	ACA	3	9	9521	9529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012923	TCA	2	6	9552	9557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012923	TTC	3	9	9559	9567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_012923	TAT	2	6	9640	9645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012923	AAC	2	6	9722	9727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012923	CTT	2	6	9887	9892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012923	ATA	2	6	10275	10280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012923	TGT	2	6	10337	10342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012923	ATA	2	6	10364	10369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012923	ATT	2	6	10375	10380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012923	ACC	2	6	10454	10459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_012923	CAT	2	6	10469	10474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012923	CAT	2	6	10660	10665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_012923	TCT	2	6	10728	10733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012923	TCC	2	6	10821	10826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_012923	TCC	2	6	10983	10988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_012923	CTT	2	6	11141	11146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012923	TTC	2	6	11465	11470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012923	ATT	2	6	11489	11494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012923	CCT	2	6	11504	11509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_012923	CCA	2	6	11536	11541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_012923	CCA	2	6	11560	11565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_012923	CCA	2	6	11593	11598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_012923	CAT	2	6	11607	11612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_012923	CTT	2	6	11826	11831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_012923	ATT	2	6	12766	12771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012923	ATT	2	6	12822	12827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012923	TCC	2	6	14709	14714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_012923	TAT	2	6	14728	14733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012923	TAG	2	6	14748	14753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012923	TAA	2	6	14868	14873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012923	AGT	2	6	21941	21946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012923	ACG	3	9	22109	22117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012923	GTT	2	6	22263	22268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012923	TTA	2	6	22272	22277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012923	CTT	2	6	22309	22314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012923	CTT	2	6	22399	22404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012923	CTT	2	6	22537	22542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_012923	GCG	2	6	22543	22548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_012923	TCA	2	6	22566	22571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_012923	TGT	2	6	22723	22728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012923	TCT	2	6	22800	22805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_012923	AAC	3	9	22817	22825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_012923	CTT	2	6	22945	22950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_012923	TCA	2	6	22974	22979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012923	TGG	2	6	23051	23056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012923	TGA	2	6	23389	23394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012923	GTA	2	6	23418	23423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012923	TAT	2	6	24299	24304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012923	TAG	2	6	24319	24324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.