MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis GGS_124 chromosome 1

Total Repeats: 338

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012891	TAAAC	2	10	18376	18385	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_012891	AATCA	2	10	18559	18568	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_012891	TCGTG	2	10	20628	20637	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_012891	GTTAA	2	10	21390	21399	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012891	GGGAG	2	10	21909	21918	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012891	AGGGA	2	10	24120	24129	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012891	GCTTA	2	10	24494	24503	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_012891	TTAAT	2	10	25131	25140	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012891	TAAAA	2	10	26403	26412	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012891	GTTCT	2	10	28338	28347	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_012891	ATGAA	2	10	30504	30513	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012891	TCGTT	2	10	44823	44832	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_012891	AAGGA	2	10	69479	69488	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012891	AGCAT	2	10	70256	70265	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_012891	GTTTC	2	10	76804	76813	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_012891	ACTTG	2	10	80633	80642	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_012891	TCGTG	2	10	82033	82042	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_012891	GTTAA	2	10	82794	82803	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012891	GGGAG	2	10	83313	83322	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012891	AGGGA	2	10	85525	85534	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012891	GCTTA	2	10	85899	85908	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_012891	TATAT	2	10	86260	86269	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012891	ATATT	2	10	86880	86889	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012891	TTGGA	2	10	87148	87157	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012891	TCTGC	2	10	90013	90022	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_012891	TGATA	2	10	115854	115863	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012891	ACTAT	2	10	118335	118344	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_012891	TTAAG	2	10	127062	127071	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012891	AAAGA	2	10	143620	143629	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012891	CTTTT	2	10	147682	147691	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_012891	TTTAT	2	10	168645	168654	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012891	AGTAT	2	10	170414	170423	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012891	ACTTG	2	10	170556	170565	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_012891	ACTTG	2	10	171734	171743	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_012891	TAAGT	2	10	175176	175185	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012891	AAGTA	2	10	175318	175327	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012891	ATAAA	2	10	177492	177501	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012891	TTAAA	2	10	179688	179697	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012891	TTAAG	2	10	195183	195192	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012891	TCAAA	2	10	201740	201749	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_012891	TGAAG	2	10	202552	202561	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012891	CCTTT	2	10	204617	204626	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_012891	AAGTT	2	10	210994	211003	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012891	AACTG	2	10	211243	211252	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_012891	GCTGT	2	10	219137	219146	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_012891	CTGAC	2	10	220026	220035	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_012891	CTTGC	2	10	220058	220067	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_012891	CTTTT	2	10	230801	230810	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_012891	ACTTG	2	10	253056	253065	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_012891	TTTAT	2	10	263018	263027	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012891	TTCTT	2	10	268464	268473	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_012891	AAACT	2	10	268548	268557	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_012891	GCAAT	2	10	272292	272301	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_012891	ATTGA	2	10	273482	273491	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012891	TCGTG	2	10	283609	283618	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_012891	GTTAA	2	10	284370	284379	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012891	GGGAG	2	10	284889	284898	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012891	AGGGA	2	10	287100	287109	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012891	AAAAG	2	10	287789	287798	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012891	AAACT	2	10	289946	289955	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_012891	CATAT	2	10	307422	307431	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_012891	ACTTG	2	10	308827	308836	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_012891	AATGA	2	10	318298	318307	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012891	TCGTG	2	10	337615	337624	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_012891	GTTAA	2	10	338376	338385	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012891	GGGAG	2	10	338895	338904	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012891	AGGGA	2	10	341106	341115	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012891	AAAAG	2	10	341795	341804	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012891	AAGCG	2	10	342183	342192	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_012891	CTAAA	2	10	356441	356450	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_012891	ATAGA	2	10	357471	357480	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012891	ATTAT	2	10	363166	363175	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012891	AGGAG	2	10	369133	369142	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012891	ATAGA	2	10	372421	372430	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012891	TGCTA	2	10	396326	396335	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_012891	CAGGG	2	10	396346	396355	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
77	NC_012891	TATTC	2	10	406588	406597	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_012891	GATTT	2	10	407556	407565	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012891	ACTAA	2	10	412738	412747	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_012891	TGATT	2	10	412766	412775	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012891	GAAAA	2	10	432527	432536	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012891	TAAAA	2	10	432675	432684	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012891	AGGAT	2	10	451705	451714	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012891	TGAGA	2	10	456353	456362	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012891	TTGAT	2	10	456376	456385	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012891	GTTTT	2	10	461056	461065	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012891	TTATA	2	10	461806	461815	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012891	GTCAA	2	10	468530	468539	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_012891	AAATC	2	10	470330	470339	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_012891	AAGGA	2	10	481371	481380	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012891	GATAG	2	10	481405	481414	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012891	GACTT	2	10	482442	482451	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_012891	GATTA	2	10	482502	482511	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012891	TATAT	2	10	484198	484207	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012891	TGGTA	2	10	486057	486066	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012891	ACTTG	2	10	493887	493896	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_012891	TAGAG	2	10	495327	495336	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012891	TAGGC	2	10	499884	499893	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_012891	GCTTG	2	10	506013	506022	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_012891	TTACA	2	10	510782	510791	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_012891	GTAAT	2	10	513428	513437	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012891	TAAAA	2	10	540956	540965	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012891	TTATT	2	10	546956	546965	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012891	ATAAA	2	10	559581	559590	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012891	CCTTA	2	10	566698	566707	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_012891	TCCTT	2	10	573468	573477	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_012891	TTTCC	2	10	580540	580549	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_012891	AAAAT	2	10	580623	580632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012891	AGAAA	2	10	580678	580687	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012891	TATAT	2	10	584069	584078	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012891	TATAA	2	10	586234	586243	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012891	GGAAT	2	10	605614	605623	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012891	ATAGA	2	10	607345	607354	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012891	TTATT	2	10	626361	626370	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012891	CTAAA	2	10	630683	630692	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_012891	ATAAA	2	10	631960	631969	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012891	TGATA	2	10	645163	645172	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012891	CATCT	2	10	652171	652180	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_012891	CTTAA	2	10	652262	652271	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_012891	TTGAG	2	10	656738	656747	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012891	ACTTG	2	10	659524	659533	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_012891	TAAAA	2	10	663093	663102	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012891	CTTGT	2	10	673092	673101	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_012891	AAGGT	2	10	673685	673694	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012891	TCTTT	2	10	675355	675364	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_012891	GAATA	2	10	699578	699587	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012891	AGGGA	2	10	706047	706056	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012891	TATCT	2	10	708070	708079	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_012891	ATAGA	2	10	709071	709080	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012891	TATAA	2	10	716797	716806	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012891	CGCTC	2	10	725067	725076	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
132	NC_012891	TATGA	2	10	757945	757954	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012891	ACTTG	2	10	766853	766862	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_012891	ATTTA	2	10	767719	767728	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012891	GTCTT	2	10	771371	771380	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_012891	AAAAT	2	10	771407	771416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012891	AAAAG	2	10	775489	775498	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012891	AGAGG	2	10	775612	775621	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012891	AAAAG	2	10	784859	784868	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012891	CAAGT	2	10	810282	810291	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_012891	AATCT	2	10	823891	823900	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_012891	CAAAT	2	10	823958	823967	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_012891	ACTTG	2	10	826512	826521	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_012891	AGAAA	2	10	829112	829121	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012891	GTCAA	2	10	833646	833655	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_012891	TTGAC	2	10	838547	838556	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_012891	TCATG	2	10	838564	838573	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_012891	AATCA	2	10	843356	843365	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_012891	ACTTG	2	10	843622	843631	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
150	NC_012891	AAAGG	2	10	881378	881387	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012891	ATAGA	2	10	886115	886124	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012891	TTATT	2	10	906311	906320	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012891	TGGTA	2	10	908490	908499	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012891	GAAAG	2	10	911783	911792	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_012891	AACAG	2	10	916920	916929	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
157	NC_012891	GAAAG	2	10	930861	930870	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
158	NC_012891	ATAAA	2	10	931135	931144	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_012891	TATAA	2	10	935174	935183	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_012891	ATAAA	2	10	946582	946591	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_012891	AAGTT	2	10	946725	946734	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
164	NC_012891	TGAAT	2	10	953656	953665	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
165	NC_012891	CACGA	2	10	953725	953734	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
166	NC_012891	TAAGG	2	10	953999	954008	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
167	NC_012891	ATGAT	2	10	963738	963747	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
168	NC_012891	AAATG	2	10	973574	973583	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
169	NC_012891	CCATA	2	10	978181	978190	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
170	NC_012891	CAACT	2	10	981669	981678	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
171	NC_012891	ACAAG	2	10	988791	988800	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
172	NC_012891	TATAT	2	10	993842	993851	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_012891	AATAA	2	10	999057	999066	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_012891	TTATT	2	10	1010851	1010860	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_012891	CTTTC	2	10	1017501	1017510	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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179	NC_012891	TTCTA	2	10	1035397	1035406	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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182	NC_012891	TCTTT	2	10	1056244	1056253	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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184	NC_012891	AAGTA	2	10	1059289	1059298	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
185	NC_012891	GGCAA	2	10	1062593	1062602	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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189	NC_012891	TTTTA	2	10	1095839	1095848	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_012891	CTTTC	2	10	1108323	1108332	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
192	NC_012891	TATTC	2	10	1114126	1114135	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
193	NC_012891	AAAAG	2	10	1117417	1117426	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
194	NC_012891	TTATA	2	10	1119645	1119654	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_012891	TACTA	2	10	1159437	1159446	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
196	NC_012891	GCATC	2	10	1163717	1163726	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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282	NC_012891	TCATT	2	10	1797505	1797514	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
283	NC_012891	TTATA	2	10	1810541	1810550	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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328	NC_012891	ATGAA	2	10	2048338	2048347	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
329	NC_012891	TTATA	2	10	2057559	2057568	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
330	NC_012891	GTTTC	2	10	2060436	2060445	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
331	NC_012891	AACCA	2	10	2078365	2078374	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
332	NC_012891	ATCTC	2	10	2093080	2093089	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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334	NC_012891	TATCA	2	10	2094835	2094844	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
335	NC_012891	CAATA	2	10	2101821	2101830	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
336	NC_012891	TTTCT	2	10	2101864	2101873	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
337	NC_012891	AAAAG	2	10	2104135	2104144	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
338	NC_012891	CTTTT	2	10	2104166	2104175	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.